![]() |
| ||||||||||||||||||||||||
|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
|   | |
| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | ||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | M | E | N | N | E | I | Q | S | V | L | M | N | A | L | S | L | Q | E | V | H | V | S | . | . | . | . | G | D | G | S | H | F | Q | V | I | A | V | G | E | L | F | D | G | M | S | R | V | K | K | Q | Q | T | V | Y | G | P | L | M | E | Y | I | A | D | N | R | I | H | A | V | S | I | K | A | Y | T | P | A | E | W | A |
| Template Sequence |   | V | S | K | S | I | V | E | E | R | L | R | S | M | L | S | P | Q | F | L | K | V | T | D | N | S | G | G | C | G | A | A | F | N | A | Y | I | V | S | Q | Q | F | E | G | K | G | L | L | D | R | Q | R | L | V | N | S | A | I | A | A | E | M | P | Q | . | . | I | H | A | F | T | M | K | C | L | T | P | G | E | W | E |
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | B | T | T | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | G | G | G | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | T | G | G | G | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||
|   |   | 2 | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 77 | . | . | 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | R | D | R | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | A | K | N | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 80 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |
| Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
|   | ||||||||
|
| |||||||