Job Description P77488 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:29:48 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 559 % Identity 16% Template c3ahhA_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:xylulose 5-phosphate/fructose 6-phosphate phosphoketolase; PDBTitle: h142a mutant of phosphoketolase from bifidobacterium breve complexed2 with acetyl thiamine diphosphate Resolution 2.10 Å

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		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.		.	.	.	.	.	.	70	.	.	.		.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.											.										.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.											.										.	.
Query Sequence		K	E	S	L	P	K	L	C	D	E	L	R	R	Y	L	L	D	S	V	S	R	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	F	A	S	G	L	G	T	V	E	L	T	V	A	L	.	H	Y	V	Y	N	T	P	F	D	Q	.	L	I	W	D	V	G	H	Q	A	.	.
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.											.										.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.											.										.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	E	G	M	D	K	Y	W	R	V	T	N	Y	M	S	I	G	Q	I	Y	L	R	S	N	P	L	M	K	E	P	F	T	R	D	D	V	K	H	R	L	V	G	H	W	G	T	T	P	G	L	N	F	L	L	A	H	I	N	R	L	I	A	D	H	Q	Q	N	T	V	F	I	M	G	P	G	H	G	G	P	A
Template Known Secondary structure																						B	S	S		T	T			S	S			G	G	G	B		S	S			S			S	S																			T	B		B					S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
			83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.												.	.	.	.	.	100	.	.	.		.	.	.	.	.	.	110	.			.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.	.
Query SS confidence		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.	.
Query Sequence		.	Y	P	H	K	I	L	T	G	R	R	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	T	I	R	Q	K	G	G	.	L	H	P	F	P	W	R	G	.	.	E	S	E	Y	D	V	L	S	V	G	H	S	S	T	S	I	S	A	G	I	G	I	A	V	A	A	E	K	E	G	K	N	R	R	T	V
Query Conservation		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.	.
Alig confidence		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.
Template Sequence		G	T	S	Q	S	Y	V	D	G	T	Y	T	E	Y	Y	P	N	I	T	K	D	E	A	G	L	Q	K	F	F	R	Q	F	S	Y	P	G	G	I	P	S	A	F	A	P	E	T	P	G	S	I	H	E	G	G	E	L	G	Y	A	L	S	H	A	Y	G	A	V	.	.	.	.	M	N	N	P	S	L	F	V	P
Template Known Secondary structure										S							T	T	S		S	S											B	T		T	T	S	B		S	S			T	T	S	T	T		S				S	S	T	T											.	.	.	.	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.					.	170	.	.	.	.	.	.	.
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.				.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.				190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210					.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																			.														.	.	.																						.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.																			.														.	.	.																						.	.	.	.
Query Sequence		C	V	I	G	D	G	A	I	T	A	G	.	.	.	M	A	F	E	A	M	N	H	A	G	D	I	R	P	D	M	L	V	.	I	L	N	D	N	E	M	S	I	S	E	N	V	.	.	.	G	A	L	N	N	H	L	A	Q	L	L	S	G	K	L	Y	S	S	L	R	E	.	.	.	.	G	G	K	K	V	F
Query Conservation													.	.	.																			.														.	.	.																						.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																			.														.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	I	I	G	D	G	E	A	E	T	G	P	L	A	T	G	W	Q	S	N	K	L	V	N	P	R	T	D	G	I	V	L	P	I	L	H	L	N	G	Y	K	I	A	N	P	T	I	L	A	R	I	S	D	E	E	L	H	D	F	F	R	G	M	G	Y	H	P	Y	E	F	V	A	G	F	D	N	E	D	H	M
Template Known Secondary structure						T	T	G	G	G	S							G	G	G	G	G	S	S		T	T	T	S											S	B	S	S	S	S	B						S												T	T									S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.		.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																																																											.																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.																			.	.	.	.
Query Sequence		S	G	V	P	P	I	K	E	L	L	K	R	T	E	E	H	I	K	G	M	V	V	P	G	T	L	F	E	E	L	G	F	N	Y	I	G	P	V	D	G	H	D	V	L	G	L	I	T	T	L	K	N	M	R	D	L	K	.	G	P	Q	F	L	H	I	M	T	K	K	G	R	G	Y	E	P	A	.	.	.	.
Query Conservation																																																											.																			.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	I	H	R	R	F	A	E	L	F	E	T	I	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	C	D	I	K	A	A	A	Q	T	D	D	M	T	R	P	F	Y	P	M	L	I	F	R	T	P	K	G	W	T	C	P	K	F	I	D	G	K
Template Known Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T			S	S													T	T	T	T	S		S			T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
			292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	E	K	D	P	I	T	F	H	A	V	P	K	F	D	P	S	S	G	C	L	P	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	T	E	G	S	W	R	A	H	Q	V	P	L	A	S	A	R	D	T	E	E	H	F	E	V	L	K	G	W	M	E	S	Y	K	P	E	E	L	F	N	A	D	G	S	I	K	D	D	V	T	A	F	M	P	K	G	E	L	R	I	G	A	N	P	N	A	N	G	G	V	I	R	E	D	L	K	L	P	E	L
Template Known Secondary structure				T	T	S	G	G	G	S	S		S		T	T	T	T	T	T	S													T		G	G	G	T	B		T	T	S		B						T	T	S			G	G	G	S	T	T	T		G	G	G	G	G	G	G	T									G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
															315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.		.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	360	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	L	P	S	Y	S	K	I	F	G	D	W	L	C	E	T	A	A	K	D	N	.	K	L	M	A	I	T	P	A	M	R	E	G	S	G	M	V	E	F	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	P	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Q	Y	E	V	T	G	V	K	E	Y	G	H	G	W	G	Q	V	E	A	P	R	A	L	G	A	Y	C	R	D	I	I	K	N	N	P	D	S	F	R	I	F	G	P	D	E	T	A	S	N	R	L	N	A	T	Y	E	V	T	D	K	Q	W	D	N	G	Y	L	S	G	L	V	D	E	H	M	A	V	T	G
Template Known Secondary structure		G	G	G			T							T	T						T															S	T	T	T						S	S		T	T	T	T	T		G	G	G	G	G	T							S					T	T	T			S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.				.	.	.	.	400	.	.								.	.	.	.	.	.	.	410	.			.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.								.	.	.	.	.	.	.										.	.													.
Query SS confidence																																				.	.	.								.	.	.	.	.	.	.										.	.													.
Query Sequence		R	Y	F	D	V	A	I	A	E	Q	H	A	V	T	F	A	A	G	L	A	I	G	G	Y	K	P	I	V	A	I	Y	S	T	F	.	.	.	L	Q	R	A	Y	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	V	L	H	D	V	A	I	Q	K	.	.	L	P	V	L	F	A	I	D	R	A	G	I	.	V	G	A	D	G
Query Conservation																																				.	.	.								.	.	.	.	.	.	.										.	.													.
Alig confidence							.																													.	.	.								.	.	.	.	.	.	.										.	.													.
Template Conservation							.
Template Sequence		Q	V	T	E	Q	.	L	S	E	H	Q	C	E	G	F	L	E	A	Y	L	L	T	G	R	H	G	I	W	S	S	Y	E	S	F	V	H	V	I	D	S	M	L	N	Q	H	A	K	W	L	E	A	T	V	R	E	I	P	W	R	K	P	I	S	S	V	N	L	L	V	S	S	H	V	W	R	Q	D	H	N	G
Template Known Secondary structure		S					.	S															T	T									G	G	G	G	G	G	G																			T	T	S				B								S		G	G	G		T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		472	.	.	.	.		.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440						.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.			.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.																																													.	.																	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.																																													.	.																	.
Query Sequence		Q	T	H	Q	G	A	F	D	L	S	Y	L	.	.	.	.	.	R	C	I	P	E	M	V	I	M	T	P	S	D	E	N	E	C	R	Q	M	L	Y	T	G	Y	H	Y	N	D	G	P	S	A	V	R	Y	P	R	G	N	A	V	G	V	.	.	E	L	T	P	L	E	K	L	P	I	G	K	G	I	V	K	.
Query Conservation														.	.	.	.	.																																													.	.																	.
Alig confidence														.	.	.	.	.																																													.	.																	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	H	Q	D	P	G	V	T	S	L	L	I	N	K	T	F	N	N	D	H	V	T	N	I	Y	F	A	T	D	A	N	M	L	L	A	I	S	E	K	C	F	K	S	T	N	K	I	N	A	I	F	A	G	K	Q	P	A	P	T	W	V	T	L	D	E	A	R	A	E	L	E	A	G	A	A	E	W	K	W
Template Known Secondary structure		G	G	G				T							T	T			T	T											S															B	S										S						S												S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
								501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.		.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.																.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	R	R	G	E	K	L	A	I	L	N	F	G	T	L	M	P	E	.	A	A	K	V	A	E	S	L	N	A	T	L	V	D	M	R	F	V	K	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	A	L	I	L	E	M	A	A	S	H	E	A	L	V	T	V	E	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	N	A	E	N	N	D	E	V	Q	V	V	L	A	S	A	G	D	V	P	T	Q	E	L	M	A	A	S	D	A	L	N	K	M	G	I	K	F	K	V	V	N	V	V	D	L	L	K	L	Q	S	R	E	N	N	D	E	A	L	T	D	E	E	F	T	E	L	F	T	A	D	K	P	V	L	F	A	Y	H
Template Known Secondary structure		T				S	S	T	T	T		S							S																	T	T										B	G	G	G	G	S		T	T	T		T	T	S												S	S	S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		631	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	I	M	G	G	A	G	S	G	V	N	E	V	L	M	A	H	R	K	P	V	P	V	L	N	I	G	L	P	D	F	F	I	P	Q	G	T	Q	E	E	M	R	A	E	L	G	L	D	A	A	G	M	E	A	K	I	K	A	W	L	A
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.																							.
Template Conservation				.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		S	Y	.	.	.	.	.	A	Q	D	V	R	G	L	I	Y	D	R	P	N	H	D	N	F	H	V	V	G	Y	.	K	E	Q	G	S	T	T	T	P	F	D	M	V	R	V	N	D	M	D	R	Y	A	L	Q	A	A	A	L	K	L	I	D
Template Known Secondary structure		S		.	.	.	.	.								T	T	T	S	T	T	G	G	G							.		S				S										T	T		S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		711	.						.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.		.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.