Job Description P0AC75 Confidence 99.85% Date Thu Jan 5 11:17:28 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 311 % Identity 15% Template c3nb0A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycogen [starch] synthase isoform 2; PDBTitle: glucose-6-phosphate activated form of yeast glycogen synthase Resolution 2.41 Å

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		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.							.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.		.	.	.	.	.	.	150	.	.	.							.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.																							.											.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.																							.											.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	D	A	L	N	R	F	L	N	K	V	.	.	.	.	.	.	D	P	K	L	V	L	I	M	E	T	E	L	W	P	N	L	I	A	A	L	H	K	.	R	K	I	P	L	V	I	A	N	A	.	.	.	.	.	.	R	L	S	A	R	S	A	A	G	Y	A	K	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.	.	.	.	.	.																							.											.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.																							.											.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	Y	T	V	A	W	F	L	G	E	V	A	H	L	D	S	Q	H	A	I	V	A	H	F	H	E	W	L	A	G	V	A	L	P	L	C	R	K	R	R	I	D	V	V	T	I	F	T	T	H	A	T	L	L	G	R	Y	L	C	A	S	G	S	F	D	F	Y	N	C	L	E	S	V	D	V	D	H	E	A
Template Known Secondary structure																			S									S	G	G	G		T								T	T		S								S	S								T	S	S	S		S						G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
											168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	V	R	R	L	L	R	R	I	T	L	I	A	A	Q	N	E	E	D	G	A	R	F	V	A	L	G	A	K	N	N	Q	V	T	V	T	G	S	L	K	F	D	I	S	V	T	P	Q	L	A	A	K	A	V	T	L	R	R	Q	W	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.
Template Sequence		G	R	F	G	I	Y	H	R	Y	C	I	E	R	A	A	A	H	S	A	D	V	F	T	T	V	S	Q	I	T	A	F	E	A	E	H	L	L	K	R	K	P	D	G	.	I	L	P	N	G	L	N	V	I	K	F	Q	A	F	H	E	F	Q	N	L	H	A	L	K	K	E	K	I	N	D	F	V	R	G	H	F
Template Known Secondary structure				T	T															S	S					S	S											T	S	S			S		.						B						S	S	T	T																					T
Template Predicted Secondary structure																																													.
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
										230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.				.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.								.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	P	H	R	P	V	W	I	A	T	S	T	H	E	.	.	.	G	E	E	S	V	V	I	A	A	H	Q	A	L	L	Q	Q	F	P	N	.	.	.	.	.	.	.	L	L	L	I	L	V	P	R	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	G	C	F	D	F	D	L	D	N	T	L	Y	F	F	I	A	G	R	Y	E	Y	K	N	K	G	A	D	M	F	I	E	A	L	A	R	L	N	Y	R	L	K	V	S	G	S	K	K	T	V	V	A	F	I	V	M	P	A	K	N	N	S	F	T	V	E	A	L	K	G	Q	A	E	V	R	A	L	E	N	T
Template Known Secondary structure		T	T				S		G	G	G								S	S			T	T	T	T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
																																																																						272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	F	P	D	A	I	N	L	V	R	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	H	E	V	T	T	S	I	G	K	R	I	F	D	H	A	I	R	Y	P	H	N	G	L	T	T	E	L	P	T	D	L	G	E	L	L	K	S	S	D	K	V	M	L	K	R	R	I	L	A	L	R	R	P	E	G	Q	L	P	P	I	V	T	H	N	M	V	D	D	A	N	D	L	I	L	N	K	I	R	Q
Template Known Secondary structure																				T	T	S	T	T			S	S	S																											T	T					S	B	S				T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure																																	.	.
Query SS confidence																																	.	.
Query Sequence		A	G	L	S	Y	I	T	R	S	S	G	E	V	P	S	T	S	T	Q	V	V	V	G	D	T	M	G	E	L	M	L	.	.	L	Y	G	I	A	D	L	A	F	V	G	G	S	L	V	E	R	G	G	H	N	P	L	E	A	A	A	H	A	I	P	V	L	M	G	P	H	T	F	N	F	K	D	I	C	A	R
Query Conservation																																	.	.
Alig confidence																																	.	.								.																											.
Template Conservation																																										.																											.
Template Sequence		V	Q	L	F	N	S	P	S	D	R	V	K	M	I	F	H	P	E	F	L	N	A	N	N	P	I	L	G	L	D	Y	D	E	F	V	R	G	C	H	L	.	G	V	F	P	S	Y	Y	E	P	W	G	Y	T	P	A	E	C	T	V	M	G	V	P	S	I	T	.	T	N	V	S	G	F	G	S	Y	M	E	D
Template Known Secondary structure			T					T	T		S								S				T	T		S	S	S												S		.						S	S	B	S	S										T	T						.		T	T	B								T
Template Predicted Secondary structure																																										.																											.
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.		.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.		.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		362							.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.								.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.				.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Query Sequence		L	.	.	.	.	.	.	E	Q	A	S	G	L	I	T	V	T	D	.	.	.	.	.	.	.	A	T	T	L	A	K	E	V	S	S	L	L	T	D	A	D	Y	R	S	F	Y	G	R	H	A	V	E	V	L	Y	Q	N	.	.	.	Q	G	A	L	Q	R	L	L	Q	L	L	E	P	Y	L	P	P	K
Query Conservation			.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	E	T	N	Q	A	K	D	Y	G	I	Y	I	V	D	R	R	F	K	A	P	D	E	S	V	E	Q	L	V	D	Y	M	E	E	F	V	K	K	T	R	R	Q	R	I	N	Q	R	N	A	T	E	A	L	S	D	L	L	D	W	K	R	M	G	L	E	Y	V	K	A	R	Q	L	A	L	R	R	G
Template Known Secondary structure		T	S								T	T							S	S	S																		T																G	G	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.