Job Description P0A9H3 Confidence 99.44% Date Thu Jan 5 11:10:12 GMT 2012 Rank 184 Aligned Residues 362 % Identity 12% Template c1oatB_ PDB info PDB header:aminotransferase Chain: B: PDB Molecule:ornithine aminotransferase; PDBTitle: ornithine aminotransferase Resolution 2.50 Å

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		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.												.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.			.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Query Sequence		L	T	K	A	L	F	K	Y	V	R	E	G	K	Y	T	F	C	T	P	G	H	M	G	G	T	A	F	Q	K	S	P	V	G	S	L	F	Y	D	F	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	N	T	M	K	S	D	I	S	I	S	V	S	E	L	.	.	G	S	L	L	D	H	S	G	P	H	K
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.							.	.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		I	F	E	R	E	Y	K	Y	G	A	H	N	Y	H	P	L	P	V	A	L	E	R	G	K	G	I	Y	L	W	D	V	E	G	R	K	Y	F	D	F	L	S	S	Y	S	A	V	N	Q	G	H	C	H	P	K	I	V	N	A	L	K	.	S	Q	V	D	K	L	T	L	T	S	R	A	F	Y	N	N	V	L	G
Template Known Secondary structure										S								S								B	T					T	T							S	S					T		T	T		B	T										.				T	T		S				T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.											.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query Sequence		E	A	E	Q	Y	I	A	R	V	F	N	A	D	R	S	Y	M	V	T	N	G	T	S	T	A	N	K	I	V	G	M	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	A	G	S	T	I	L	I	D	R	N	C	H	K	S	L	T	H	L	M	M	M	S	D	V	T	P	I	Y	F	R	P	.	T	R	N
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation
Template Sequence		E	Y	E	E	Y	I	T	K	L	F	N	Y	H	K	V	L	P	M	N	T	G	V	E	A	G	E	T	A	C	K	L	A	R	K	W	G	Y	T	V	K	G	I	Q	K	Y	K	A	K	I	V	F	A	A	G	N	F	W	G	R	T	L	S	A	I	S	S	S	T	D	P	T	S	Y	D	G	F	G	P	F	M
Template Known Secondary structure												T		S						S	S																			T	T				T	T								T	T					S	S					T	T								T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.			.	.	.	310	.	.	.	.					.	.	.	.	.	320	.	.			.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.									.	.	.	.									.	.
Query SS confidence																																									.	.									.	.	.	.									.	.
Query Sequence		A	Y	G	I	L	G	G	I	P	Q	S	E	F	Q	H	A	T	I	A	K	R	V	K	E	T	P	N	A	T	W	P	V	H	A	V	I	T	N	S	.	.	T	Y	D	G	L	L	Y	N	.	.	.	.	T	D	F	I	K	K	T	L	.	.	D	V	K	S	I	H	F	D	S	A	W	V	P	Y	T	N	F
Query Conservation																																									.	.									.	.	.	.									.	.
Alig confidence											.	.	.	.																.	.	.	.	.							.	.									.	.	.	.									.	.
Template Conservation											.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	F	D	I	I	P	Y	N	.	.	.	.	D	L	P	A	L	E	R	A	L	Q	D	P	N	V	A	.	.	.	.	.	A	F	M	V	E	P	I	Q	G	E	A	G	V	V	V	P	D	P	G	Y	L	M	G	V	R	E	L	C	T	R	H	Q	V	L	F	I	A	D	E	I	Q	T	G	L	A	R	T
Template Known Secondary structure		S	S						T	T	.	.	.	.									T	T	S	T	T			.	.	.	.	.						S	S	B	T	T	T	T		B				T	T													T								T	T	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210					.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.						.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	I	Y	E	G	K	C	G	M	S	G	G	R	V	E	G	K	V	I	Y	E	T	Q	S	T	H	K	L	L	A	A	F	S	Q	A	S	M	I	H	V	K	G	D	V	N	E	E	T	F	N	E	A	Y	M	M	H	T	T	T	S	P	H	Y	G	I	V	A	S	T	E	T	A	A	A	M	M	K	G	N
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Sequence		G	R	W	.	.	.	.	.	.	L	A	V	D	Y	E	N	V	R	P	D	I	V	L	L	G	K	A	L	S	G	G	L	Y	P	V	S	A	V	L	.	.	.	C	D	D	D	I	M	L	T	I	K	P	G	E	H	G	S	T	Y	G	G	N	P	L	G	C	R	V	A	I	A	A	L	E	V	L	E	E	E
Template Known Secondary structure		S	S	S	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	G	G	T				S						G	G	G	G	T	T	S	S							.	.	.							T	T	S		T	T	S	S			S	S	T	T																		T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template SS confidence
		273	.	.							.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.				.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	K	R	L	I	N	G	S	I	E	R	A	I	K	F	R	K	E	I	K	R	L	R	T	E	S	D	G	W	F	F	D	V	W	Q	P	D	H	I	D	T	T	E	C	W	P	L	R	S	D	S	T	W	H	G	F	K	N	I	D	N	E	H	M	Y	L	D	P	I	K	V	T	L	L	T	P	G	M	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	N	L	A	E	N	A	D	K	L	G	I	I	L	R	N	E	L	M	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	S	D	V	V	T	A	V	R	G	K	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	T																	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T	T								T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		500	.	.	.	.	.				.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure								.	.	.
Query SS confidence								.	.	.
Query Sequence		K	D	G	T	M	S	.	.	.	D	F	G	I	P	A	S	I	V	A	K	Y	L	D	E	H	G	I	V	V	E	K	T	G	P	Y	N	L	L	F	L	F	S	I	G	I	D	K	T	K	A	L	S	L	L	R	A	L	T	D	F	K	R	A	F
Query Conservation								.	.	.
Alig confidence								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	N	A	I	V	I	K	E	T	K	D	W	D	A	W	K	V	C	L	R	L	R	D	N	G	L	L	A	K	P	T	H	G	D	I	I	R	F	A	P	P	L	V	I	K	E	D	E	L	R	E	S	I	E	I	I	N	K	T	I	L	S	F
Template Known Secondary structure		T									B	T	T	B												T	T					B	S	S	S	S								T	T																			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.