Job Description P0AGC3 Confidence 98.35% Date Thu Jan 5 11:28:44 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 413 % Identity 11% Template d2ooea1 SCOP info alpha-alpha superhelix TPR-like HAT/Suf repeat Resolution 3.00

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		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.					.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.
Query Sequence		T	N	F	V	R	A	N	P	T	L	P	P	A	R	T	L	Q	S	R	F	V	N	E	L	A	R	R	E	D	W	R	G	L	L	A	F	S	P	E	.	.	.	.	K	P	G	T	T	E	A	Q	C	N	Y	Y	Y	A	K	W	N	T	G	Q	S	E	E	A	W	Q	G	A	K	E	L	W	L	T	G	K	S
Query Conservation																																									.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.
Template Sequence		E	K	K	L	E	E	N	P	Y	D	L	D	A	W	S	I	L	I	R	E	A	.	.	.	.	Q	N	Q	P	I	D	K	A	R	K	T	Y	E	R	L	V	A	Q	F	P	S	S	G	R	F	W	K	L	Y	I	E	A	E	I	K	A	K	N	Y	D	K	V	E	K	L	F	Q	R	C	L	M	K	V	L	H
Template Known Secondary structure									T	T													.	.	.	.		S	S														T	T		T	T															T	T													T	T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.					.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	P	N	A	C	D	K	L	F	S	V	W	R	A	S	G	K	Q	D	P	L	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	D	L	W	K	C	Y	L	S	Y	V	R	E	T	K	G	K	L	P	S	Y	K	E	K	M	A	Q	A	Y	D	F	A	L	D	K	I	G	M	E	I	M	S	Y	Q	I	W	V	D	Y	I	N	F	L	K	G	V	E	A	V	G	S	Y	A	E	N	Q	R	I	T	A	V	R	R	V	Y	Q	R	G	C	V
Template Known Secondary structure																T	T	T	S	T	T																T	T	T	S	T	T															S				S	S	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
											185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	R	I	R	L	A	M	K	A	G	N	T	G	L	V	T	V	L	A	G	Q	M	P	A	D	Y	Q	T	I	A	S	A	I	I	S	L	A	N	N	P	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	T	F	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	M	I	N	I	E	Q	L	W	R	D	Y	N	K	Y	E	E	G	I	N	I	H	L	A	K	K	M	I	E	D	R	S	R	D	Y	M	N	A	R	R	V	A	K	E	Y	E	T	V	M	K	G	L	D	R	N	A	P	S	V	P	P	Q	P	Q	E	A	Q	Q	V	D	M	W	K	K	Y	I	Q	W	E
Template Known Secondary structure		S			T	T																										T	T																							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.		.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																																																												.
Query SS confidence																																																																												.
Query Sequence		R	T	T	G	A	T	D	F	T	R	Q	M	A	A	V	A	F	A	S	V	A	R	Q	D	A	E	N	A	R	L	M	I	P	S	L	A	Q	A	Q	Q	L	N	E	D	Q	I	Q	E	L	R	D	I	V	A	W	R	L	M	G	N	D	V	T	D	E	Q	A	K	W	R	D	D	A	I	.	M	R	S	Q	S
Query Conservation																																																																												.
Alig confidence																																																																												.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	N	P	L	R	T	E	D	Q	T	L	I	T	K	R	V	M	F	A	Y	E	Q	C	L	L	V	L	G	H	H	P	D	I	W	Y	E	A	A	Q	Y	L	E	Q	S	S	K	L	L	A	E	K	G	D	M	N	N	A	K	L	F	S	D	E	A	A	N	I	Y	E	R	A	I	S	T	L	L	K	K	N
Template Known Secondary structure					S	S			S		S																			T	T																					T	T	T																				T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.																														.	.
Query SS confidence																																				.																														.	.
Query Sequence		T	S	L	I	E	R	R	V	R	M	A	L	G	T	G	D	R	R	G	L	N	T	W	L	A	R	L	P	M	E	A	K	E	K	.	D	E	W	R	Y	W	Q	A	D	L	L	L	E	R	G	R	E	A	E	A	K	E	I	L	H	Q	L	M	Q	.	.	Q	R	G	F	Y	P	M	V	A	A	Q	R	I	G
Query Conservation																																				.																														.	.
Alig confidence																																				.																														.	.													.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		M	L	L	Y	F	A	Y	A	D	Y	E	E	S	R	M	K	Y	E	K	V	H	S	I	Y	N	R	L	L	A	I	E	D	I	D	P	T	L	V	Y	I	Q	Y	M	K	F	A	R	R	A	E	G	I	K	S	G	R	M	I	F	K	K	A	R	E	D	A	R	T	R	H	H	V	Y	V	T	A	A	L	.	.
Template Known Secondary structure															T	T															S	S	S	S																															T		T	T			T									.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.			.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.
Query SS confidence																																																			.	.
Query Sequence		E	E	Y	E	L	K	I	D	K	A	P	Q	N	V	D	S	A	L	T	Q	G	P	E	M	A	R	V	R	E	L	M	Y	W	N	L	D	N	T	A	R	S	E	W	A	N	L	V	K	S	.	.	K	S	K	T	E	Q	A	Q	L	A	R	Y	A	F	N	N	Q	W	W	D	L	S	V	Q	A	T	I	A	G
Query Conservation																																																			.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	E	Y	Y	C	S	K	D	K	S	V	A	F	K	I	F	E	L	G	L	K	K	Y	G	D	I	P	E	Y	V	L	A	Y	I	D	Y	L	S	H	L	N	E	D	N	N	T	R	V	L	F	E	R	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T																		T	T													T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.							.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	L	W	D	H	L	E	E	R	F	P	L	A	Y	N	D	L	F	K	R	Y	T	S	G	K	E	I	P	Q	S	Y	A	M	A	I	A	R	Q	E	S	A	W	N	P	K	V	K	.	.	.	.	.	.	S	P	V	G	A	S	G	L	M	Q	I	M	P	G	T	A	T	H	T
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.
Template Sequence		L	T	S	G	S	L	P	P	E	K	S	G	E	I	W	A	R	F	L	A	F	E	S	N	I	G	.	D	L	A	S	I	L	K	V	E	K	R	R	F	T	A	F	R	E	E	Y	E	G	K	E	T	A	L	L	V	D	R	Y	K	F	M	D	L	Y	P	C	S	A	S	E	L
Template Known Secondary structure				S			S		G	G	G															S	S	.																T					T	T							G	G	G	T		B	T	T	B		S	S
Template Predicted Secondary structure																												.
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.