Job Description P0AFG3 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:33 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 482 % Identity 14% Template c3hylB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: crystal structure of transketolase from bacillus anthracis Resolution 2.16 Å

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		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query Sequence		S	H	L	E	I	V	S	P	V	V	I	G	S	V	R	A	R	L	D	R	L	D	.	.	.	.	.	.	.	E	P	S	S	N	K	V	L	P	I	T	I	H	G	D	A	A	V	T	G	Q	G	V	V	Q	E	T	L	N	M	S	K	A	R	G	Y	.	E	V	G	G	T	V	R	I	V	I	N	N	Q	V
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.																																					.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.												.	.							.																	.			.	.	.
Template Conservation																																										.	.							.																				.	.	.
Template Sequence		G	P	L	G	Q	G	I	A	T	A	V	G	X	A	X	A	E	R	H	L	A	A	K	Y	N	R	D	A	Y	N	I	V	D	H	Y	T	Y	A	I	C	.	.	G	D	G	D	L	X	.	E	G	V	S	A	E	A	S	S	L	A	A	H	L	Q	L	G	R	L	.	.	.	V	V	L	Y	D	S	N	D	I
Template Known Secondary structure			S	T	T																							S	S				S									.	.							.	S													T	T		T	T		.	.	.								S	B
Template Predicted Secondary structure																																										.	.							.																				.	.	.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180				.	.	.	.	.	.	.	.	.
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																																.																																														.	.
Query SS confidence																																.																																														.	.
Query Sequence		G	F	T	T	S	N	P	L	D	A	R	S	T	P	Y	C	T	D	I	G	K	M	V	Q	A	P	I	F	H	V	.	N	A	D	D	P	E	A	V	A	F	V	T	R	L	A	L	D	F	R	N	T	F	K	R	D	V	F	I	D	L	V	C	Y	R	R	H	G	H	N	E	A	D	E	P	S	.	.	A	T
Query Conservation																																.																																														.	.
Alig confidence						.	.																									.																.	.	.																												.	.
Template Conservation						.	.																																									.	.	.
Template Sequence		S	L	D	G	.	.	D	L	N	R	S	F	S	E	S	V	E	D	R	Y	K	A	Y	G	W	Q	V	I	R	V	E	D	G	N	D	I	E	A	I	A	K	A	I	E	E	A	.	.	.	K	A	D	E	K	R	P	T	L	I	E	V	R	T	T	I	G	F	G	S	P	N	K	S	G	K	S	A	S	H	G
Template Known Secondary structure			S	S	S	.	.	B	G	G	G	T													T							S		T	T													.	.	.				T	T	S										T	T	T	T		T	T	T	T	T	S	G	G	G	T	S
Template Predicted Secondary structure						.	.																																									.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.			.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.				.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.																480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	P	L	M	Y	Q	K	I	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	T	P	R	K	I	Y	A	D	K	L	E	Q	E	K	V	A	T	L	E	D	A	T	E	M	V	N	L	Y	R	D	A	L	D	A	G	D	C	V	V	A	E	W	R	P	M	N	M	H	S	F	T	W	S
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	P	L	G	V	E	E	T	K	L	T	K	E	A	Y	A	W	T	A	E	Q	D	F	H	V	A	E	E	V	Y	E	N	F	R	K	T	V	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	V	G	E	T	A	Q	A	E	W	N	T	X	L	G	E	Y	A	Q	A	Y	P	E	L	A	N	E	L	Q	A	A	X	N	G	L
Template Known Secondary structure		S														T	T					S	S	S														T	.	.	.	.	.	.	.																						S												T	T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.								.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		535	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Y	L	N	H	E	W	D	E	E	Y	P	N	K	V	E	M	K	R	L	Q	E	L	A	K	R	I	S	T	V	P	E	A	V	E	M	Q	S	R	V	A	K	I	Y	G	D	R	Q	A	M	A	A	G	E	K	L	F	D	W	G	G	A	E	N	L	A	Y	A	T	L	V	D	E	G	I	P	V	R	L	S
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	E	G	W	E	Q	N	L	P	T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	G	S	K	A	A	T	R	N	S	S	G	A	V	I	N	A	I	A	E	S	V	P	S	F	F	G	G
Template Known Secondary structure				T	T	G	G	G	G					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T																					T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
		615	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	D	S	G	R	G	T	F	F	H	R	H	A	V	I	H	N	Q	S	N	G	S	T	Y	T	P	L	Q	H	I	H	N	G	Q	G	A	F	R	V	W	D	S	V	L	S	E	E	A	V	L	A	F	E	Y	G	Y	A	T	A	E	P	R	T	L	T	I	W	E	A	Q	F	G	D	F	A	N	G	A	Q
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.
Template Sequence		S	A	D	L	A	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	K	T	Y	X	N	N	E	K	D	F	T	R	D	D	Y	S	G	K	N	I	W	Y	G	V	R	E	F	A	X	G	A	A	X	N	G	I	A	L	H	G	G	L	K	T	Y	.	.	G	G	T	F	F	V	F	S	D	Y	L	R
Template Known Secondary structure			S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T				T	T	S		B		B	T	T	B	T	T								S																S	S					.	.					G	G	G
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.														.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.			.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		695	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.		.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.		.
Predicted Secondary structure																													.																																																			.
Query SS confidence																													.																																																			.
Query Sequence		V	V	I	D	Q	F	I	S	S	G	E	Q	K	W	G	R	M	C	G	L	V	M	L	L	P	H	G	.	Y	E	G	Q	G	P	E	H	S	S	A	R	L	E	R	Y	L	Q	L	C	A	E	Q	N	M	Q	V	C	V	P	S	T	P	A	Q	V	Y	H	M	L	R	R	Q	A	L	R	G	M	R	R	.	P
Query Conservation																													.																																																			.
Alig confidence							.	.	.	.	.																		.																		.	.																													.	.		.
Template Conservation							.	.	.	.	.																																				.	.																													.	.
Template Sequence		P	A	I	R	L	.	.	.	.	.	A	A	L	X	Q	L	P	V	T	Y	V	F	T	H	D	S	I	A	V	G	E	D	G	P	T	H	E	P	I	E	Q	L	A	A	L	.	.	R	A	X	P	N	V	S	V	I	R	P	A	D	G	N	E	S	V	A	A	W	R	L	A	L	E	S	T	.	.	N	K	P
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.					T											S	G	G	G	G	G	G		G	G	G	S		S	S						.	.		T	S	T	T							S	S															S	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.																																				.	.																													.	.
Template SS confidence
		444	.	.	.	.						.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.			.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.			.	.	.
		773	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.		.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		L	V	V	M	S	P	K	S	L	L	R	H	P	L	A	V	S	S	L	E	E	L	A	N	G	T	F	L	P	A	I	G	E	I	D	E	L	D	P	K	G	V	K	R	V	V	M	C	S	G	K	V	Y	Y	D	L	L	E	Q	R	R	.	K	N	N	Q	H	D	V	A	I	V	R	I	E	Q	L	Y	P	F
Query Conservation																																																															.
Alig confidence																																				.	.																										.
Template Conservation																																				.	.
Template Sequence		T	A	L	V	L	T	R	Q	D	L	P	T	L	E	G	A	K	D	D	T	Y	E	K	V	A	K	G	A	Y	V	V	S	A	S	.	.	K	K	E	T	A	D	V	I	L	L	A	T	G	S	E	V	S	L	A	V	E	A	Q	K	A	L	A	V	D	G	V	D	A	S	V	V	S	X	P	S	X	D	R	F
Template Known Secondary structure								S	S						G	G	G	S	T	T							T	S								.	.	S	S	S	S		S							G	G	G														T	T									S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.			.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
		852	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	H	K	A	M	Q	E	V	L	Q	Q	F	A	H	V	K	D	F	V	W	C	Q	E	E	P	L	N	Q	G	A	W	Y	C	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	A	Q	T	A	E	Y	K	E	S	V	L	P	K	A	V	T	K	R	F	A	I	E	X	G	A	T	F	G	W	H	R	Y	V
Template Known Secondary structure				S									S		T	T									S	S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.