Job Description P75995 Confidence 98.58% Date Wed Jan 25 15:21:04 GMT 2012
Rank 23 Aligned Residues 148
% Identity 14% Template c3hvwA_
PDB info
PDB header: lyaseChain: A: PDB Molecule: diguanylate-cyclase (dgc);
PDBTitle: crystal structure of the ggdef domain of the pa2567 protein2 from pseudomonas aeruginosa, northeast structural genomics3 consortium target par365c
Resolution 1.70 Å
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67 . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
C N L E E Q Y Q L G T E A A L K P H L R T I I I L K Q G I V W C T S L P G N R V L L S R I P V F P D S N L L L A P A I D T V N R L P I L L Y Q N Q F A D T R I L
Query Conservation  
                                                                                                                                   
Alig confidence  
. . . . . . .
Template Conservation  
                                    . . . . . .                                                       .            
Template Sequence  
N R L R L Q E D V S L R L Q R D G A L T V I .
.
.
.
.
.
A A D L L P L A L L N T I I R T L G Y P F S N D L X L E A R D R I R A E L P D F T .
L Y K I S P T R F G
Template Known Secondary structure  
S . . . . . . S T T S . T T
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . .
Template SS confidence  
   
176 . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . .
. . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . .
. 240 . . . . . . . .
 
   
147 . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . .
. . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . .
Predicted Secondary structure  
.
Query SS confidence  
.
Query Sequence  
V T I S D Q H I R G A L N V P L K G V R Y V L R V A D D I I G P T G D V M T L N G H Y P Y T E K V H S T K Y H F T .
I I F N P P P L F S F Y R L I D K G F G I L
Query Conservation  
                                                                                                              .                                        
Alig confidence  
. . . . .
Template Conservation  
                      . . . .                                                                                                  
Template Sequence  
L L L P R Q Q Q E E T E S .
.
.
.
V C L R L L R A F E S P V V C R G I P I K A N V G L G V L P L A D D T L D G D Q D W L R L V V S A A D D A R D R G V G W A R Y
Template Known Secondary structure  
G G G G G G . . . . T T S T T G G G T G G G S T S
Template Predicted Secondary structure  
. . . .
Template SS confidence  
   
249 250 . . . . . . . . . 260 .
. . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300 . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]