Job Description P77488 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:29:48 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 541 % Identity 22% Template c2r8pA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:transketolase 1; PDBTitle: transketolase from e. coli in complex with substrate d-2 fructose-6-phosphate Resolution 1.65 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.		.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.										.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.				.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure																				.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.											.	.
Query SS confidence																				.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.											.	.
Query Sequence		L	P	K	L	C	D	E	L	R	R	Y	L	L	D	S	V	S	R	.	S	S	G	H	F	A	S	G	L	G	T	V	E	L	T	V	A	L	H	Y	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	P	F	D	Q	L	I	W	D	V	G	H	Q	A	.	.	.	Y	P	H	K	I	L	T	G	R	R	.	.
Query Conservation																				.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.											.	.
Alig confidence																				.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.											.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	K	E	L	A	N	A	I	R	A	L	S	M	D	A	V	Q	K	A	K	S	G	H	P	G	A	P	M	G	M	A	D	I	A	E	V	L	W	R	D	F	L	K	H	N	P	Q	N	P	S	W	A	D	R	D	R	F	V	L	S	N	G	H	G	S	M	L	I	Y	S	L	L	H	L	T	G	Y	D	L	P
Template Known Secondary structure																					T		S																			T					T	T		T	T		T	T							S	S	G	G	G												T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
			93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.		.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.											.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure		.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	K	I	G	T	I	R	Q	K	G	G	.	L	H	P	F	P	W	R	G	E	S	E	Y	D	V	L	S	V	G	H	S	S	T	S	I	S	A	G	I	G	I	A	V	A	A	E	K	E	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	R	T	V	C	V	I	G	D	G	A	I	T	A	G	M	A
Query Conservation		.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	E	E	L	K	N	F	R	Q	L	H	S	K	T	P	G	H	P	E	V	G	Y	T	A	G	V	E	T	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	A	N	A	V	G	M	A	I	A	E	K	T	L	A	A	Q	F	N	R	P	G	H	D	I	V	D	H	Y	T	Y	A	F	M	G	D	G	C	M	M	E	G	I	S
Template Known Secondary structure						T	T	T	T	S	T	T		S			S	S			T	T	T	S	T	T			S				S	T	T																						B	T	T	B																		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																							.
Query SS confidence														.																							.
Query Sequence		F	E	A	M	N	H	A	G	D	I	R	P	.	D	M	L	V	I	L	N	D	N	E	M	S	I	S	E	N	V	G	A	L	N	N	.	H	L	A	Q	L	L	S	G	K	L	Y	S	S	L	R	E	G	G	K	K	V	F	S	G	V	P	P	I	K	E	L	L	K	R	T	E	E	H	I	K	G	M	V	V
Query Conservation														.																							.
Alig confidence														.																							.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	E	V	C	S	L	A	G	T	L	K	L	G	K	L	I	A	F	Y	D	D	N	G	I	S	I	D	G	H	V	E	G	W	F	T	D	D	T	A	M	R	F	E	A	Y	G	W	H	V	I	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T		T	T									S			T	T			G	G	G	T												T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.		.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	T	L	F	E	E	L	G	F	N	Y	I	G	P	V	D	G	H	D	V	L	G	L	I	T	T	L	K	N	M	R	D	L	K	.	G	P	Q	F	L	H	I	M	T	K	K	G	R	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	G	H	D	A	A	S	I	K	R	A	V	E	E	A	R	A	V	T	D	K	P	S	L	L	M	C	K	T	I	I	G	F	G	S	P	N	K	A	G	T	H	D	S	H	G	A	P	L	G	D	A	E	I	A	L	T	R	E	Q	L	G	W	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T																	S	S										T	T	T	T		T	T	T	T	T	S	G	G	G	T	S	S															T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
																																									289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310						.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	A	E	K	D	P	I	T	F	H	A	V	P	K	F	D	P	S	S	G	C	.	.	.	.	.	L	P	K	S	S	G	G	L	P	S	Y	S	K	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	P	F	E	I	P	S	E	I	Y	A	Q	W	D	A	K	E	A	G	Q	A	K	E	S	A	W	N	E	K	F	A	A	Y	A	K	A	Y	P	Q	E	A	A	E	F	T	R	R	M	K	G	E	M	P	S	D	F	D	A	K	A	K	E	F	I	A	K	L	Q	A	N	P	A	K	I	A	S	R	K	A
Template Known Secondary structure				T	T																																															T				T	T															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350						.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.		.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.																																		.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.																																		.
Query Sequence		F	G	D	W	L	C	E	T	A	A	K	D	N	K	L	M	A	I	T	P	A	M	R	E	G	S	.	.	.	.	.	G	M	V	E	F	S	R	K	F	P	D	R	Y	F	D	V	A	I	A	E	Q	H	A	V	T	F	A	A	G	L	A	I	G	.	G	Y	K	P	I	V	A	I	Y	S	T	F	L	Q	R
Query Conservation																												.	.	.	.	.																																		.
Alig confidence																												.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	N	A	I	E	A	F	G	P	L	L	P	E	F	L	G	G	S	A	D	L	A	P	S	N	L	T	L	W	S	G	S	K	A	I	N	E	D	A	A	G	N	Y	I	H	Y	G	V	R	E	F	G	M	T	A	I	A	N	G	I	S	L	H	G	G	F	L	P	Y	T	S	T	F	L	M	F	V	E	Y
Template Known Secondary structure										T	T	T		T	T						S	S						T				T	T			B	T	T	T		T	T		S						S																S	S									G	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.
Query SS confidence																											.
Query Sequence		A	Y	D	Q	V	L	H	D	V	A	I	Q	K	L	P	V	L	F	A	I	D	R	A	G	I	.	V	G	A	D	G	Q	T	H	Q	G	A	F	D	L	S	Y	L	R	C	I	P	E	M	V	I	M	T	P	S	D	E	N	E	C	R	Q	M	L	Y	T	G	Y	H	Y	N	D	G	P	S	A	V	R	Y	P
Query Conservation																											.
Alig confidence										.																	.
Template Conservation										.
Template Sequence		A	R	N	A	V	R	M	A	.	A	L	M	K	Q	R	Q	V	M	V	Y	T	H	D	S	I	G	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	V	E	Q	V	A	S	L	R	V	T	P	N	M	S	T	W	R	P	C	D	Q	V	E	S	A	V	A	W	K	Y	G	V	E	R	Q	D	G	P	T	A	L	I	L	S
Template Known Secondary structure		T								.			T	T											S	G	G	G		T	T		T	T	T			S	S							T	S	T	T							S	S															S	S	S
Template Predicted Secondary structure										.
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.		.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.				.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.						.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																.	.	.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																.	.	.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		R	G	N	A	V	G	V	E	L	T	P	L	.	E	K	L	P	I	G	K	G	I	V	K	R	R	G	E	.	.	.	K	L	A	I	L	N	F	G	T	L	M	P	E	A	A	K	V	A	E	S	L	.	.	.	.	.	N	A	T	L	V	D	M	R	F	V	K	P	L	D	E	A	L	I	L	E	M	A	A
Query Conservation														.																.	.	.																						.	.	.	.	.
Alig confidence														.																.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	Q	N	L	A	Q	Q	E	R	T	E	E	Q	L	A	N	I	A	R	G	G	Y	V	L	K	D	C	A	G	Q	P	E	L	I	F	I	A	T	G	S	E	V	E	L	A	V	A	A	Y	E	K	L	T	A	E	G	V	K	A	R	V	V	S	M	P	S	T	D	A	F	D	K	Q	D	A	A	Y	R	E	S
Template Known Secondary structure		S	S															G	G	G	S								S	S	S		S							G	G	G															T									S							T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	H	E	A	L	V	T	V	E	E	N	A	I	M	G	G	A	G	S	G	V	N	E	V	L	M	A	H	R	K	P	V	P	V	L	N	I	G	L	P	D	F	F	I	P	Q	G	T	Q	E	E	M	R	A	E	L	G	L	D	A	A	G	M	E	A	K	I	K	A	W	L
Query Conservation
Alig confidence									.																							.	.	.	.	.					.
Template Conservation									.																							.	.	.	.	.					.
Template Sequence		V	L	P	K	A	V	T	.	A	R	V	A	V	E	A	G	I	A	D	Y	W	Y	K	Y	V	G	L	N	G	A	.	.	.	.	.	I	V	G	M	.	T	T	F	G	E	S	A	P	A	E	L	L	F	E	E	F	G	F	T	V	D	N	V	V	A	K	A	K	E	L	L
Template Known Secondary structure			S		T	T			.										G	G	G	G					T	T	S	S		.	.	.	.	.					.		S				S	S									T	T		S
Template Predicted Secondary structure									.																							.	.	.	.	.					.
Template SS confidence
		600	.	.	.	.	.	.		.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.						.	630	.	.		.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.