Job Description P0AC75 Confidence 99.98% Date Thu Jan 5 11:17:28 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 352 % Identity 18% Template c3s29C_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:sucrose synthase 1; PDBTitle: the crystal structure of sucrose synthase-1 from arabidopsis thaliana2 and its functional implications. Resolution 2.85 Å

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		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.											.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.							.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	T	L	A	A	I	P	L	V	R	A	L	R	H	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	D	L	P	I	T	V	T	T	M	.	.	.	.	.	.	T	P	T	G	S	E	R	V	Q	S	A	F	G	.	K	D	V	Q	H	V	Y	L	P	Y	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	V	V	Y	I	L	D	Q	V	R	A	L	E	I	E	M	L	Q	R	I	K	Q	Q	G	L	N	I	K	P	R	I	L	I	L	T	R	L	L	P	D	A	V	G	T	T	C	G	E	R	L	E	R	V	Y	D	S	E	Y	C	D	I	L	R	V	P	F	R	T	E	K	G	I	V	R	K	W	I	S	R
Template Known Secondary structure																									T	T															T	T			S	S	S	T	T	S	S					T	T		S	S											T	T					S				G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
													111	.	.	.	.	.	.	.	.	120			.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.												.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	A	L	N	R	F	L	N	K	.	.	V	D	P	K	L	V	L	I	M	E	T	E	L	W	P	N	L	I	A	A	L	H	K	R	K	I	P	L	V	I	A	N	A	R	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	S	A	A	G	Y	A	K	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	E	V	W	P	Y	L	E	T	Y	T	E	D	A	A	V	E	L	S	K	E	L	N	G	K	P	D	L	I	I	G	N	Y	S	D	G	N	L	V	A	S	L	L	A	H	K	L	G	V	T	Q	C	T	I	A	H	A	L	E	K	T	K	Y	P	D	S	D	I	Y	W	K	K	L	D	D	K	Y	H	F	S
Template Known Secondary structure		G	G		G	G	G																	S	S			S																					T								S							S	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
		167	.	.			170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.								190	.	.	.	.																.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure					.	.																					.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.																					.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	K	F	.	.	V	R	R	L	L	R	R	I	T	L	I	A	A	Q	N	E	E	D	G	A	.	.	.	.	.	.	.	R	F	V	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	N	N	Q	V	T	V	T	G	S	L	K	F	D	I	S	V	T	P	Q	L	A	A	K	A	V
Query Conservation					.	.																					.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																					.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	Q	F	T	A	D	I	F	A	M	N	H	T	D	F	I	I	T	S	T	F	Q	E	I	A	G	S	K	E	T	V	G	Q	Y	E	S	H	T	A	F	T	L	P	G	L	Y	R	V	V	H	G	I	D	V	F	D	P	K	F	N	I	V	S	P	G	A	D	M	S	I	Y	F	P	Y	T	E	E	K	R	R
Template Known Secondary structure														S	S					S		S							S	S	S			T	T	G	G	G	S	S				T	T	T									T	T		T	T										T	T	T				T	T		T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
		223	.	.	.	.																					.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240			.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	R	R	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	A	P	H	R	P	V	W	I	A	T	S	T	.	.	H	E	G	E	E	S	V	V	I	A	A	H	Q	A	L	L	Q	Q	F	P	N	L	L	L	I	L	V	P	R	H	P	E	R	F	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	T	K	F	H	S	E	I	E	E	L	L	Y	S	D	V	E	N	K	E	H	L	C	V	L	K	D	K	K	K	P	I	L	F	T	M	A	R	L	D	R	V	K	N	L	S	G	L	V	E	W	Y	G	K	N	T	R	L	R	E	L	A	N	L	V	V	V	G	G	D	R	R	K	E	S	K	D	N	E	E
Template Known Secondary structure			G	G	G											S			S	S	S			S		B	S		T	T	S										S	T	T	T	T																											T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.
						275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	P	D	A	I	N	L	V	R	Q	A	G	L	S	Y	I	T	R	S	S	G	E	V	P	S	T	S	T	Q	V	V	V	G	D	T	M	G	E	L	M	L	L	Y	G	I	A	D	L	A	F	V	G	G	S	L	V	E	R	G	G	H	N	P	L	E	A	A	A	H	A	I	P	V	L	M	G	P
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template Sequence		K	A	E	M	K	K	M	Y	D	L	I	E	E	Y	K	L	N	G	Q	F	R	W	I	S	S	Q	M	D	R	V	.	.	.	.	.	.	.	R	N	G	E	L	Y	R	Y	I	C	D	T	K	G	A	F	V	Q	P	A	L	Y	E	A	F	G	L	T	V	V	E	A	M	T	C	G	L	P	T	F	A	.	T
Template Known Secondary structure															T	T		T	B	T												.	.	.	.	.	.	.												T	T								S		B	S	S											T						.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template SS confidence
		623	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.								.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.		.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.					.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.				.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.																					.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.																					.	.	.
Query Sequence		H	T	F	N	F	K	D	I	C	A	R	L	E	Q	A	S	G	L	I	T	V	T	D	A	T	T	L	A	K	E	V	S	S	L	L	.	.	.	.	T	D	A	D	Y	R	S	F	Y	G	R	H	A	V	E	V	L	Y	Q	N	.	.	.	Q	G	A	L	Q	R	L	L	Q	L	L	E	P	Y
Query Conservation																																					.	.	.	.																					.	.	.
Alig confidence													.																								.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation													.
Template Sequence		C	K	G	G	P	A	E	I	I	V	H	.	G	K	S	G	F	H	I	D	P	Y	H	G	D	Q	A	A	D	T	L	A	D	F	F	T	K	C	K	E	D	P	S	H	W	D	E	I	S	K	G	G	L	Q	R	I	E	E	K	Y	T	W	Q	I	Y	S	Q	R	L	L	T	L	T	G	V	Y
Template Known Secondary structure		S	S	B	T							B	.	T	T	T	B					T	T	S																			T
Template Predicted Secondary structure													.
Template SS confidence
		695	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.		.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.