Job Description P0C7L2 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:30:04 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 298 % Identity 27% Template c1j3nB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase ii; PDBTitle: crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein)2 synthase ii from thermus thermophilus hb8 Resolution 2.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.		.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	E	A	F	I	C	D	.	G	I	R	T	P	I	G	R	Y	G	G	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	V	R	A	D	D	L	A	A	I	P	L	R
Query Conservation										.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	R	R	V	V	V	T	G	L	G	A	L	T	P	I	G	V	G	Q	E	A	F	H	K	A	Q	L	A	G	K	S	G	V	R	P	I	T	R	F	D	A	S	A	L	P	V	R	I	A	A	E	V	D	V	D	P	G	A	Y	L	D	R	K	E	L	R	R	L	D	R	F	V	Q	Y	A	L	I	A	A	Q
Template Known Secondary structure															T	T			S										T	T									S	S			T	T	S	S											G	G	G	T	S		T	T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50					.	.	.	.	.	.	.	.	.	60																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	L	V	R	N	P	R	L	D	A	E	C	I	D	.	.	.	.	D	V	I	L	G	C	A	N	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	D	N	R	N	V	A	R	M	A	T	L	L	A	G	L	P	Q	S	V	S	G	T	T	I
Query Conservation																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.											.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation						.																																																																			.	.
Template Sequence		L	A	L	E	.	D	A	G	L	K	P	E	D	L	D	P	E	R	V	G	T	L	V	G	T	G	I	G	G	M	E	T	W	E	A	Q	S	R	V	F	L	E	R	G	P	N	R	I	S	P	F	F	I	P	M	M	I	A	N	M	A	S	A	H	I	A	M	R	Y	G	F	.	.	T	G	P	S	S	T	V
Template Known Secondary structure						.		T	T			G	G	G	S		G	G	G								S	S																		T	T	S	S		T	T						S	T	T											T		.	.		S
Template Predicted Secondary structure						.																																																																			.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.		.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150			.	.	.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	L	C	G	S	G	L	D	A	L	G	F	A	A	R	A	I	K	A	G	D	G	D	L	L	I	A	G	G	V	E	S	M	S	R	A	P	F	V	M	G	K	A	A	S	A	F	S	R	Q	A	E	M	F	D	T	T	I	G	W	R	F	V	N	P	L	M	A	Q	Q	F	G	T	D	S	M	P	E	T
Query Conservation
Alig confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	A	C	A	T	G	A	D	A	L	G	S	A	L	R	M	I	Q	L	G	E	A	D	L	V	L	A	G	G	T	E	A	A	I	T	P	M	A	I	G	A	F	A	V	M	R	A	L	S	T	R	N	E	E	P	E	K	A	S	R	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				G	G	G															T	T	S		S												S										T	T		B				T	T	S	G	G	G	S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	N	V	A	E	L	L	K	I	S	R	E	D	Q	D	S	F	A	L	R	S	Q	Q	R	T	A	K	A	Q	S	S	G	I	L	A	E	E	I	V	P	V	V	L	K	N	K	K	G	V	V	T	E	I	Q	H	D	E	H	L	R	P	E	T	T	L	E	Q	L	R	G	L	K	A	P	F	R	A	N	G
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290						.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	T	A	G	N	A	S	G	V	N	D	G	A	A	A	L	I	I	A	S	E	Q	M	A	A	A	Q	G	L	T	P	R	A	R	I	V	A	M	A	T	A	G	V	.	.	.	.	.	E	P	R	L	M	G	L	G	P	V	P	A	T	R	R	V	L	E	R	A	G	L	S	I	H	D	M	D	V	I	E
Query Conservation																																														.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																												.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	T	L	S	R	D	G	F	V	M	G	E	G	A	G	V	L	V	L	E	A	Y	E	H	A	K	K	R	G	A	R	I	Y	A	E	L	V	G	F	G	R	S	A	D	A	H	H	I	T	E	P	H	P	E	G	K	G	A	A	L	A	M	A	R	A	L	K	D	A	G	I	A	P	E	Q	V	G	Y	I	N
Template Known Secondary structure		.	B	T	T				B		B	B																		T																	S		S	S				T	T																T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.					.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.																											.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.																											.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	N	E	A	F	A	A	.	.	.	.	Q	A	L	G	V	L	R	E	L	G	L	P	D	D	A	P	H	V	N	P	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	L	G	M	S	G	A	R	L	A	L	A	A	S	H	E	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.																											.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.										.									.								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.									.
Template Sequence		A	H	G	T	S	T	P	V	G	D	R	A	E	V	L	A	I	K	R	V	.	F	G	D	H	A	K	R	L	.	M	V	S	S	T	K	S	M	I	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	A	I	A	T	V	Q	A	L	Y	H	G	V	I	P	P	T	I	N	L	E	D	P	D	P	E	L	D	L	D	F
Template Known Secondary structure																						.		G	G	G	G	G	T		.					T						B		G	G	G																T						T	T	T	T	S	B		T	T			S	B
Template Predicted Secondary structure																						.									.
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.		320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
							376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	R	R	N	G	R	Y	A	L	C	T	M	C	I	G	V	G	Q	G	I	A	M	I	L	E	R	V
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	E	P	R	E	A	K	V	D	Y	A	L	S	N	S	F	A	F	G	G	H	N	A	V	L	A	F	K	R	V
Template Known Secondary structure			S	S							S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.