Job Description P0C7L2 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:30:04 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 296 % Identity 23% Template c2iwyB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase; PDBTitle: human mitochondrial beta-ketoacyl acp synthase Resolution 2.06 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.		.	.	.	.	.		.	10	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	E	.	A	F	I	C	D	.	G	I	R	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	R	Y	G	G	A	L	S	S	V	R	A	D	D	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		L	H	R	R	V	V	I	T	G	I	G	L	V	T	P	L	G	V	G	T	H	L	V	W	D	R	L	I	G	G	E	S	G	I	V	S	L	V	G	E	E	Y	K	S	I	P	C	S	V	A	A	Y	V	P	R	G	S	D	E	G	Q	F	N	E	Q	N	F	.	V	S	K	S	D	I	K	S	M	S	S	P
Template Known Secondary structure																T	T			S										T	T									S	G	G	G	T	T		S									B	S	S	S	T	T		B		G	G	G	T	.	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.		.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
				29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50						.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																							.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																							.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	L	A	A	I	P	L	R	E	L	L	V	R	N	P	R	L	D	A	E	C	I	D	.	.	.	.	.	D	V	I	L	G	C	A	N	Q	A	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	R	N	V	A	R	M	A	T	L	L	A	G
Query Conservation		.	.																							.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.												.											.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.
Template Sequence		T	I	M	A	I	G	A	A	E	L	A	M	K	.	D	S	G	W	H	P	Q	S	E	A	D	Q	V	A	T	G	V	A	I	G	M	G	M	I	P	L	E	V	V	S	E	T	A	L	N	F	Q	T	K	G	Y	N	K	V	S	P	F	F	V	P	K	I	L	V	N	M	A	A	G	Q	V	S	I	R	Y	K
Template Known Secondary structure															.			T					S						T								S																			G	G	G	S		T	T							T	T											T
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	Q	S	V	S	G	T	T	I	N	R	L	C	G	S	G	L	D	A	L	G	F	A	A	R	A	I	K	A	G	D	G	D	L	L	I	A	G	G	V	E	S	M	S	R	A	P	F	V	M	G	K	A	A	S	A	F	S	R	Q	A	E	M	F	D	T	T	I	G	W	R	F	V	N	P	L	M	A	Q
Query Conservation
Alig confidence			.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	.	.	K	G	P	N	H	A	V	S	T	A	C	T	T	G	A	H	A	V	G	D	S	F	R	F	I	A	H	G	D	A	D	V	M	V	A	G	G	T	D	S	C	I	S	P	L	S	L	A	G	F	S	R	A	R	A	L	S	T	N	S	D	P	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.	.		S								G	G	G																T	S		S												S										T	T		B				S		T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198			.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	G	T	D	S	M	P	E	T	A	E	N	V	A	E	L	L	K	I	S	R	E	D	Q	D	S	F	A	L	R	S	Q	Q	R	T	A	K	A	Q	S	S	G	I	L	A	E	E	I	V	P	V	V	L	K	N	K	K	G	V	V	T	E	I	Q	H	D	E	H	L	R	P	E	T	T	L	E	Q	L	R
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290						.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.
Query Sequence		G	L	K	A	P	F	R	A	N	G	V	I	T	A	G	N	A	S	G	V	N	D	G	A	A	A	L	I	I	A	S	E	Q	M	A	A	A	Q	G	L	T	P	R	A	R	I	V	A	M	A	T	A	G	V	.	.	.	.	.	E	P	R	L	M	G	L	G	P	V	P	A	T	R	R	V	L	E	R	A	G
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	A	C	R	P	F	H	P	K	R	D	G	F	V	M	G	E	G	A	A	V	L	V	L	E	E	Y	E	H	A	V	Q	R	R	A	R	I	Y	A	E	V	L	G	Y	G	L	S	G	D	A	G	H	I	T	A	P	D	P	E	G	E	G	A	L	R	C	M	A	A	A	L	K	D	A	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S			T	T		T	T				B		B	B																	T	T																	S		S	S	S			T	T																T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.					.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.																												.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.																												.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	I	H	D	M	D	V	I	E	L	N	E	A	F	A	.	.	.	.	A	Q	A	L	G	V	L	R	E	L	G	L	P	D	D	A	P	H	V	N	P	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	L	G	M	S	G	A	R	L	A	L	A	A	S	H	E	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.																												.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.											.									.								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.									.
Template Sequence		V	Q	P	E	E	I	S	Y	I	N	A	H	A	T	S	T	P	L	G	D	A	A	E	N	K	A	I	K	H	L	.	F	K	D	H	A	Y	A	L	.	A	V	S	S	T	K	G	A	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	A	A	F	T	T	L	A	C	Y	Y	Q	K	L	P	P	T	L	N	L	D
Template Known Secondary structure				G	G	G										S																.		G	G	G	G	G	T	S	.											B		G	G	G																T					B	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																.									.
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.		.	.	.	370	.	.	.	.		.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
																					376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	N	G	R	Y	A	L	C	T	M	C	I	G	V	G	Q	G	I	A	M	I	L	E	R	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	S	E	P	E	F	D	L	N	Y	V	P	L	K	A	Q	E	W	K	T	E	K	R	F	I	G	L	T	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	C	I	A	G	L
Template Known Secondary structure					T	T			S				B	S	S							S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.