Job Description P68644 Confidence 99.34% Date Thu Jan 5 12:11:04 GMT 2012 Rank 91 Aligned Residues 318 % Identity 16% Template c1h83A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:polyamine oxidase; PDBTitle: structure of polyamine oxidase in complex with2 1,8-diaminooctane Resolution 1.9 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	I	V	G	A	G	L	A	G	S	V	A	A	L	V	L	A	R	E	G	A	.	Q	V	L	V	I	E	R	G	N	S	A	G	A	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	G	G	R	L	Y	A	H	S	L	E	H	I	I	P	G	F	A	D	S	A	P	V
Query Conservation																								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	I	V	V	G	A	G	M	S	G	I	S	A	A	K	R	L	S	E	A	G	I	T	D	L	L	I	L	E	A	T	D	H	I	G	G	R	M	H	K	T	N	F	A	G	I	N	V	E	L	G	A	N	W	V	E	G	V	N	G	G	K	M	N	P	I	W	P	I	V	N	S	T	L	K	L	R	N	F	R
Template Known Secondary structure								B													T	T									S	S	S	S	S	B	T	T	S						T	T					S	S								S	S	S	S			T							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	L	I	T	H	E	K	L	A	F	M	T	E	K	S	A	M	T	M	D	Y	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	D	F	D	Y	L	A	Q	N	V	Y	K	E	D	G	G	V	Y	D	E	D	Y	V	Q	K	R	I	E	L	A	D	S	V	E	E	M	G	E	K	L	S	A	T	L	H	A	S	G	R	D	D	M	S	I	L	A	M	Q	R	L	N	E	H	Q	P	N	G	P	A	T	P	V	D	M	V	V	D	Y	Y	K
Template Known Secondary structure					T	T	G	G	G					S	S	S	S	B																										T	S		T	T	S	T	T			B										T	S	S	S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
																																	92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	D	E	T	S	P	S	Q	R	S	Y	S	V	L	R	S	K	F	D	A	W	L	M	E	Q	A	E	E	A	G	A	Q	L	I	T	G	I	R	V	D	N	L	V	Q	R	D	G	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	Y	E	F	A	E	P	P	R	V	T	S	L	Q	N	T	V	P	L	A	T	F	S	D	F	G	D	D	V	Y	F	V	A	D	Q	R	G	Y	E	A	V	V	Y	Y	L	A	G	Q	Y	L	K	T	D	D	K	S	G	K	I	V	D	P	R	L	Q	L	N	K	V	V	R	E	I	K	Y	S	P	G	G
Template Known Secondary structure		T					S	S		G	G	G	B	B	S	T	T	T	S	S									S								T	T		T	T									T	T	S		B		T	T	T			B			T	T			S	S										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.									.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	G	V	E	A	D	G	D	V	I	E	A	K	T	V	I	L	A	D	G	V	N	S	I	L	A	E	K	L	G	M	A	K	R	V	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	V	A	V	G	V	K	E	L	I	E	L	P	K	S	V	I	E	D	R	F	Q	L	Q	G	N	Q	G	A	A	C	L	F
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	V	K	T	E	D	N	S	V	Y	S	A	D	Y	V	M	V	S	A	S	L	G	V	L	Q	S	D	L	I	Q	F	K	P	K	L	P	T	W	K	V	R	A	I	Y	Q	F	D	M	A	V	Y	T	K	I	F	L	K	F	P	R	K	F	.	.	.	.	.	.	W	P	E	G	K	G	R	E	F	F	L
Template Known Secondary structure							T	T	S						S						S							T	T	S	S				S													S													S	S			.	.	.	.	.	.	S			S	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.							310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.				.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.
Query SS confidence																.	.	.
Query Sequence		A	G	S	P	T	D	G	L	M	G	G	G	F	L	.	.	.	Y	T	N	E	N	T	L	S	L	G	L	V	C	G	L	H	H	L	H	D	A	K	K	S	V	P	Q	M	L	E	D	F	K	Q	H	P	A	V	A	P	L	I	A	G	G	K	L	V	E	Y	S	A	H	V	V	P	E	A	G	I	N	M	L
Query Conservation																.	.	.
Alig confidence																.	.	.																																				.	.
Template Conservation																																																						.	.
Template Sequence		Y	A	S	S	R	R	G	Y	Y	G	V	W	Q	E	F	E	K	Q	Y	P	D	A	N	V	L	L	V	T	V	T	D	E	E	S	R	R	I	E	Q	Q	S	D	E	Q	T	K	A	E	I	M	Q	V	.	.	L	R	K	M	F	P	G	K	D	V	P	D	A	T	D	I	L	V	P	R	W	W	S	D	R	F
Template Known Secondary structure					S	S	T	T	S	S							T	T	T	S	T	T																		T	S													.	.						T	T	S						S							T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.			.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
		290	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	G	D	G	V	L	I	A	G	D	A	A	G	M	C	M	N	L	G	F	T	I	R	G	M	D	L	A	I	A	A	G	E	A	A	A	K	T	V	L	S	A	M	K	S	D
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	G	T	F	S	N	W	P	V	G	V	N	R	Y	E	Y	D	Q	L	R	A	P	V	G	R	V	Y	F	T	G	E	H	T	S	.	.	.	.	.	E	H	Y	N	G	Y	V	H	G	A	Y	L	S	G	I	D	S	A	E	I	L	I	N	C	A	Q	K	K
Template Known Secondary structure		T	S	S	S					B	T	T													B	T	T					S	G	G	G		.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.						.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.