Job Description P77488 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:29:48 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 534 % Identity 24% Template c2e6kB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: x-ray structure of thermus thermopilus hb8 tt0505 Resolution 2.09 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		26	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.		.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.										.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.				.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure									.															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Query SS confidence									.															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Query Sequence		E	S	L	P	K	L	C	.	D	E	L	R	R	Y	L	L	D	S	V	S	R	S	.	S	G	H	F	A	S	G	L	G	T	V	E	L	T	V	A	L	H	Y	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	P	F	D	Q	L	I	W	D	V	G	H	Q	A	.	.	.	Y	P	H	K	I	L	T	G	R
Query Conservation									.															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Alig confidence									.															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	D	L	E	T	L	S	V	N	A	I	R	F	L	A	I	D	A	V	E	K	A	R	S	G	H	P	G	X	P	X	G	X	A	P	L	A	Y	L	L	F	R	E	V	X	R	H	N	P	L	D	P	D	W	P	D	R	D	R	F	V	L	S	A	G	H	G	S	X	L	L	Y	A	V	L	H	L	T	G	Y
Template Known Secondary structure																								T		S																		T	T					T	T		T	T		T	T	S						S	S	G	G	G											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		92				.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.		.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.											.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	.	.	.	D	K	I	G	T	I	R	Q	K	G	G	.	L	H	P	F	P	W	R	G	E	S	E	Y	D	V	L	S	V	G	H	S	S	T	S	I	S	A	G	I	G	I	A	V	A	A	E	K	E	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	R	T	V	C	V	I	G	D	G	A	I	T	A
Query Conservation			.	.	.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.												.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	P	L	E	E	L	K	S	F	R	Q	W	G	S	K	T	P	G	H	P	E	R	G	H	T	P	G	V	E	V	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	S	T	A	V	G	L	A	L	A	E	R	K	L	A	A	E	F	N	R	P	G	H	V	V	V	D	H	Y	T	Y	V	L	A	S	D	G	D	L	X	E
Template Known Secondary structure		S							T	T	T	T		T	T		S			S	S			T	T	T	S	T	T			S				S	T	T																						B	T	T	B																		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.		.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.																				.
Query SS confidence																	.																				.
Query Sequence		G	M	A	F	E	A	M	N	H	A	G	D	I	R	P	.	D	M	L	V	I	L	N	D	N	E	M	S	I	S	E	N	V	G	A	.	L	N	N	H	L	A	Q	L	L	S	G	K	L	Y	S	S	L	R	E	G	G	K	K	V	F	S	G	V	P	P	I	K	E	L	L	K	R	T	E	E	H	I	K	G
Query Conservation																	.																				.
Alig confidence																	.																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	S	G	E	A	A	S	L	A	G	H	W	G	L	S	K	L	I	V	F	W	D	D	N	R	I	S	I	D	G	P	T	D	L	A	F	T	E	D	V	L	A	R	Y	R	A	Y	G	W	Q	T	L	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		T	T												T	T			G	G	G	T			S									T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	V	V	P	G	T	L	F	E	E	L	G	F	N	Y	I	G	P	V	D	G	H	D	V	L	G	L	I	T	T	L	K	N	M	R	D	L	K	G	P	Q	F	L	H	I	M	T	K	K	G	R	G	Y	E	P	A	E	K	D	P	I	T	F	H	A	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	V	N	D	L	E	A	L	R	K	A	I	K	L	A	K	L	D	E	R	P	T	L	I	A	V	R	S	H	I	G	F	G	S	P	K	.	.	Q	D	S	A	K	A	H	G	E	P	L	G	P	E	A	V	E	A	T	R	R	N	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T															S	S	S										T	T	T	T	S	T	T	.	.	T	T	S	G	G	G	T	S	S														T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template SS confidence
																				220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.			.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																							303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	D	P	S	S	G	C	L	P	K	S	S	G	G	L	P	S	Y	S	K	I	F	G	D	W	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	W	P	Y	P	P	F	V	V	P	E	E	V	Y	R	H	X	D	X	R	E	K	G	R	A	W	Q	E	A	W	E	K	A	L	E	A	Y	A	R	A	Y	P	D	L	H	Q	E	L	X	R	R	L	R	G	E	L	P	P	L	P	E	E	P	P	S	F	D	K	P	I	A	T	R	A	A	S	G	R	A	L
Template Known Secondary structure		T					T	T																																														T	T								S						S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.						.	.	.	.	.	.	.	360		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.									.																									.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.									.																									.
Query Sequence		C	E	T	A	A	K	D	N	K	L	M	A	I	T	P	A	M	R	E	G	S	G	M	.	.	.	.	.	V	E	F	S	R	K	F	P	.	D	R	Y	F	D	V	A	I	A	E	Q	H	A	V	T	F	A	A	G	L	A	I	G	G	.	Y	K	P	I	V	A	I	Y	S	T	F	L	Q	R	A	Y	D	Q
Query Conservation																									.	.	.	.	.									.																									.
Alig confidence																									.	.	.	.	.									.																									.
Template Conservation
Template Sequence		N	L	L	A	P	R	L	P	E	L	L	G	G	S	A	D	L	T	P	S	N	N	T	K	A	E	G	X	E	D	F	S	R	A	N	P	L	G	R	Y	L	H	F	G	V	R	E	H	A	X	G	A	I	L	N	G	L	N	L	H	G	G	Y	R	A	Y	G	G	T	F	L	V	F	S	D	Y	X	R	P	A
Template Known Secondary structure					G	G	G		T	T						S	S						T		S		T	T			B			S	S		T	T								S																S	S									G	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		V	L	H	D	V	A	I	Q	K	L	P	V	L	F	A	I	D	R	A	G	I	.	V	G	A	D	G	Q	T	H	Q	G	A	F	D	L	S	Y	L	R	C	I	P	E	M	V	I	M	T	P	S	D	E	N	E	C	R	Q	M	L	Y	T	G	Y	H	Y	N	D	G	P	S	A	V	R	Y	P	R	G	N	A
Query Conservation																							.
Alig confidence		.																					.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	I	R	L	A	A	L	X	G	V	P	T	V	F	V	F	T	H	D	S	I	A	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	V	E	H	L	X	S	L	R	A	X	P	N	L	F	V	I	R	P	A	D	A	Y	E	T	F	Y	A	W	L	V	A	L	R	R	K	E	G	P	T	A	L	V	L	T	R	Q	A	V
Template Known Secondary structure		.								T											S	G	G	G		T	T		T	T	T	S		S	S							T	S	T	T							S	S																S	S								S	S		B
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500		.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.						.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.				.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Predicted Secondary structure																					.																										.	.	.	.	.													.	.	.
Query SS confidence																					.																										.	.	.	.	.													.	.	.
Query Sequence		V	G	V	E	L	T	P	L	E	K	L	P	I	G	K	G	I	V	K	.	R	R	G	E	K	L	A	I	L	N	F	G	T	L	M	P	E	A	A	K	V	A	E	S	L	.	.	.	.	.	N	A	T	L	V	D	M	R	F	V	K	P	.	.	.	L	D	E	A	L	I	L	E	M	A	A	S	H	E	A
Query Conservation																					.																										.	.	.	.	.													.	.	.
Alig confidence																					.																										.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	L	S	P	E	K	A	R	G	L	L	R	G	G	Y	V	L	E	D	V	E	E	P	Q	G	V	L	V	A	T	G	S	E	V	H	L	A	L	R	A	Q	A	L	L	R	E	K	G	V	R	V	R	V	V	S	L	P	S	F	E	L	F	A	A	Q	P	E	A	Y	R	K	E	V	L	P	P	G	L	P
Template Known Secondary structure						T	T	G	G	G	G	G	G	G	S	S							S	S		S							T	T															T	T									S							T	S									S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.
		553	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	T	V	E	E	N	A	I	M	G	G	A	G	S	G	V	N	E	V	L	M	A	H	R	K	P	V	P	V	L	N	I	G	L	P	D	F	F	I	P	Q	G	T	Q	E	E	M	R	A	E	L	G	L	D	A	A	G	M	E	A	K	I	K	A	W	L
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		V	V	A	V	E	A	G	A	S	L	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	Y	A	H	K	V	V	A	L	.	D	R	F	G	A	S	A	P	Y	P	E	V	Y	E	R	L	G	F	T	P	E	R	V	A	E	A	F	L	S	L	V
Template Known Secondary structure							S	S			T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T		S						.		S				S			T	T						T	T		S										T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
		599	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610														.	.	.	.	.	.	.	.	.	620		.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.