Job Description P0AFG3 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:33 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 477 % Identity 16% Template c1r9jB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: transketolase from leishmania mexicana Resolution 2.22 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query Sequence		F	N	P	S	H	L	E	I	V	S	P	V	V	I	G	S	V	R	A	R	L	D	R	L	D	.	.	.	.	.	.	.	E	P	S	S	N	K	V	L	P	I	T	I	H	G	D	A	A	V	T	G	Q	G	V	V	Q	E	T	L	N	M	S	K	A	R	G	Y	E	.	V	G	G	T	V	R	I	V	I	N
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.																																						.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.												.	.							.																		.		.	.	.
Template Conservation																																													.	.							.																				.	.	.
Template Sequence		V	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	A	N	A	V	G	L	A	I	A	E	A	H	L	A	A	T	F	N	R	P	G	Y	N	I	V	D	H	Y	T	Y	V	Y	C	.	.	G	D	G	C	L	M	.	E	G	V	C	Q	E	A	L	S	L	A	G	H	L	A	L	E	K	L	.	.	.	I	V	I	Y	D	S
Template Known Secondary structure		S				S	T	T																						B	T	T	B												.	.							.	S														T		T	T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.							.																				.	.	.
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.			.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.				.	180	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.			.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.
Query SS confidence																																					.	.
Query Sequence		N	Q	V	G	F	T	T	S	N	P	L	D	A	R	S	T	P	Y	C	T	D	I	G	K	M	V	Q	A	P	I	F	H	V	N	A	.	.	D	D	P	E	A	V	A	F	V	T	R	L	A	L	D	F	R	N	T	F	K	R	D	V	F	I	D	L	V	C	Y	R	R	H	G	H	N	E	A	D	E	P	S
Query Conservation																																					.	.
Alig confidence									.	.																											.	.														.	.	.
Template Conservation									.	.																																										.	.	.
Template Sequence		N	Y	I	S	I	D	G	.	.	S	T	S	L	S	F	T	E	Q	C	H	Q	K	Y	V	A	M	G	F	H	V	I	E	V	K	N	G	D	T	D	Y	E	G	L	R	K	A	L	A	E	A	.	.	.	K	A	T	K	G	K	P	K	M	I	V	Q	T	T	T	I	G	F	G	S	S	K	Q	G	T	E	K
Template Known Secondary structure			S			T	T		.	.		G	G	G	T												T	T							S		T	T	T													.	.	.					S	S										T	T	T	T	S	T	T	T	T	S	G	G
Template Predicted Secondary structure									.	.																																										.	.	.
Template SS confidence
		185	.	.	.	.	190	.			.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.				.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
						468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480												.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	A	T	Q	P	L	M	Y	Q	K	I	K	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	P	R	K	I	Y	A	D	K	L	E	Q	E	K	V	A	T	L	E	D	A	T	E	M	V	N	L	Y	R	D	A	L	D	A	G	D	C	V	V	A	E	W	R	P	M	N	M	H	S	F	T
Query Conservation		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	H	G	A	P	L	G	E	E	D	I	A	N	I	K	A	K	F	G	R	D	P	Q	K	K	Y	D	V	D	D	D	V	R	A	V	F	R	M	H	I	D	K	C	S	A	E	Q	K	A	W	E	E	L	L	A	K	Y	T	A	A	F	P	A	E	G	A	A	F	V	A	Q	M	R	G	E	L	P	S	G	W
Template Known Secondary structure		G	T	S	S														T	T	S		T	T			S																																															T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	S	P	Y	L	N	H	E	W	D	E	E	Y	P	N	K	V	E	M	K	R	L	Q	E	L	A	K	R	I	S	T	V	P	E	A	V	E	M	Q	S	R	V	A	K	I	Y	G	D	R	Q	A	M	A	A	G	E	K	L	F	D	W	G	G	A	E	N	L	A	Y	A	T	L	V	D	E	G	I	P	V	R
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	K	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	S	S	A	I	A	T	R	K	A	S	E	N	C	L	A	V	L	F	P	A	I	P	A	L	M
Template Known Secondary structure		G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S																				T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		340	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	G	E	D	S	G	R	G	T	F	F	H	R	H	A	V	I	H	N	Q	S	N	G	S	T	Y	T	P	L	Q	H	I	H	N	G	Q	G	A	F	R	V	W	D	S	V	L	S	E	E	A	V	L	A	F	E	Y	G	Y	A	T	A	E	P	R	T	L	T	I	W	E	A	Q	F	G	D	F	A	N	G
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template Sequence		G	G	S	A	D	L	T	P	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	R	P	A	S	A	N	L	V	D	F	S	S	S	S	K	E	G	R	Y	I	R	F	G	V	R	E	H	A	M	C	A	I	L	N	G	L	D	A	H	D	G	I	I	P	F	.	.	G	G	T	F	L	N	F	I	G	Y
Template Known Secondary structure					S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S		G	G	G				B			T	T		T	T								S																S	S					.	.					G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template SS confidence
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.												.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.			.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
		693	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.				.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.
Query Sequence		A	Q	V	V	I	D	Q	F	I	S	S	G	E	Q	K	W	G	R	M	C	G	L	V	M	L	L	P	H	G	Y	.	.	.	E	G	Q	G	P	E	H	S	S	A	R	L	E	R	Y	L	Q	L	C	A	E	Q	N	M	Q	V	C	V	P	S	T	P	A	Q	V	Y	H	M	L	R	R	Q	A	L	R	G	M
Query Conservation																																.	.	.
Alig confidence			.	.	.				.					.				.	.													.	.	.																	.	.																													.
Template Conservation			.	.	.				.					.				.	.																																.	.																													.
Template Sequence		A	.	.	.	L	G	A	.	V	R	L	A	.	A	I	S	.	.	H	H	R	V	I	Y	V	A	T	H	D	S	I	G	V	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	V	E	L	V	A	A	L	.	.	R	A	M	P	N	L	Q	V	I	R	P	S	D	Q	T	E	T	S	G	A	W	A	V	A	L	S	S	I	.
Template Known Secondary structure		G	.	.	.				.					.				.	.	T											S	G	G	G		T	T		G	G	G			S	S						.	.			S	T	T								S															T	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.				.					.				.	.																																.	.																													.
Template SS confidence
		439				440	.	.		.	.	.	.		.	.	.			450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480			.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		770	.		.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		R	R	.	P	L	V	V	M	S	P	K	S	L	L	R	H	P	L	A	V	S	S	L	E	E	L	A	N	G	T	F	L	P	A	I	G	E	I	D	E	L	D	P	K	G	V	K	R	V	V	M	C	S	G	K	V	Y	Y	D	L	L	E	Q	R	R	K	N	N	Q	H	D	V	A	I	V	R	I	E	Q	L
Query Conservation				.
Alig confidence		.		.																.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																		.																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	H	T	P	T	V	L	C	L	S	R	Q	N	T	E	P	Q	S	.	G	S	S	I	E	G	V	R	H	G	A	Y	S	V	V	.	.	.	.	.	.	D	V	P	D	L	Q	L	V	I	V	A	S	G	S	E	V	S	L	A	V	D	A	A	K	A	L	S	G	E	L	R	V	R	V	V	S	M	P	C	Q
Template Known Secondary structure		.	T									S	S						T	.	T								T	S						.	.	.	.	.	.			T	T		S							G	G	G											T	T	T	T									S
Template Predicted Secondary structure		.																		.																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.		.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540							.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
		849	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	F	P	H	K	A	M	Q	E	V	L	Q	Q	F	A	H	V	K	D	F	V	W	C	Q	E	E	P	L	N	Q	G	A	W	Y	C	S
Query Conservation
Alig confidence																										.
Template Conservation																										.
Template Sequence		E	L	F	D	A	Q	P	D	T	Y	R	Q	A	V	L	P	A	G	V	P	V	V	S	V	.	E	A	Y	V	S	F	G	W	E	K	Y	S
Template Known Secondary structure						T	S									S		T	T	S						.		S	S			T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																										.
Template SS confidence
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.		.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.