![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 15 | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | |
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | L | P | V | F | A | A | E | H | W | I | D | V | R | V | P | E | Q | Y | Q | Q | E | H | V | Q | G | A | I | N | I | P | L | K | E | V | K | E | R | I | A | T | A | V | P | D | K | N | D | T | V | K | V | Y | C | N | A | G | R | Q | S | G | Q | A | K | E | I | L | S | E | M | G | Y | T | H | V | E | N | A | . | G | G |
Template Sequence |   | D | N | L | S | E | D | Q | L | L | L | D | V | R | N | P | G | E | L | Q | N | G | G | L | E | G | A | V | N | I | P | V | D | E | L | R | D | R | . | . | X | H | E | L | P | K | D | K | E | I | I | I | F | C | Q | V | G | L | R | G | N | V | A | Y | R | Q | L | V | N | N | G | Y | . | R | A | R | N | L | I | G | G |
Template Known Secondary structure |   | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | G | G | G | G | G | G | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | . | . | G | G | G | S | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | |||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 481 | . | . | . | . | . | . | . | . | 490 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 500 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 510 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 520 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 530 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 540 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 550 | . | . | . | . | . | . | . | |||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 94 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | L | K | D | I | A | M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | Y | R | T | Y | K | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 558 | . | 560 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|