Job Description P0AF24 Confidence 98.36% Date Thu Jan 5 11:24:57 GMT 2012 Rank 126 Aligned Residues 213 % Identity 12% Template d2bdea1 SCOP info HAD-like HAD-like 5' nucleotidase-like Resolution 2.90

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.			.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.		.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.																																				.	.	40	.	.
Predicted Secondary structure																.	.												.							.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.												.							.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	I	K	N	V	I	C	D	I	D	G	V	L	M	.	.	H	D	N	V	A	V	P	G	A	A	E	.	F	L	H	G	I	M	.	D	K	G	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	L	L	T
Query Conservation																.	.												.							.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.												.							.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	K	L	I	G	L	D	X	D	H	T	L	I	R	Y	N	S	K	N	F	E	S	L	V	Y	D	L	V	K	E	R	L	A	E	S	F	H	Y	P	E	E	I	K	K	F	K	F	N	F	D	D	A	I	R	G	L	V	I	D	S	K	N	G	N	I	L	K	L	S	R	Y	G	A	I	R	L	S	Y	H
Template Known Secondary structure		T								T	B	T	T	T	B																							T				G	G	G	G	G					G	G	G			T	T					T	T	T	T						B	T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.													.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Query Sequence		N	Y	P	S	Q	T	G	Q	D	L	A	N	R	F	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	V	D	V	P	D	S	V	F	Y	T	S	A	M	A	T	A	D	F	L	R	R	Q	E	G	K	K	A	Y	V	V	G	E	G	A	L	I	H	E	L	Y	K	A	G	F	.	T	I	T	D	V
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	K	Q	I	S	F	S	D	Q	K	K	I	Y	R	S	I	Y	V	D	L	G	D	P	N	Y	X	A	I	D	T	S	F	S	I	A	F	C	I	L	Y	G	Q	L	V	D	L	K	D	T	N	P	D	K	X	P	S	Y	Q	A	I	A	Q	D	V	Q	Y	C	V	D	K	V	H	S	D	G	T	L	K	N
Template Known Secondary structure		T	T													T	S	S	B			T	T	S	T	T							T	T																		S	T	T	T	S																					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.										.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	P	D	F	V	I	V	G	E	T	R	S	Y	N	W	D	M	M	H	K	A	A	Y	F	V	A	N	G	A	R	F	I	A	T	N	P	D	T	H	G	R	G	F	Y	P	A	C	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	C	A	G	I	E	K	I	S	G	R	K	P	F	Y	V	G	K	P	S	P	W
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.				.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.				.	.
Template Sequence		I	I	I	K	N	L	K	K	Y	V	I	R	E	K	E	V	V	E	G	L	K	H	F	I	R	Y	G	K	K	I	F	I	L	T	N	S	E	Y	S	Y	S	K	L	L	L	D	Y	A	L	S	P	F	L	D	K	G	E	H	W	Q	G	L	F	E	F	V	I	T	L	.	.	.	.	A	N	K	.	.	P	R
Template Known Secondary structure					T		T	T	T	S																T	T	T								S	S														G	G	G	S		T	T			G	G	G	T							S	.	.	.	.				.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.				.	.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.					.	.	.			.	.
		181	.	.																																		.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.		.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Query Sequence		I	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	L	N	K	M	Q	A	H	S	E	E	T	V	I	V	G	D	N	L	R	T	D	I	L	A	G	F	Q	.	A	G	L	E	T	I	L	V
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Template Conservation
Template Sequence		F	F	Y	D	N	L	R	F	L	S	V	N	P	E	N	G	T	X	T	N	V	H	G	P	I	V	P	G	V	Y	Q	G	G	N	A	K	K	F	T	E	D	L	G	V	G	G	D	E	I	L	Y	I	G	D	H	I	Y	G	D	I	L	R	L	K	K	D	C	N	W	R	T	A	L	V
Template Known Secondary structure					S									T	T	T								S				S															T	T			G	G	G						S	S			S											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions