Job Description P0A8Y5 Confidence 98.97% Date Thu Jan 5 11:08:59 GMT 2012 Rank 80 Aligned Residues 147 % Identity 25% Template c3m9lA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:hydrolase, haloacid dehalogenase-like family; PDBTitle: crystal structure of probable had family hydrolase from2 pseudomonas fluorescens pf-5 Resolution 1.60 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	K	L	I	A	I	D	M	D	G	T	L	L	L	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	I	S	P	A	V	K	N	A	I	A	A	A	R	A
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	K	H	W	V	F	D	X	D	G	T	L	T	I	A	V	H	D	F	A	A	I	R	E	A	L	S	I	P	A	E	D	D	I	L	T	H	L	A	A	L	P	A	D	E	S	A	A	K	H	A	W	L	L	E	H	E	R	D	L	A	Q	G	S	R	P	A	P	G	A	V	E	L	V	R	E	L	A	G
Template Known Secondary structure		G								T	B	T	T	T														T	T			T	T	S									S															T												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	V	N	V	V	L	T	T	G	R	P	Y	A	G	V	H	N	Y	L	K	E	L	H	M	E	Q	P	G	D	Y	C	I	T	Y	N	G	A	L	V	Q	K	A	A	D	G	S	T	V	A	Q	T	A	L	S	Y	D	D	Y	R	F	L	E	K	L	S	R	E	V	G	S	H	F	H	A	L	D	R	T	T
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	Y	R	L	G	I	L	T	R	N	A	R	E	L	A	H	V	T	L	E	A	I	G	L	A	D	C	F	A	E	A	D	V	L	G	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T								S	S												T	T		G	G	G	S		G	G	G				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Y	T	A	N	R	D	I	S	Y	Y	T	V	H	E	S	F	V	A	T	I	P	L	V	F	C	E	A	E	K	M	D	P	N	T	Q	F	L	K	V	M	M	I	D	E	P	A	I	L	D	Q	A	I	A	R	I	P	Q	E	V	K	E	K	Y	T	V	L	K	S	A	P	Y	F	L	E	I	L	D	K	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	P	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																														123	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.		.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.
Query SS confidence																																									.
Query Sequence		V	N	K	G	T	G	V	K	S	L	A	D	V	L	G	I	K	P	E	E	I	M	A	I	G	D	Q	E	N	D	I	A	M	I	E	Y	A	G	V	.	G	V	A	M	D	N	A	I	P	S	V	K	E	V	A	N	F	V	T	K	S	N	L	E	D	G	V	A	F	A	I	E	K	Y	V
Query Conservation																																									.
Alig confidence																																									.																					.	.
Template Conservation																																																														.	.
Template Sequence		K	P	H	P	G	G	L	L	K	L	A	E	A	W	D	V	S	P	S	R	X	V	X	V	G	D	Y	R	F	D	L	D	C	G	R	A	A	G	T	R	T	V	L	V	N	L	P	D	N	P	W	P	E	L	T	D	W	H	A	R	.	.	D	C	A	Q	L	R	D	L	L	S	A	E	G
Template Known Secondary structure		T	T	S	S										T	T			G	G	G						S	S											T							S	S	S	S		S		G	G	G		S				S	.	.	S											T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.			.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions