Job Description P39367 Confidence 97.71% Date Thu Jan 5 11:59:58 GMT 2012
Rank 294 Aligned Residues 119
% Identity 20% Template c3lkdB_
PDB info
PDB header: transferaseChain: B: PDB Molecule: type i restriction-modification system
PDBTitle: crystal structure of the type i restriction-modification2 system methyltransferase subunit from streptococcus3 thermophilus, northeast structural genomics consortium4 target sur80
Resolution 2.25 Å
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23 . . . . . . 30 . .
. . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . .
. . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . .
Predicted Secondary structure  
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Query SS confidence  
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Query Sequence  
E K Y A T L G R V L .
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R M K P G T R I L D L G S G S G E M L C T W A R .
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D H G I T G T G I D M S S L F T A Q A K R R A E E L G V S E R V H F I H N D
Query Conservation  
                  . . . .                     . . . .                                                                      
Alig confidence  
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Template Conservation  
                                                                                                   
Template Sequence  
P V A K L X T Q I A F L G R E D K Q G F T L Y D A T X G S G S L L L N A K R Y S R Q P Q T V V Y F G Q E L N T S T Y N L A R X N X I L H G V P I E N Q F L H N A
Template Known Secondary structure  
T T T T S S T T T T S T T G G G S G G G S T T G G G S
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
204 . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . .
 
   
95 . . . . 100
. . . . . . . . . 110 . . . .
. . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . .
. . . . . . . 140 .
Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Query SS confidence  
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Query Sequence  
A A G Y V A .
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N E K C D V A A C V G A T W .
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I A G G F A G A E E L L A Q S L K P .
G G I M L I G E P
Query Conservation  
            . . . . .                         . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                         .          
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
                                                                                                                     
Template Sequence  
D T L D E D W P T Q E P T N F D G V L X N P P Y S A K W S A S S G F X D D P R F S P F G K L A P K S K A D F A F L L H G Y Y H L K Q D N G V X A I V L P
Template Known Secondary structure  
T T T S S S S B S B T G G G G G S T T T G G G S S T T T B T T T
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
284 . . . . . 290 . . . . . . . . . 300 . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]