Job Description P0CE47 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:30:14 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 291 % Identity 24% Template c3b8hA_ PDB info PDB header:biosynthetic protein/transferase Chain: A: PDB Molecule:elongation factor 2; PDBTitle: structure of the eef2-exoa(e546a)-nad+ complex Resolution 2.50 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.		.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.		.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure												.																															.
Query SS confidence												.																															.
Query Sequence		E	K	F	E	R	T	K	P	H	V	.	N	V	G	T	I	G	H	V	D	H	G	K	T	T	L	T	A	A	I	T	T	V	L	A	K	T	Y	G	G	A	.	A	R	A	F	D	Q	I	D	N	A	P	E	E	K	A	R	G	I	T	I	N	T	S	H	V	E	Y	D	T	P	T	R	H	Y	A	H	V	D
Query Conservation												.																															.
Alig confidence												.																															.																								.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.
Template Sequence		R	S	L	M	D	K	V	T	N	V	R	N	M	S	V	I	A	H	V	D	H	G	K	S	T	L	T	D	S	L	V	Q	R	A	G	I	I	S	A	G	I	T	I	K	S	T	A	I	S	L	Y	S	E	M	S	D	E	D	V	K	E	I	K	Q	K	.	.	.	T	D	G	N	S	F	L	I	N	L	I	D
Template Known Secondary structure				T	T	S		G	G	G										G	G	G	T													B								B																				S	S		.	.	.			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.				.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.			.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.															.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.															.	.	.	.
Query Sequence		C	P	G	H	A	D	Y	V	K	N	M	I	T	G	A	A	Q	M	D	G	A	I	L	V	V	A	A	T	D	G	P	M	P	Q	T	R	E	H	I	L	L	G	R	Q	V	G	V	P	Y	I	I	V	F	L	N	K	C	D	M	V	.	.	D	D	E	E	L	L	E	L	V	E	M	E	V	R	.	.	.	.
Query Conservation																																																														.	.															.	.	.	.
Alig confidence																																																		.												.	.															.	.	.	.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		S	P	G	H	V	D	F	S	S	E	V	T	A	A	L	R	V	T	D	G	A	L	V	V	V	D	T	I	E	G	V	C	V	Q	T	E	T	V	L	R	Q	A	L	G	E	R	I	K	.	P	V	V	V	I	N	K	V	D	R	A	L	L	E	L	Q	V	S	K	E	D	L	Y	Q	T	F	A	R	T	V	E
Template Known Secondary structure				S	S	T	T											T		S								T	T	T	B	S														T	T			.														T	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.		.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
													156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	L	S	Q	Y	D	F	P	G	D	D	T	P	I	V	R	G	S	A	L	K	A	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	V	N	V	I	V	S	T	Y	A	D	E	V	L	G	D	V	Q	V	Y	P	A	R	G	T	V	A	F	G	S	G	L	H	G	W	A	F	T	I	R	Q	F	A	T	R	Y	A	K	K	F	G	V	D	K	A	K	M	M	D	R	L	W	G	D	S	F	F	N	P	K	T	K	K	W	T	N	K	D	T	D
Template Known Secondary structure											S		G	G	G							G	G	G	T							T	T	T	T													T	T	T	T	T										S	S	S	S					T	T	T	T				S		S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
															181	.	.	.	.	.	.																																															.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	A	E	W	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	L	E	L	A	G	F	L	D	S	Y	I	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	G	K	P	L	E	R	A	F	N	M	F	I	L	D	P	I	F	R	L	F	T	A	I	M	N	F	K	K	D	E	I	P	V	L	L	E	K	L	E	I	V	L	K	G	D	E	K	D	L	E	G	K	A	L	L	K	V	V	M	R	K	F	L	P	A	A	D	A	L	L	E	M	I	V	L	H	L	P
Template Known Secondary structure		T	T	S		B			B						T													T	T		T	T									T	T					G	G	G	G	G															S	B													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		202	.																										.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	A	I	D	K	P	F	L	L	P	I	E	D	V	F	S	I	S	G	R	G	T	.	V	V	T	G	R	V	E	R	G	I	I	K	V	G	E	E	V	E	I	V	G	I	K	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	V	T	A	Q	A	Y	R	A	E	Q	L	Y	E	G	P	A	D	D	A	N	C	I	A	I	K	N	C	D	P	K	A	D	L	M	L	Y	V	S	K	M	V	P	T	S	D	K	G	R	F	Y	A	F	G	R	V	F	A	G	T	V	K	S	G	Q	K	V	R	I	Q	G	P	N	Y	V	P	G	K	K
Template Known Secondary structure															B	S	S		T	T	S								T	T		S	S	S	S											B	S	S	T	T											S				T	T								T	T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
			250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.					.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure		.														.	.	.	.
Query SS confidence		.														.	.	.	.
Query Sequence		.	E	T	Q	K	S	T	C	T	G	V	E	M	F	.	.	.	.	R	K	L	L	D	E	G	R	A	G	E	N	V	G	V	L	L	R	G	I	K	R	E	E	I	E	R	G	Q	V	L	A	K	P	G	T	I	K	P
Query Conservation		.														.	.	.	.
Alig confidence		.														.	.	.	.																	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.
Template Sequence		D	D	L	F	I	K	A	I	Q	R	V	V	L	M	M	G	R	F	V	E	P	I	D	D	C	P	A	G	N	I	I	G	L	V	.	.	.	G	I	D	Q	F	L	L	K	T	G	T	L	T	T	S	E	T	A	H	N
Template Known Secondary structure		T	T							S							T	T						S				T	T							.	.	.	S		T	T	T		S	S						S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.
Template SS confidence
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.				.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.