Job Description P0A6F3 Confidence 92.36% Date Thu Jan 5 11:03:00 GMT 2012 Rank 126 Aligned Residues 318 % Identity 15% Template c2iirJ_ PDB info PDB header:transferase Chain: J: PDB Molecule:acetate kinase; PDBTitle: acetate kinase from a hypothermophile thermotoga maritima Resolution 3.30 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.		.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.										.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70				.	.	.
Predicted Secondary structure																			.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Query SS confidence																			.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Query Sequence		I	V	A	L	D	Q	G	T	T	S	S	R	A	V	V	M	D	.	H	D	A	N	I	I	S	V	S	Q	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	Q	I	Y	P	K	P	G	W	V	E	H	D	P	M	E	I	W	A	T	Q	S	S	T	L	V	E	V	L	A	K	A	D	I	.	.	.	S	S	D
Query Conservation																			.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Alig confidence																			.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	L	V	I	N	S	G	S	S	S	I	K	Y	Q	L	I	E	M	E	G	E	K	V	L	C	K	G	I	A	E	R	I	G	I	E	G	S	R	L	V	H	R	V	G	D	E	K	H	V	I	E	R	E	L	P	D	H	E	E	A	L	K	L	I	L	N	T	L	V	D	E	K	L	G	V	I	K	D	L	K
Template Known Secondary structure									T	T									T	T	T	T											T	T	S	T	T								T	T											S															T	T	T		S		S		S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	I	A	A	I	G	I	T	N	Q	R	E	T	T	I	V	W	E	K	E	T	G	K	P	I	Y	N	A	I	V	W	Q	C	R	R	T	A	E	I	C	E	H	L	K	R	D	G	L	E	D	Y	I	R	S	N	T	G	L	V	I	D	P	Y	F	S	G	T	K	V	K	W	I	L	D	H	V	E	G	S	R
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		E	I	D	A	V	G	H	R	V	V	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	F	K	E	S	V	L	V	D	E	E	V	L	K	A	I	E	E	V	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	P	L	H	N	P	A	N	L	M	G	I	K	A	A	M	K	L	L	P	G	V	.
Template Known Secondary structure		T									S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S	S																G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	T	T	T															S	T	T		.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.											.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.												.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.			.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Query SS confidence																																																																		.	.
Query Sequence		E	R	A	R	R	G	E	L	L	F	G	T	V	D	T	W	L	I	W	K	M	T	Q	G	R	V	H	V	T	D	Y	T	N	A	S	R	T	M	L	F	N	I	H	T	L	D	W	D	D	K	M	L	E	V	L	D	I	P	R	E	M	L	P	E	.	.	V	R	R	S	S	E	V	Y	G	Q	T	N	I	G
Query Conservation																																																																		.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.						.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	N	V	A	V	F	D	T	A	F	H	Q	T	I	P	Q	K	A	Y	L	Y	A	I	P	Y	E	Y	Y	E	K	Y	K	I	R	R	Y	G	.	F	H	G	T	S	H	R	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	G	G	G	G	G									S	S		T									S				.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template SS confidence
																																				141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.		.	.	180	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	G	G	T	R	I	P	I	S	G	I	A	G	D	Q	Q	A	A	L	F	G	Q	L	C	V	K	E	G	M	A	K	N	T	Y	G	T	G	C	F	M	L	M	N	T	G	E	K	A	V	K	S	E	N	G	L	L	T	T	I	A	C	G	P	T	G	E	V	N	Y	A	L	E	G	A	V	F	M	A	G
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	R	A	A	E	I	L	G	K	K	L	E	E	L	K	I	I	T	C	H	I	G	N	G	A	S	V	A	A	V	K	Y	G	K	C	V	D	T	S	M	G	F	T	P	.	.	.	.	.	.	.	L	E	G	L	V	M	G	T	R	S	G	D	L	D	P
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S		G	G	G									S	S	S								T	T						S			S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S	S			S	S				S			T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186	.													.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.								.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370			.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	I	Q	W	L	R	D	E	M	K	L	I	N	D	A	Y	D	S	E	Y	F	A	T	K	V	Q	N	T	N	G	V	Y	V	V	P	A	F	T	G	L	G	A	P	Y	W	D	P	Y	A	R	G	A	I	F	G	L	T	R	.	.	G	V	N	A	N	H	I	I	R	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	P	F	F	I	M	E	K	E	G	I	S	P	Q	E	M	Y	D	I	L	N	K	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	Y	G	L	S	K	G	F	S	S	D	M	R	D	I	E	E	A	A	L	K	G	D	E	W	C	K
Template Known Secondary structure		T										T													S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	T	S		S											T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.		.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																		.
Query SS confidence		.	.																																		.
Query Sequence		.	.	L	E	S	I	A	Y	Q	T	R	D	V	L	E	A	M	Q	A	D	S	G	I	R	L	H	A	L	R	V	D	G	G	A	V	.	A	N	N	F	L	M	Q	F	Q	S	D	I	L	G
Query Conservation		.	.																																		.
Alig confidence		.	.																						.												.
Template Conservation																									.
Template Sequence		L	V	L	E	I	Y	D	Y	R	I	A	K	Y	I	G	A	Y	A	A	A	M	N	G	.	V	D	A	I	V	F	T	A	G	V	G	E	N	S	P	I	T	R	E	D	V	C	S	Y	L	E
Template Known Secondary structure																							T		.		S										T	T											T	T	G
Template Predicted Secondary structure																									.
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.