Job Description P0AFG3 Confidence 99.97% Date Wed Jan 25 15:20:33 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 475 % Identity 14% Template c3komB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: crystal structure of apo transketolase from francisella tularensis Resolution 1.60 Å

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		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query Sequence		F	N	P	S	H	L	E	I	V	S	P	V	V	I	G	S	V	R	A	R	L	D	R	L	D	.	.	.	.	.	.	.	E	P	S	S	N	K	V	L	P	I	T	I	H	G	D	A	A	V	T	G	Q	G	V	V	Q	E	T	L	N	M	S	K	A	R	G	Y	E	.	V	G	G	T	V	R	I	V	I	N
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.																																						.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.												.	.				.			.																		.		.	.	.
Template Conservation																																													.	.				.			.																				.	.	.
Template Sequence		T	T	T	G	P	L	G	Q	G	V	A	N	A	V	G	X	A	L	G	E	K	L	L	S	D	R	Y	N	T	P	D	L	K	V	I	D	H	H	T	Y	V	F	L	.	.	G	D	G	.	L	X	.	E	G	V	S	H	E	A	C	S	L	A	G	T	L	G	L	N	K	L	.	.	.	V	A	F	W	D	D
Template Known Secondary structure		S				S	T	T																						B	T	T	B		S										.	.				.			.	S													T	T		T	T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.				.			.																				.	.	.
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.		.	160		.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.				180	.	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		N	Q	V	G	F	T	T	S	N	P	L	D	A	R	S	T	P	Y	C	T	D	I	G	K	M	V	Q	A	P	I	F	H	V	.	N	A	D	D	P	E	A	V	A	F	V	T	R	L	A	L	D	F	R	N	T	F	K	R	D	V	F	I	D	L	V	C	Y	R	R	H	G	H	N	E	A	D	E	P	S	A
Query Conservation																																			.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.												.																.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template Sequence		N	N	T	K	G	W	F	S	D	N	T	P	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	A	Y	G	W	H	V	I	E	N	V	D	G	H	D	F	V	A	I	E	K	A	I	N	E	A	.	.	.	H	S	Q	Q	Q	K	P	T	L	I	C	C	K	T	V	I	G	F	G	S	P	E	K	A	G	G	S	P
Template Known Secondary structure					T	T	T									.	.	.	.	.	.	.	.				T	T									T	T													.	.	.		T		S	S	S										T	T	T	T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200									.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.				.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.									.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	P	L	M	Y	Q	K	I	K	K	H	P	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	I	Y	A	D	K	L	E	Q	E	K	V	A	T	L	E	D	A	T	E	M	V	N	L	Y	R	D	A	L	D	A	G	D	C	V	V	A	E	W	R	P	M	N	M	H	S	F	T	W	S	P	Y	L	N	H	E
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	D	Q	E	R	A	S	A	A	K	E	L	N	W	D	Y	Q	A	F	E	I	P	Q	D	V	Y	K	Y	W	.	.	.	.	.	.	D	A	R	E	K	G	Q	A	L	E	A	N	W	Q	G	Q	R	N	L	F	K	D	S	P	K	F	D	E	F	E	R	V	L	S	K	E	L	P	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T					T	T											.	.	.	.	.	.																				G	G	G	S	T	T										T				.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.							.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	D	E	E	Y	P	N	K	V	E	M	K	R	L	Q	E	L	A	K	R	I	S	T	V	P	E	A	V	E	M	Q	S	R	V	A	K	I	Y	G	D	R	Q	A	M	A	A	G	E	K	L	F	D	W	G	G	A	E	N	L	A	Y	A	T	L	V	D	E	G	I	P	V	R	L	S	G	E	D	S	G	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	L	E	S	A	I	N	D	Y	I	A	S	Q	L	S	N	P	V	K	V	A	T	R	K	A	S	Q	X	V	L	E	V	L	C	K	N	X	P	E	X	F	G	G	S	A	D	L	T	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T															S				B																		T	T							S			.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template SS confidence
																																335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	F	F	H	R	H	A	V	I	H	N	Q	S	N	G	S	T	Y	T	P	L	Q	H	I	H	N	G	Q	G	A	F	R	V	W	D	S	V	L	S	E	E	A	V	L	A	F	E	Y	G	Y	A	T	A	E	P	R	T	L	T	I	W	E	A	Q	F	G	D	F	A	N	G	A	Q	V	V	I	D	Q	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.								.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.								.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	N	T	N	W	S	G	S	V	W	L	N	N	T	Q	E	G	A	N	Y	L	S	Y	G	V	R	E	F	G	X	A	A	I	X	N	G	L	S	L	Y	G	G	I	K	P	Y	.	.	G	G	T	F	L	V	F	.	.	.	S	D	Y	S	R	N	A	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T			B	T	T	T		S	T	T								S																S	S					.	.					G	G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.								.	.	.
Template SS confidence
															385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.			.	.	.	.	.	.	.				.	440	.	.	.	.	.	.
		701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.		.	.	.		.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.				.																																															.
Query SS confidence																								.				.																																															.
Query Sequence		I	S	S	G	E	Q	K	W	G	R	M	C	G	L	V	M	L	L	P	H	G	Y	.	E	G	Q	.	G	P	E	H	S	S	A	R	L	E	R	Y	L	Q	L	C	A	E	Q	N	M	Q	V	C	V	P	S	T	P	A	Q	V	Y	H	M	L	R	R	Q	A	L	R	G	M	R	R	.	P	L	V	V	M	S
Query Conservation																								.				.																																															.
Alig confidence												.	.	.										.				.														.	.																													.	.		.
Template Conservation												.	.	.																												.	.																													.	.
Template Sequence		R	X	S	A	L	X	K	Q	P	V	.	.	.	V	H	V	X	S	H	D	S	I	G	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	I	E	H	V	P	S	L	.	.	R	L	I	P	N	L	S	V	W	R	P	A	D	T	I	E	T	X	I	A	W	K	E	A	V	K	S	K	.	.	D	T	P	S	V	X	V	L
Template Known Secondary structure							T	T				.	.	.								S	G	G	G		T	T		T	T	T			S	S						.	.		T	S	T	T								S															S	.	.	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.																												.	.																													.	.
Template SS confidence
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.				.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.			.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.			.	.	.	.	.	.	.	.
		778	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.		.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.
Query SS confidence																																																										.
Query Sequence		P	K	S	L	L	R	H	P	L	A	V	S	S	L	E	E	L	A	N	G	T	F	L	P	A	I	G	E	I	D	E	L	D	P	K	G	V	K	R	V	V	M	C	S	G	K	V	Y	Y	D	L	L	E	Q	R	R	.	K	N	N	Q	H	D	V	A	I	V	R	I	E	Q	L	Y	P	F	P	H	K	A	M
Query Conservation																																																										.
Alig confidence																												.	.	.	.	.																										.
Template Conservation																												.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	Q	N	L	X	P	V	V	Q	T	Q	H	Q	V	A	N	I	A	R	G	G	Y	L	V	K	.	.	.	.	.	D	N	P	D	A	K	L	T	I	V	A	T	G	S	E	V	E	L	A	V	K	V	A	N	E	F	E	K	K	G	I	K	L	N	V	A	S	I	P	C	V	E	V	F	A	T	Q	A	H
Template Known Secondary structure			S	S		B														T	T	T						.	.	.	.	.			T	T									T	T															T	T									S							T	S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.						.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
		857	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	E	V	L	Q	Q	F	A	H	V	K	D	F	V	W	C	Q	E	E	P	L	N	Q	G	A	W	Y	C
Query Conservation
Alig confidence												.
Template Conservation												.
Template Sequence		E	Y	K	K	T	V	I	K	D	D	.	I	P	A	V	F	V	E	X	A	Q	P	D	X	W	Y	K	Y
Template Known Secondary structure								T	T	T	T	.	S							S	S			G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.
Template SS confidence
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.		.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.