Job Description P0A6F3 Confidence 97.81% Date Thu Jan 5 11:03:00 GMT 2012 Rank 57 Aligned Residues 269 % Identity 18% Template c2gupA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:rok family protein; PDBTitle: structural genomics, the crystal structure of a rok family protein2 from streptococcus pneumoniae tigr4 in complex with sucrose Resolution 2.01 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	V	A	L	D	Q	G	T	T	S	S	R	A	V	V	M	D	H	D	A	N	I	I	S	V	S	Q	R	E	F	E	Q	I	Y	P	K	P	G	W	V	E	H	D	P	M	E	I	W	A	T	Q	S	S	T	L	V	E	V	L	A	K	A	D	I	S	S	D	Q	I	A	A	I	G	I	T	N	Q	R	E	T
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Sequence		I	A	T	I	D	I	G	G	T	G	I	K	F	A	S	L	T	P	D	G	K	I	L	D	K	T	S	I	S	T	P	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	D	L	L	A	W	L	D	Q	R	L	S	E	Q	D	Y	S	G	.	.	.	I	A	X	S	V	P	G	A	V	N	Q
Template Known Secondary structure									T	T									T	T													S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	S			S		.	.	.						S	S				T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.															.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.				.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	V	W	E	K	E	T	G	K	P	I	Y	N	A	I	V	W	Q	C	R	R	T	A	E	I	C	E	H	L	K	R	D	G	L	E	D	Y	I	R	S	N	T	G	L	V	I	D	P	Y	F	S	G	T	K	V	K	W	I	L	D	H	V	E	G	S	R	E	R	A	R	R	G	E	L	L	F	G	T	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	E	T	G	V	I	D	G	F	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T	T		B			S			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								66	.	.	.	70	.	.	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	T	W	L	I	W	K	M	T	Q	G	R	V	H	V	T	D	Y	T	N	A	S	R	T	M	L	F	N	I	H	T	L	D	W	D	D	K	M	L	E	V	L	D	I	P	R	E	M	L	P	E	V	R	R	S	S	E	V	Y	G	Q	T	N	I	G	G	K	G	G	T	R	I	P	I	S	G	I	A	G	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	Y	I	H	G	F	S	W	Y	E	A	L	S	S	Y	Q	L	P	V	H	L	E	N	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	S	S	S	B					T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																								76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
		247	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.				.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure							.	.																																						.	.	.
Query SS confidence							.	.																																						.	.	.
Query Sequence		Q	Q	A	A	L	.	.	F	G	Q	L	C	V	K	E	G	M	A	K	N	T	Y	G	T	G	C	F	M	L	M	N	T	G	E	K	A	V	K	S	E	N	G	L	L	.	.	.	T	T	I	A	C	G	P	T	G	E	V	N	Y	A	L	E	G	A	V	F	M	A	G	A	S	I	Q	W	L	R	D	E	M
Query Conservation							.	.																																						.	.	.
Alig confidence							.	.																																						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	C	V	G	L	S	E	L	L	A	H	P	E	L	E	N	A	A	C	V	V	I	G	T	G	I	G	G	A	X	I	I	N	G	R	L	H	R	G	R	H	G	L	G	G	E	F	G	Y	X	T	T	L	A	P	A	E	K	L	N	N	W	S	Q	L	A	S	T	G	N	X	V	R	Y	V	I	E	K	S	G
Template Known Secondary structure													T	T		S	S							S	S	S								T	T						T	T	S		T	T		G	G	G		B	S	S			S	S	S			B						S													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	I	N	D	A	Y	D	S	E	Y	F	A	T	K	V	Q	N	T	N	G	V	Y	V	V	P	A	F	T	G	L	G	A	P	Y	W	D	P	Y	A	R	G	A	I	F	G	L	T	R	G	V	N	A	N	H	I	I	R	A	T	L	E	S	I	A	Y	Q	T	R	D	V	L	E	A	M	Q	A	D	S	G
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		H	T	D	W	D	G	R	K	I	Y	Q	E	A	A	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	L	C	Q	E	A	I	E	R	X	N	R	N	L	A	Q	G	L	L	N	I	Q	Y	L	.	.
Template Known Secondary structure		S														T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.												.	.	430	.	.	.	.	.	.			.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Query Sequence		I	R	L	H	A	L	R	V	D	G	G	A	V	A	N	N	F	L	M	Q	F	Q	S	D	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	R	V	E	R	P	E	V	.	.	R	E	V	T	A	L	G	A	A	Y	L	A	G	L	A	V	G	F	W
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	D	P	G	V	I	S	L	G	G	S	I	S	Q	N	P	D	F	I	Q	G	V	K	K	A	V	E	D	F	V	D	A	Y	E	E	Y	T	V	A	P	V	I	Q	A	C	T	Y	H	A	D	A	N	L	Y	G	A	L	V	N	W	L	Q	E	E	K	Q	W
Template Known Secondary structure					S						S	G	G	G	G																				T	T			S								S		S	T	T														T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.