Job Description P0AC41 Confidence 99.46% Date Thu Jan 5 11:17:07 GMT 2012 Rank 133 Aligned Residues 267 % Identity 18% Template c1fl2A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:alkyl hydroperoxide reductase subunit f; PDBTitle: catalytic core component of the alkylhydroperoxide reductase ahpf from2 e.coli Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	D	A	V	V	I	G	A	G	G	A	G	M	R	A	A	L	Q	I	S	Q	S	G	Q	T	C	A	L	L	S	K	V	F	P	T	R	S	H	T	V	S	A	Q	G	G	I	T	V	A	L	G	N	T	H	E	D	N	W	E	W	H	M	Y	D	T	V	K	G	S	D	Y	I	G	D	Q	D	A	I	E	Y
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	V	L	I	V	G	S	G	P	A	G	A	A	A	A	I	Y	S	A	R	K	G	I	R	T	G	L	M	G	E	R	.	.	F	G	G	Q	I	L	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S												T	T	T								S	S	.	.	T	T	G	G	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.			.	.	.	.	.	250	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	C	K	T	G	P	E	A	I	L	E	L	E	H	M	G	L	P	F	S	R	L	D	D	G	R	I	Y	Q	R	P	F	G	G	Q	S	K	N	F	G	G	E	Q	A	A	R	T	A	A	A	A	D	R	T	G	H	A	L	L	H	T	L	Y	Q	Q	N	L	K	N	H	T	T	I	F	S	E	W	Y	A	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	I	E	N	Y	I	S	V	P	K	T	E	G	Q	K	L	A	G	A	L	K	V	H	V	D	E	Y	D	V	D	V	I	D	S	Q	S	A	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						B	T	T	B	S	S																T	S							S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																											253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	V	K	N	Q	D	G	A	V	V	G	C	T	A	L	C	I	E	T	G	E	V	V	Y	F	K	A	R	A	T	V	L	A	T	G	G	A	G	R	I	Y	Q	S	T	T	N	A	H	I	N	T	G	D	G	V	G	M	A	I	R	A	G	V	P	V	Q	D	M	E	M	W	Q	F	H	P	T	G	I	A
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	I	P	A	A	V	E	G	G	L	H	Q	I	E	T	A	S	G	A	.	.	.	.	.	V	L	K	A	R	S	I	I	V	A	T	G	A	K	W	R	N	M	N	V	P	G	E	D	Q	Y	R	T	K	G	V	T	Y	C	P	H	C	D	G	P	L	F	K	G	K	R	V	A	V	I	G	G	G	N	S
Template Known Secondary structure							S	S	T	T								T	T	S		.	.	.	.	.																					T	T	T	T	T	T	B	T	T	T			S						G	G	G	G	B	T									S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.						.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	G	V	L	V	T	E	G	C	R	G	E	G	G	Y	L	L	N	K	H	G	E	R	F	M	E	R	Y	A	P	N	A	K	D	L	A	G	R	D	V	V	A	R	S	I	M	I	E	I	R	E	G	R	G	C	D	G	P	W	G	P	H	A	K	L	K	L	D	H	L	G	K	E	V	L	E	S	R	L
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	E	A	A	I	D	L	A	G	I	V	E	H	V	T	L	L	E	F	A	P	E	M	K	A	D	Q	V	L	Q	D	K	L	R	S	L	K	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T	B	S							S	S	S	S			S										T		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	I	L	E	L	S	R	T	F	A	H	V	D	P	V	K	E	P	I	P	V	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	H	Y	M	M	G	G	I	P	T	K	V	T
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	I	L	N	A	Q	T	T	E	V	K	G	D	G	S	K	V	V	G	L	E	Y	R	D	R	V	S	G	D	I	H	N	I	E	L	A	G	I	F	V	Q	I	G	L	L	P	N	T	N	W	L	E	G	A	V	E	R	N	R	M	G	E	I	I	I	D	A	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S									S	S	S	S									T	T	T									S						S					S		G	G	G	T	T	T	S		B		T	T	S		B				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Q	A	L	T	V	N	E	K	G	E	D	V	V	V	P	G	L	F	A	V	G	E	I	A	C	V	S	V	H	G	A	N	R	L	G	G	N	S	L	L	D	L	V	V	F	G	R	A	A	G	L	H	L	Q	E	S	I	A	E	Q	G	A	L
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	V	K	G	V	F	A	A	G	D	C	T	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	K	Q	I	I	I	A	T	G	E	G	A	K	A	S	L	S	A	F	D	Y	L	I	R	T	K	T	A
Template Known Secondary structure			B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	T	T					S	T	T	B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																								S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		476	.											.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.									.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.