Job Description P0AFG3 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:33 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 465 % Identity 15% Template c2e6kB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: x-ray structure of thermus thermopilus hb8 tt0505 Resolution 2.09 Å

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		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query Sequence		S	H	L	E	I	V	S	P	V	V	I	G	S	V	R	A	R	L	D	R	L	D	.	.	.	.	.	.	.	E	P	S	S	N	K	V	L	P	I	T	I	H	G	D	A	A	V	T	G	Q	G	V	V	Q	E	T	L	N	M	S	K	A	R	G	Y	.	E	V	G	G	T	V	R	I	V	I	N	N	Q	V
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.																																					.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.												.	.							.																	.			.	.	.
Template Conservation																																										.	.							.																				.	.	.
Template Sequence		G	P	L	G	Q	G	I	S	T	A	V	G	L	A	L	A	E	R	K	L	A	A	E	F	N	R	P	G	H	V	V	V	D	H	Y	T	Y	V	L	A	.	.	S	D	G	D	L	X	.	E	G	V	S	G	E	A	A	S	L	A	G	H	W	G	L	S	K	L	.	.	.	I	V	F	W	D	D	N	R	I
Template Known Secondary structure			S	T	T																						B	T	T	B												.	.							.	S														T		T	T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.							.																				.	.	.
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.			.	.	160	.	.	.		.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.				.	.	.	.	.	.	.	190	.
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		G	F	T	T	S	N	P	L	D	A	R	S	T	P	Y	C	T	D	I	G	K	M	V	Q	A	P	I	F	H	V	.	N	A	D	D	P	E	A	V	A	F	V	T	R	L	A	L	D	F	R	N	T	F	K	R	D	V	F	I	D	L	V	C	Y	R	R	H	G	H	N	E	A	D	E	P	S	A	T	Q	P
Query Conservation																																.
Alig confidence						.	.																									.																.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.																																									.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	I	D	G	.	.	P	T	D	L	A	F	T	E	D	V	L	A	R	Y	R	A	Y	G	W	Q	T	L	R	V	E	D	V	N	D	L	E	A	L	R	K	A	I	K	L	A	.	.	.	.	K	L	D	E	R	P	T	L	I	A	V	R	S	H	I	G	F	G	S	P	K	Q	D	S	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T		.	.		G	G	G	T			S									T	T							S		T	T													.	.	.	.			S	S	S										T	T	T	T	S	T	T	T	T	S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.																																									.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		192	.	.	.			.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.					.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.															500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	M	Y	Q	K	I	K	K	H	P	T	P	R	K	I	Y	A	D	K	L	E	Q	E	K	V	A	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	A	T	E	M	V	N	L	Y	R	D	A	L	D	A	G	D	C	V	V	A	E	W	R	P	M	N	M	H	S	F	T	W	S	P	Y	L
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	A	K	A	H	G	E	P	L	G	P	E	A	V	E	A	T	R	R	N	L	G	W	P	Y	P	P	F	V	V	P	E	E	V	Y	R	H	X	D	X	R	E	K	G	R	A	W	Q	E	A	W	E	K	A	L	E	A	Y	A	R	A	Y	P	D	L	H	Q	E	L	X	R	R	L	R	G	E	L	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	G	G	G	T	S	S														T	T					T	T																																														T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	H	E	W	D	E	E	Y	P	N	K	V	E	M	K	R	L	Q	E	L	A	K	R	I	S	T	V	P	E	A	V	E	M	Q	S	R	V	A	K	I	Y	G	D	R	Q	A	M	A	A	G	E	K	L	F	D	W	G	G	A	E	N	L	A	Y	A	T	L	V	D	E	G	I	P	V	R	L	S	G	E	D
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	P	E	E	P	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	D	K	P	I	A	T	R	A	A	S	G	R	A	L	N	L	L	A	P	R	L	P	E	L	L	G	G	S	A	D
Template Known Secondary structure						S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S		B														G	G	G		T	T						S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	R	G	T	F	F	H	R	H	A	V	I	H	N	Q	S	N	G	S	T	Y	T	P	L	Q	H	I	H	N	G	Q	G	A	F	R	V	W	D	S	V	L	S	E	E	A	V	L	A	F	E	Y	G	Y	A	T	A	E	P	R	T	L	T	I	W	E	A	Q	F	G	D	F	A	N	G	A	Q	V	V	I
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.
Template Sequence		L	T	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	T	K	A	E	G	X	E	D	F	S	R	A	N	P	L	G	R	Y	L	H	F	G	V	R	E	H	A	X	G	A	I	L	N	G	L	N	L	H	G	G	Y	R	A	Y	.	.	G	G	T	F	L	V	F	S	D	Y	X	R	P	A	I
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T		S		T	T			B			S	S		T	T								S																S	S					.	.					G	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.
Template SS confidence
		376	.	.	.														380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.			.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		698	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.			.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.		.	.	770	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.																																											.
Query SS confidence																														.	.																																											.
Query Sequence		D	Q	F	I	S	S	G	E	Q	K	W	G	R	M	C	G	L	V	M	L	L	P	H	G	Y	E	G	Q	.	.	G	P	E	H	S	S	A	R	L	E	R	Y	L	Q	L	C	A	E	Q	N	M	Q	V	C	V	P	S	T	P	A	Q	V	Y	H	M	L	R	R	Q	A	L	R	.	G	M	R	R	P	L	V
Query Conservation																														.	.																																											.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																.	.														.	.																												.		.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.																															.	.																														.	.
Template Sequence		R	L	A	A	L	X	G	.	.	.	.	.	.	V	P	T	V	F	V	F	T	H	D	S	I	A	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	V	E	H	L	X	S	L	.	.	R	A	X	P	N	L	F	V	I	R	P	A	D	A	Y	E	T	F	Y	A	W	L	V	A	L	R	R	K	E	.	.	G	P	T	A
Template Known Secondary structure								T	.	.	.	.	.	.											S	G	G	G		T	T		T	T	T	S		S	S						.	.		T	S	T	T							S	S																S	.	.	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																															.	.																														.	.
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.							.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.			.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.			.	.	.	510
		775	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.			.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.		.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.
Predicted Secondary structure																																									.	.																					.
Query SS confidence																																									.	.																					.
Query Sequence		V	M	S	P	K	S	L	L	R	H	P	L	A	V	S	S	L	E	E	L	A	N	G	T	F	L	P	A	I	G	E	I	D	E	L	D	P	K	G	.	.	V	K	R	V	V	M	C	S	G	K	V	Y	Y	D	L	L	E	Q	R	R	.	K	N	N	Q	H	D	V	A	I	V	R	I	E	Q	L	Y	P	F
Query Conservation																																									.	.																					.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.																					.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	V	L	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	V	P	L	L	S	P	E	K	A	R	G	L	L	R	G	G	Y	V	L	E	D	V	E	E	P	Q	G	V	L	V	A	T	G	S	E	V	H	L	A	L	R	A	Q	A	L	L	R	E	K	G	V	R	V	R	V	V	S	L	P	S	F	E	L	F
Template Known Secondary structure						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B					T	T	G	G	G	G	G	G	G	S	S							S	S		S							T	T															T	T									S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		511	.	.	.	.										.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
		852	.			.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.
Query SS confidence				.	.
Query Sequence		P	H	.	.	K	A	M	Q	E	V	L	Q	Q	F	A	H	V	K	D	F	V	W	C	Q	E	E	P	L	N	Q	G	A	W	Y	C
Query Conservation				.	.
Alig confidence				.	.										.	.	.
Template Conservation															.	.	.
Template Sequence		A	A	Q	P	E	A	Y	R	K	E	V	L	P	.	.	.	P	G	L	P	V	V	A	V	E	A	G	A	S	L	G	W	E	R	Y
Template Known Secondary structure			T	S									S		.	.	.	T	T	S							S	S			T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.
Template SS confidence
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.				.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.