Job Description P0AC41 Confidence 99.57% Date Thu Jan 5 11:17:07 GMT 2012 Rank 98 Aligned Residues 359 % Identity 16% Template c1s3bB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:amine oxidase [flavin-containing] b; PDBTitle: crystal structure of maob in complex with n-methyl-n-2 propargyl-1(r)-aminoindan Resolution 1.65 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.			.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.
Query SS confidence																																								.	.
Query Sequence		E	F	D	A	V	V	I	G	A	G	G	A	G	M	R	A	A	L	Q	I	S	Q	S	G	Q	T	C	A	L	L	S	K	V	F	P	T	R	S	.	.	H	T	V	S	A	Q	G	G	I	T	V	A	L	G	N	T	H	E	D	N	W	E	W	H	M	Y	D	T	V	K	G	S	D	Y	I	G	D	Q	D	A
Query Conservation																																								.	.
Alig confidence																																								.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	C	D	V	V	V	V	G	G	G	I	S	G	M	A	A	A	K	L	L	H	D	S	G	L	N	V	V	V	L	E	A	R	D	R	V	G	G	R	T	Y	T	L	R	N	Q	K	V	K	Y	V	D	L	G	G	S	Y	V	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		B		S							B													T	T								S	S	S	S	S	B	T	T							T	T	T					S	S						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	E	Y	M	C	K	T	G	P	E	A	I	L	E	L	E	H	M	G	L	P	F	S	R	L	D	D	G	R	I	Y	Q	R	P	F	G	G	Q	S	K	N	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	T	Q	N	R	I	L	R	L	A	K	E	L	G	L	E	T	Y	K	V	N	E	V	E	R	L	I	H	H	V	K	G	K	S	Y	P	F	R	G	P	F	P	P	V	W	N	P	I	T	Y	L	D	H	N	N	F	W	R	T	M	D	D	M	G	R	E	I	P	S	D	A	P	W	K	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T											T	T									S	S							T	T							S	S	S					S																			T	T	S		T	T		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
																																																																	129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	A	A	R	T	A	A	A	A	D	R	T	G	H	A	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	A	E	E	W	D	N	M	T	M	K	E	L	L	D	K	L	C	W	T	E	S	A	K	Q	L	A	T	L	F	V	N	L	C	V	T	A	E	T	H	E	V	S	A	L	W	F	L	W	Y	V	K	Q	C	G	G	T	T	R	I	I	S	T	T	N	G	G	Q	E	R	K	F	V	G	G	S	G	Q	V
Template Known Secondary structure		T	T						T	S	B										S	S																S	S		T	T	T	S	B										T	T	T								S	T	T	S	T	T	S				T	T		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	H	T	L	Y	Q	Q	N	L	K	N	H	T	T	I	F	S	E	W	Y	A	L	D	L	V	K	N	Q	D	G	A	V	V	G	C	T	A	L	C	I	E	T	G	E	V	V	Y	F	K	A	R	A	T	V	L	A	T	G	G	A	G	R	I	Y	Q	S	T	T	N	A	H	I	N	T	G	D	G	V	G	M
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																		.																						.
Template Conservation								.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																		.																						.
Template Sequence		S	E	R	I	M	D	.	.	.	L	L	G	D	R	V	K	L	E	R	P	V	I	Y	I	D	Q	T	R	E	N	V	L	V	.	.	.	.	.	.	.	E	T	L	N	H	E	M	Y	E	A	K	Y	V	I	S	A	I	.	P	P	T	L	G	M	K	I	H	F	N	P	P	L	P	M	M	R	N	Q	M	.
Template Known Secondary structure								.	.	.			G	G	G			S	S									S	S	S	S				.	.	.	.	.	.	.			T	T	S						S						S	.		G	G	G	G	G	G	S				S										.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																		.																						.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.				.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.								.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.		.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	R	A	G	V	P	V	Q	D	M	E	M	W	Q	F	H	P	T	G	I	A	G	A	G	V	L	V	T	E	G	C	R	G	E	G	G	Y	L	L	N	K	H	G	E	R	F	M	E	R	Y	A	P	N	A	K	D	L	A	G	R	D	V	V	A	R	S	I	M	I	E	I	R	E	G	R	G	C	D	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																							.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																							.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	I	T	R	V	P	L	G	S	V	I	K	C	I	V	Y	Y	K	E	P	F	W	R	.	K	K	D	Y	C	G	T	M	I	I	D	G	E	E	A	P	V	A	Y	T	L	D	D	T	K	P	E	G	N	Y	A	A	I	M	G	F	I	L	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	T	T	S			B											S	S		G	G	G	.	G	G	T									S	S	S		S		S								T	T	S		S									T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																							.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.		.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		P	W	G	P	H	A	K	L	K	L	D	H	L	G	K	E	V	L	E	S	R	L	.	P	G	I	L	E	L	S	R	T	F	A	H	V	D	P	V	K	E	P	I	P	V	I	P	T	C	H	Y	M	M	G	G	I	P	T	K	V	T	G	Q	A	L	T	V	N	E	K	G	E	D	V	V	V	P	G	L	F
Query Conservation																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.																		.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	K	A	R	K	L	A	R	L	T	K	E	E	R	L	K	K	L	C	E	L	Y	A	K	V	L	G	S	L	E	A	L	E	P	V	H	Y	E	E	K	N	W	C	E	E	Q	Y	S	G	G	C	Y	T	T	Y	F	P	P	G	I	L	T	Q	Y	G	R	V	L	R	Q	P	V	D	R	I	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.						T	T	S																		T		G	G	G	G			S							G	G	G		T	T	T		S	S	S		B				T	T						G	G	G	T	T			B	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	G	E	I	A	C	V	S	V	H	G	A	N	R	L	G	G	N	S	L	L	D	L	V	V	F	G	R	A	A	G	L	H	L	Q	E	S	I	A	E	Q	G	A	L	R	D	A	S
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	G	T	E	T	A	T	H	W	S	G	.	.	.	.	.	.	.	Y	M	E	G	A	V	E	A	G	E	R	A	A	R	E	I	L	H	A	M	G	K	I	P	E	D	E	I	W	Q
Template Known Secondary structure				S	G	G	G		S	S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	S																			T	T	S	S		G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.								.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.