Job Description P0AC75 Confidence 99.30% Date Thu Jan 5 11:17:28 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 368 % Identity 12% Template c3l7mC_ PDB info PDB header:structural protein Chain: C: PDB Molecule:teichoic acid biosynthesis protein f; PDBTitle: structure of the wall teichoic acid polymerase tagf, h548a Resolution 2.85 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.
Query SS confidence																																											.
Query Sequence		W	I	R	L	W	V	R	G	R	K	A	P	A	Y	R	K	R	W	G	E	R	Y	G	F	Y	R	H	P	L	K	P	G	G	I	M	L	H	S	V	S	V	.	G	E	T	L	A	A	I	P	L	V	R	A	L	R	H	R	Y	P	D	L	P	I	T	V	T	T	M	T	P	T	G	S	E	R	V	Q	S	A
Query Conservation																																											.
Alig confidence																																											.																															.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	R	H	V	K	N	I	V	L	R	R	K	N	K	E	R	S	L	Y	D	L	T	D	K	E	D	N	V	K	P	K	T	I	V	F	E	S	F	G	G	K	N	Y	S	D	S	P	K	Y	I	Y	E	Y	M	Q	K	Y	Y	P	N	Y	R	Y	I	W	S	F	K	N	P	D	.	.	.	.	.	K	N	V
Template Known Secondary structure											T	T		T	T												G	G	G										B	G	G	G	T	B	S																T	T	S							S	S	G	G	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.						.	.	.
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.												.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	G	K	D	V	Q	H	V	Y	L	P	Y	D	L	P	D	A	L	N	R	F	L	N	K	V	D	P	K	L	V	L	I	M	E	T	E	L	W	P	N	L	I	A	A	L	H	K	R	K	I	P	L	V	I	A	N	A	R	L	S	A	R	S	A	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	K
Query Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.																								.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Sequence		V	P	G	S	A	E	K	V	K	R	N	S	.	.	.	.	.	.	A	E	Y	Y	Q	A	Y	S	E	A	S	H	W	V	S	N	A	R	T	P	L	Y	L	.	.	.	N	K	K	E	N	Q	T	Y	I	Q	T	W	H	G	T	P	L	K	R	L	A	N	D	M	K	V	V	R	M	P	G	T	T	T	P	K
Template Known Secondary structure				S	S						T	T	S	.	.	.	.	.	.																S	S				T	T	S	.	.	.				T	T	S							S				S	B			G	G	G							T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.							.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.				.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.				220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																													.																												.	.	.
Query SS confidence																													.																												.	.	.
Query Sequence		L	G	K	F	V	R	R	L	L	R	R	I	T	L	I	A	A	Q	N	E	E	D	G	A	R	F	V	.	A	L	G	A	K	N	N	Q	V	T	V	T	G	S	L	K	F	D	I	S	V	T	P	Q	L	A	A	.	.	.	K	A	V	T	L	R	R	Q	W	A	P	H	R	P	V	W	I	A	T	S	T	H
Query Conservation																													.																												.	.	.
Alig confidence																													.																												.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	R	N	F	N	R	E	T	S	R	W	D	Y	L	I	S	P	N	R	Y	S	T	E	I	F	R	S	A	F	W	M	D	E	E	R	I	L	E	I	G	Y	P	R	N	D	V	L	V	N	R	A	N	D	Q	E	Y	L	D	E	I	R	T	H	L	N	L	P	S	D	K	K	V	I	M	Y	A	P	T	W
Template Known Secondary structure											T	T		S					S	S											T	T			G	G	G				S			G	G	G						S	T	T												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.										.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	E	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	I	A	A	H	Q	A	L	L	Q	Q	F	P	N	L	L	L	I	L	V	P	R	H	P	E	R	F	P	D	A	I	N	L	V	R	Q	A	G	L	S	Y	I	T	R	S	S	G	E	V	P	S	T	S	T	Q	V	V	V	G	D	T	M	G	E	L
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	D	E	F	V	S	K	G	K	Y	L	F	E	L	K	I	D	L	D	N	L	Y	K	E	L	G	D	D	Y	V	I	L	L	R	M	A	Y	L	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	L	D	L	S	G	Y	E	N	F	A	I	D	V	S	N	Y	N	D	V
Template Known Secondary structure			G	G	G			G	G	G	S	S					T	T										T	T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T		T	T	T					T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.						350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		M	L	L	Y	G	I	A	D	L	A	F	V	G	G	S	L	V	E	R	G	G	H	N	P	L	E	A	A	A	H	A	I	P	V	L	M	G	.	.	.	.	.	P	H	T	F	N	F	K	D	I	C	A	R	L	E	Q	A	S	G	L	I	T	V	T	D	A	T	T	L	A	K	E	V	S	S	L	L	T	D
Query Conservation																																							.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	E	L	F	L	I	S	D	C	L	I	T	D	Y	S	.	.	.	.	.	.	S	V	M	F	D	Y	G	I	L	K	R	P	Q	F	F	F	A	Y	D	I	D	K	Y	D	K	G	L	R	G	F	Y	M	N	Y	M	E	D	L	P	G	P	I	Y	T	E	P	Y	G	L	A	K	E	L	K	N	L	D	K	V
Template Known Secondary structure							T		S					S	S		.	.	.	.	.	.	T	T					G	G	G	T								T	T	T	T	T	T	T	T	T			S	B	S	S		T	T	T	S	S	S	S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.							.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.			.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.
Query SS confidence																					.	.
Query Sequence		A	D	Y	R	S	F	Y	G	R	H	A	V	E	V	L	Y	Q	N	Q	.	.	G	A	L	Q	R	L	L	Q	L	L	E	P	Y	L	P	P	K
Query Conservation																					.	.
Alig confidence																					.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	Q	Q	Y	Q	E	K	I	D	A	F	Y	D	R	F	C	S	V	D	N	G	K	A	S	Q	Y	I	G	D	L	I	H	K	D	I	K	E	Q
Template Known Secondary structure																	T	T	T			S																	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		684	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.