Job Description P0C7L2 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:30:04 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 299 % Identity 25% Template c2ix4B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase; PDBTitle: arabidopsis thaliana mitochondrial beta-ketoacyl acp2 synthase hexanoic acid complex Resolution 1.95 Å

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		2	.	.	.	.	.	.		.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.
Predicted Secondary structure									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	A	F	I	C	D	.	G	I	R	T	P	I	G	R	Y	G	G	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	V	V	V	T	G	L	G	M	V	T	P	L	G	R	G	V	E	T	T	W	R	R	L	I	D	G	E	C	G	I	R	G	L	T	L	D	D	L	K	M	K	S	F	D	E	E	T	K	L	Y	T	F	D	Q	L	S	S	K	V	A	A	F	V	P	Y	G	S	N	P	G	E	F	D	E	A	L	W	L
Template Known Secondary structure														T	T			S										T	T									S	G	G	G			T	T	S													S									B	S	S	S	T	T	S	B						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
					22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.						50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60																										.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																													.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																													.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	S	S	V	R	A	D	D	L	A	A	I	P	L	R	E	L	L	V	R	N	P	R	L	D	A	E	C	I	.	.	.	.	.	D	D	V	I	L	G	C	A	N	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	D	N	R	N	V	A
Query Conservation		.	.	.																													.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																			.										.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.
Template Sequence		N	S	K	A	V	A	N	F	I	G	Y	A	V	C	A	A	D	E	A	L	R	.	D	A	E	W	L	P	T	E	E	E	E	K	E	R	T	G	V	S	I	G	G	G	I	G	S	I	C	D	I	V	E	A	A	Q	L	I	C	E	K	R	L	R	R	L	S	P	F	F	I	P	K	I	L	V	N	M	A	S
Template Known Secondary structure			S	T	T																		.		T	T					S						T								S	S															T	T		G	G	G			T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	M	A	T	L	L	A	G	L	P	Q	S	V	S	G	T	T	I	N	R	L	C	G	S	G	L	D	A	L	G	F	A	A	R	A	I	K	A	G	D	G	D	L	L	I	A	G	G	V	E	S	M	S	R	A	P	F	V	M	G	K	A	A	S	A	F	S	R	Q	A	E	M	F	D	T	T	I	G	W	R
Query Conservation
Alig confidence											.	.																																																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.																																																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	H	V	S	M	K	Y	G	F	.	.	Q	G	P	N	H	A	A	V	T	A	C	A	T	G	A	H	S	I	G	D	A	T	R	M	I	Q	F	G	D	A	D	V	M	V	A	G	G	T	E	S	S	I	D	A	L	S	V	A	G	F	S	R	S	R	A	L	S	T	K	F	N	S	S	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T		.	.		S								G	G	G																T	S		S												S										T	T		B			T	T	T	T	S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.																																																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.			.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	N	P	L	M	A	Q	Q	F	G	T	D	S	M	P	E	T	A	E	N	V	A	E	L	L	K	I	S	R	E	D	Q	D	S	F	A	L	R	S	Q	Q	R	T	A	K	A	Q	S	S	G	I	L	A	E	E	I	V	P	V	V	L	K	N	K	K	G	V	V	T	E	I	Q	H	D	E	H	L	R	P
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290						.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		E	T	T	L	E	Q	L	R	G	L	K	A	P	F	R	A	N	G	V	I	T	A	G	N	A	S	G	V	N	D	G	A	A	A	L	I	I	A	S	E	Q	M	A	A	A	Q	G	L	T	P	R	A	R	I	V	A	M	A	T	A	G	V	.	.	.	.	.	E	P	R	L	M	G	L	G	P	V	P	A	T
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	E	A	S	R	P	F	D	C	D	R	D	G	F	V	I	G	E	G	S	G	V	I	V	L	E	E	Y	E	H	A	K	R	R	G	A	K	I	Y	A	E	L	C	G	Y	G	M	S	G	D	A	H	H	I	T	Q	P	P	E	D	G	K	G	A	V	L	A	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S			T	T	B	T	T			S	B		B	B																	T	T																	S		S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.						330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.																										.																						.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.																										.																						.	.
Query Sequence		R	R	V	L	E	R	A	G	L	S	I	H	D	M	D	V	I	E	L	N	E	A	F	A	A	Q	.	.	.	.	.	A	L	G	V	L	R	E	L	G	L	P	D	D	A	P	H	V	N	P	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	L	G	M	S	G	A	R	L	A	L	A	A	S	H	E	L	H	.	.
Query Conservation																												.	.	.	.	.																										.																						.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.																		.								.																						.	.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		T	R	A	L	R	Q	S	G	L	C	P	N	Q	I	D	Y	V	N	A	H	A	T	S	T	P	I	G	D	A	V	E	A	R	A	I	K	T	V	F	S	E	H	A	T	S	G	T	L	.	A	F	S	S	T	K	G	A	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	A	I	F	S	I	L	A	I	H	H	G
Template Known Secondary structure									T			G	G	G										S																						T	S		S	.					T						B		G	G	G																T
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																												376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	N	G	R	Y	A	L	C	T	M	C	I	G	V	G	Q	G	I	A	M	I	L	E	R	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	P	M	T	L	N	V	K	N	P	D	P	I	F	D	K	R	F	M	P	L	T	T	S	K	K	M	L	V	R	T	A	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	S	L	L	F	A	S	I
Template Known Secondary structure							S			S	S	B		T	T		B	T	T	B					S							S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.