Job Description P0AFG3 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:33 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 468 % Identity 13% Template c3mosA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: the structure of human transketolase Resolution 1.75 Å

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		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.
Query SS confidence																																																												.
Query Sequence		S	H	L	E	I	V	S	P	V	V	I	G	S	V	R	A	R	L	D	R	L	D	E	P	S	S	N	K	V	L	P	I	T	I	H	G	D	A	A	V	T	G	Q	G	V	V	Q	E	T	L	N	M	S	K	A	R	G	Y	.	E	V	G	G	T	V	R	I	V	I	N	N	Q	V	G	F	T	T	S	N	P
Query Conservation																																																												.
Alig confidence																										.	.								.	.							.																	.			.	.	.															.
Template Conservation																										.	.								.	.							.																				.	.	.															.
Template Sequence		G	S	L	G	Q	G	L	G	A	A	C	G	M	A	Y	T	G	K	Y	F	D	K	A	S	.	.	Y	R	V	Y	C	L	L	.	.	G	D	G	E	L	S	.	E	G	S	V	W	E	A	M	A	F	A	S	I	Y	K	L	D	N	L	.	.	.	V	A	I	L	D	I	N	R	L	G	Q	S	D	P	.	A
Template Known Secondary structure			S	T	T																T	S			S	.	.								.	.		T	G	G	G	G	.	S													T	T		T	T		.	.	.								S	B		S	S	S	B	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.								.	.							.																				.	.	.															.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.			.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.				.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	A	R	S	T	P	Y	C	T	D	I	G	K	M	V	Q	A	P	I	F	H	V	N	A	D	D	P	E	A	V	A	F	V	T	R	L	A	L	D	F	R	N	T	F	K	R	D	V	F	I	D	L	V	C	Y	R	R	H	G	H	N	E	A	D	E	P	S	A	T	Q	P	L	M	Y	Q	K	I	K	K
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	Q	H	Q	M	D	I	Y	Q	K	R	C	E	A	F	G	W	H	A	I	I	V	D	G	H	S	V	E	E	L	C	K	A	F	G	Q	A	K	.	.	.	.	.	.	H	Q	P	T	A	I	I	A	K	T	F	K	G	R	G	I	T	G	V	E	D	K	E	S	W	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T												T	T								T	T											S			.	.	.	.	.	.	S	S										T	T	T	T	S	T	T	T	T	T		S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.							.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	P	T	P	R	K	I	Y	A	D	K	L	E	Q	E	K	V	A	T	L	E	D	A	T	E	M	V	N	L	Y	R	D	A	L	D	A	G	D	C	V	V	A	E	W	R	P	M	N	M	H	S	F	T	W	S	P	Y	L	N	H	E	W	D	E	E	Y	P	N	K	V	E	M	K	R	L	Q	E	L	A	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	P	L	P	K	N	M	A	E	Q	I	I	Q	E	I	Y	S	Q	I	Q	S	K	K	K	I	L	A	T	P	P	Q	E	D	A	P	S	V	D	I	A	N	I	R	M	P	S	L	P	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																		T										B												S					S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	S	T	V	P	E	A	V	E	M	Q	S	R	V	A	K	I	Y	G	D	R	Q	A	M	A	A	G	E	K	L	F	D	W	G	G	A	E	N	L	A	Y	A	T	L	V	D	E	G	I	P	V	R	L	S	G	E	D	S	G	R	G	T	F	F	H	R	H	A	V	I	H	N	Q	S	N	G	S	T	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	G	D	K	I	A	T	R	K	A	Y	G	Q	A	L	A	K	L	G	H	A	S	D	R	I	I	A	L	D	G	D	T	K	N	S	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T		B																			T	T						S	S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																												310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
		640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	L	Q	H	I	H	N	G	Q	G	A	F	R	V	W	D	S	V	L	S	E	E	A	V	L	A	F	E	Y	G	Y	A	T	A	E	P	R	T	L	T	I	W	E	A	Q	F	G	D	F	A	N	G	A	Q	V	V	I	D	Q	F	I	S	S	G	E	Q	K	W	G	R	M	C	G	L	V	M	L	L	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.									.																															.	.												.	.	.									.	.	.	.
Template Conservation		.	.									.																															.	.												.	.	.									.	.	.	.
Template Sequence		.	.	S	E	I	F	K	K	E	H	.	P	D	R	F	I	E	C	Y	I	A	E	Q	N	M	V	S	I	A	V	G	C	A	T	R	N	R	T	V	P	F	.	.	C	S	T	F	A	A	F	F	T	R	A	.	.	.	F	D	Q	I	R	M	A	A	.	.	.	.	I	S	E	S	N	I	N	L	C	G	S
Template Known Secondary structure		.	.									.	G	G	G						S														G	G	G						.	.					G	G	G	G	G	G	G	.	.	.									.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.									.																															.	.												.	.	.									.	.	.	.
Template SS confidence
				348	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.			.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.				.	.	.	400	.	.	.	.					.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
		720				.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.
Query SS confidence			.	.	.
Query Sequence		H	.	.	.	G	Y	E	G	Q	G	P	E	H	S	S	A	R	L	E	R	Y	L	Q	L	C	A	E	Q	N	M	Q	V	C	V	P	S	T	P	A	Q	V	Y	H	M	L	R	R	Q	A	L	R	G	M	R	R	P	L	V	V	M	S	P	K	S	L	L	R	H	P	L	A	V	S	S	L	E	E	L	A	N
Query Conservation			.	.	.
Alig confidence			.	.	.																			.	.																													.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.																													.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	C	G	V	S	I	G	E	D	G	P	S	Q	M	A	L	E	D	L	A	M	F	.	.	R	S	V	P	T	S	T	V	F	Y	P	S	D	G	V	A	T	E	K	A	V	E	L	A	A	N	T	K	.	.	G	I	C	F	I	R	T	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	N	A	I	I	Y	N
Template Known Secondary structure		S	B	S	G	G	G		T	T		G	G	G		B	S	S						.	.		T	S	T	T								S													T			.	.	S								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			B			S
Template Predicted Secondary structure																								.	.																													.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.			.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.			.	.	.	.	470	.	.	.	.										.	.	.	.	.	480	.	.
		797	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.			.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.		.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																					.
Query SS confidence																			.	.																					.
Query Sequence		G	T	F	L	P	A	I	G	E	I	D	E	L	D	P	K	G	.	.	V	K	R	V	V	M	C	S	G	K	V	Y	Y	D	L	L	E	Q	R	R	.	K	N	N	Q	H	D	V	A	I	V	R	I	E	Q	L	Y	P	F	P	H	K	A	M	Q	E	V	L	Q	Q	F	A	H	V	K	D	F	V	W	C	Q
Query Conservation																			.	.																					.
Alig confidence																			.	.																					.																																		.	.
Template Conservation																																																																											.	.
Template Sequence		N	N	E	D	F	Q	V	G	Q	A	K	V	V	L	K	S	K	D	D	Q	V	T	V	I	G	A	G	V	T	L	H	E	A	L	A	A	A	E	L	L	K	K	E	K	I	N	I	R	V	L	D	P	F	T	I	K	P	L	D	R	K	L	I	L	D	S	A	R	A	T	K	G	R	.	.	I	L	T	V	E
Template Known Secondary structure		T	T					T	T									S	S									T															T	T	T									S				S													T	T	T		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.			.	.	.	.	560
		874	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	P	L	N	Q	G	A	W	Y	C	S	Q	H	H	F	R	E	V	I	P	F	G	A	S	L	R	Y	A	G	R	P	A	S	A	S	P	A	V
Query Conservation
Alig confidence																						.	.
Template Conservation																						.	.
Template Sequence		D	H	Y	Y	E	G	G	I	G	E	A	V	S	S	A	V	V	G	E	P	.	.	G	I	T	V	T	H	L	A	V	N	R	V	P	R	S	G	K
Template Known Secondary structure					S	T	T	S										T	T		T	.	.	T										S					S
Template Predicted Secondary structure																						.	.
Template SS confidence
		561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580			.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.