Job Description P0A9H3 Confidence 99.43% Date Thu Jan 5 11:10:12 GMT 2012 Rank 185 Aligned Residues 355 % Identity 13% Template c3ruyB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:ornithine aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of the ornithine-oxo acid transaminase rocd from2 bacillus anthracis Resolution 2.65 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.												.	.	.	.	.			.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query Sequence		L	T	K	A	L	F	K	Y	V	R	E	G	K	Y	T	F	C	T	P	G	H	M	G	G	T	A	F	Q	K	S	P	V	G	S	L	F	Y	D	F	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	N	T	M	K	.	.	S	D	I	S	I	S	V	S	E	L	G	S	L	L	D	H	S	G	P	H	K
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.				.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		I	I	E	L	T	D	T	Y	G	A	N	N	Y	H	P	L	P	I	V	I	S	K	A	E	G	V	W	V	E	D	P	E	G	N	R	Y	M	D	L	L	S	A	Y	S	A	V	N	Q	G	H	R	H	P	K	I	I	N	A	L	I	D	Q	.	A	N	R	V	T	L	T	S	R	A	F	H	S	D	Q	L	G
Template Known Secondary structure												S	S					S								B	T					T	T							S	S					T		T	T		B	T												.	T	T	T		S				T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.		.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.												.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	E	Q	Y	I	A	R	V	F	N	A	D	R	S	Y	M	V	T	N	G	T	S	T	A	N	K	I	V	G	M	Y	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	G	S	T	I	L	I	D	R	N	C	H	K	S	L	T	H	L	M	M	M	S	D	V	T	P	I	Y	F	R	P	T	R	N
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																																																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	W	Y	E	K	V	A	K	L	T	N	K	E	M	V	L	P	M	N	T	G	.	A	E	A	V	E	T	A	I	K	T	A	R	R	W	A	Y	D	V	K	K	V	E	A	N	R	A	E	I	I	V	C	E	D	N	F	H	G	R	T	M	G	A	V	S	M	S	S	N	.	.	.	.	.	.	E	E	Y	K
Template Known Secondary structure												T		S						S	S		.																		T	S				T	T								T	T					S	S					T	T		S		.	.	.	.	.	.	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																							.																																																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.		.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.							.	.	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.					.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.						.	.	.	.													.	.
Query SS confidence																																												.	.						.	.	.	.													.	.
Query Sequence		A	Y	G	I	L	G	G	I	P	Q	S	E	F	Q	H	A	T	I	A	K	R	V	K	E	T	P	N	A	T	W	P	V	H	A	V	I	T	N	S	T	Y	D	.	.	G	L	L	Y	N	.	.	.	.	T	D	F	I	K	K	T	L	D	V	K	S	.	.	I	H	F	D	S	A	W	V	P	Y	T	N	F
Query Conservation																																												.	.						.	.	.	.													.	.
Alig confidence																																.	.	.										.	.						.	.	.	.													.	.
Template Conservation																																.	.	.
Template Sequence		R	G	F	G	P	M	L	P	G	I	I	V	I	P	Y	G	D	L	E	A	L	K	A	A	I	T	P	N	T	A	.	.	.	A	F	I	L	E	P	I	Q	G	E	A	G	I	N	I	P	P	A	G	F	L	K	E	A	L	E	V	C	K	K	E	N	V	L	F	V	A	D	E	I	Q	T	G	L	G	R	T
Template Known Secondary structure		T	T			S			S	S						T	T											T	T			.	.	.						S	S	B	T	T	T	T	S	B				T	T												T	T								T	T	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.				.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	I	Y	E	G	K	C	G	M	S	G	G	R	V	E	G	K	V	I	Y	E	T	Q	S	T	H	K	L	L	A	A	F	S	Q	A	S	M	I	H	V	K	G	D	V	N	E	E	T	F	N	E	A	Y	M	M	H	T	T	T	S	P	H	Y	G	I	V	A	S	T	E	T	A	A	A	M	M	K	G	N
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.																	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.																	.	.													.	.	.	.	.
Template Sequence		G	K	V	.	.	.	.	.	.	F	A	C	D	W	D	N	V	T	P	D	M	Y	I	L	G	.	.	A	L	G	G	G	V	F	P	I	S	C	A	.	.	.	.	.	A	A	N	R	D	I	L	G	V	F	E	P	G	S	H	G	S	T	F	G	G	N	P	L	A	C	A	V	S	I	A	A	L	E	V	L
Template Known Secondary structure		S	S	S	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	G	G	T				S						.	.		T	T	T	T	T	S						.	.	.	.	.								T	T			T	T	S	S			S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.																	.	.													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.							.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.			.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.						.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	K	R	L	I	N	G	S	I	E	R	A	I	K	F	R	K	E	I	K	R	L	R	T	E	S	D	G	W	F	F	D	V	W	Q	P	D	H	I	D	T	T	E	C	W	P	L	R	S	D	S	T	W	H	G	F	K	N	I	D	N	E	H	M	Y	L	D	P	I	K	V	T	L	L	T	P	G	M	E
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	E	K	L	T	E	R	S	L	Q	L	G	E	K	L	V	G	Q	L	K	E	I	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	M	I	T	E	V	R	G	K	G
Template Known Secondary structure				T	T																	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	D	G	T	M	S	D	F	G	I	P	A	S	I	V	A	K	Y	L	D	E	H	G	I	V	V	E	K	T	G	P	Y	N	L	L	F	L	F	S	I	G	I	D	K	T	K	A	L	S	L	L	R	A	L	T	D	F
Query Conservation
Alig confidence				.
Template Conservation				.
Template Sequence		L	F	.	I	G	I	E	L	N	E	P	A	R	P	Y	C	E	Q	L	K	A	A	G	L	L	C	K	E	T	H	E	N	V	I	R	I	A	P	P	L	V	I	S	E	E	D	L	E	W	A	F	Q	K	I	K	A	V
Template Known Secondary structure		T		.						S	S		S											T							T	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		339	340		.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.