Job Description P43672 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:54 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 430 % Identity 31% Template c2iw3B_ PDB info PDB header:translation Chain: B: PDB Molecule:elongation factor 3a; PDBTitle: elongation factor 3 in complex with adp Resolution 2.4 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.		.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																																																																									.
Query SS confidence																																																																									.
Query Sequence		I	S	M	H	G	A	W	L	S	F	S	D	A	P	L	L	D	N	A	E	L	H	I	E	D	N	E	R	V	C	L	V	G	R	N	G	A	G	K	S	T	L	M	K	I	L	N	R	E	Q	G	L	D	D	G	R	I	I	Y	E	Q	D	L	I	V	A	R	L	Q	Q	D	.	P	P	R	N	V	E	G	S
Query Conservation																																																																									.
Alig confidence																																																											.	.	.												.
Template Conservation																																																											.	.	.
Template Sequence		L	C	N	C	E	F	S	L	A	Y	G	A	K	I	L	L	N	K	T	Q	L	R	L	K	R	A	R	R	Y	G	I	C	G	P	N	G	C	G	K	S	T	L	X	R	A	I	A	N	G	Q	V	D	G	F	P	T	Q	.	.	.	E	E	C	R	T	V	Y	V	E	H	D	I	D	G	T	H	S	D	T	S
Template Known Secondary structure												T	T													T	T								S	T	T	S	S										T	T		S	T	T				T	.	.	.	T	T	S					T	T								T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.				.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.				150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.
Query Sequence		V	Y	D	F	V	A	E	G	I	E	E	Q	A	E	Y	L	K	R	Y	H	D	I	S	R	L	V	M	N	D	P	S	E	K	N	L	N	E	L	A	K	V	Q	E	Q	L	D	H	H	N	L	W	Q	L	E	N	R	I	N	E	V	L	A	Q	L	G	L	D	.	.	.	P	N	V	A	L	S	S	L	S	G
Query Conservation																																																																					.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	D	F	V	F	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	G	T	K	E	A	I	K	D	K	L	I	E	F	G	F	T	D	E	X	I	A	X	P	I	S	A	L	S	G
Template Known Secondary structure								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S													T								S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		507	.	.	510	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	W	L	R	K	A	A	L	G	R	A	L	V	S	N	P	R	V	L	L	L	D	E	P	T	N	H	L	D	I	E	T	I	D	W	L	E	G	F	L	K	T	F	N	G	T	I	I	F	I	S	H	D	R	S	F	I	R	N	M	A	T	R	I	V	D	L	D	R	G	K	L	V	T	Y	P	G	N	Y	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	W	K	X	K	L	A	L	A	R	A	V	L	R	N	A	D	I	L	L	L	D	E	P	T	N	H	L	D	T	V	N	V	A	W	L	V	N	Y	L	N	T	C	G	I	T	S	I	T	I	S	H	D	S	V	F	L	D	N	V	C	E	Y	I	I	N	Y	E	G	L	K	L	R	K	Y	K	G	N	F	T
Template Known Secondary structure															T	T		S						S	T	T	T	T																S		S							S										S							T	T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		546	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Y	L	L	E	K	E	E	A	L	R	V	E	E	L	Q	N	A	E	F	D	R	K	L	A	Q	E	E	V	W	I	R	Q	G	I	K	A	R	R	T	R	N	E	G	R	V	R	A	L	K	A	M	R	R	E	R	G	E	R	R	E	V	M	G	T	A	K	M	Q	V	E	E	A	S	R	S	G	K	I	V
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	F	V	K	K	C	P	A	A	K	A	Y	E	E	L	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	L	E	F	K	F	P	E	P	G	Y	L	E	G	V	K	T	K	Q	K	A	I
Template Known Secondary structure								G	G	G	G	G	T	T		S	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G											T	T			S	T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		626	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.			330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.				.
Predicted Secondary structure												.	.																																																																	.	.	.
Query SS confidence												.	.																																																																	.	.	.
Query Sequence		F	E	M	E	D	V	C	Y	Q	V	.	.	N	G	K	Q	L	V	K	D	F	S	A	Q	V	L	R	G	D	K	I	A	L	I	G	P	N	G	C	G	K	T	T	L	L	K	L	M	L	G	Q	L	Q	A	D	S	G	R	I	H	V	G	T	K	L	E	V	A	Y	F	D	Q	H	R	A	E	.	.	.	L
Query Conservation												.	.																																																																	.	.	.
Alig confidence												.	.																																																																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	K	V	T	N	X	E	F	Q	Y	P	G	T	S	K	P	Q	I	T	D	I	N	F	Q	C	S	L	S	S	R	I	A	V	I	G	P	N	G	A	G	K	S	T	L	I	N	V	L	T	G	E	L	L	P	T	S	G	E	V	Y	T	H	E	N	C	R	I	A	Y	I	K	Q	H	A	F	A	H	I	E	S
Template Known Secondary structure												T	T		S	S		S										T	T							S	S													T	T	S	S			S								T	T														G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		666	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	P	D	K	T	V	M	D	N	L	A	E	G	K	Q	E	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	L	D	K	T	P	S	E	Y	I	Q	W	R	F	Q	T	G	E	D	R	E	T	X	D	R	A	N	R	Q	I	N	E	N	D	A	E	A	X	N	K	I	F	K	I	E	G	T	P	R	R	I	A	G	I	H	S	R	R	K	F	K	N	T	Y	E	Y	E	C	S	F	L	L	G	E	N	I	G	X	K	S
Template Known Secondary structure			T	T	S										T	T	T	S	S		T	T	T	T	T	T	T	S					S	S		S	S	S	T	T						T	T															T	T													S	S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		746	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.
																																											413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.		.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	G	K	P	R	H	V	L	G	Y	L	Q	D	F	L	F	H	P	K	R	A	.	M	T	P	V	R	A	L	S	G	G	E	R	N	R	L	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	W	V	P	X	X	S	V	D	N	A	W	I	P	R	G	E	L	V	E	S	H	S	K	X	V	A	E	V	D	X	K	E	A	L	A	S	G	Q	F	R	P	L	T	R	K	E	I	E	E	H	C	S	X	L	G	L	D	P	E	I	V	S	H	S	R	I	R	G	L	S	G	G	Q	K	V	K	L	V
Template Known Secondary structure									G	G	G						G	G	G	T																			T	T																	T	T									S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		826	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	R	L	F	L	K	P	S	N	L	L	I	L	D	E	P	T	N	D	L	D	V	E	T	L	E	L	L	E	E	L	I	D	S	Y	Q	G	T	V	L	L	V	S	H	D	R	Q	F	V	D	N	T	V	T	E	C	W	I	F	E	G	G	G	K	I	G	R
Query Conservation
Alig confidence																																																															.
Template Conservation																																																															.
Template Sequence		L	A	A	G	T	W	Q	R	P	H	L	I	V	L	D	E	P	T	N	Y	L	D	R	D	S	L	G	A	L	S	K	A	L	K	E	F	E	G	G	V	I	I	I	T	H	S	A	E	F	T	K	N	L	T	E	E	V	W	A	V	K	.	D	G	R	X	T	P
Template Known Secondary structure						T	T	T			S							G	G	G	T																	S	S							S						T	T	T								B	.	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																																															.
Template SS confidence
		906	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.		.	.	.	970	.	.