Job Description P0AFG8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:26:11 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 625 % Identity 21% Template c3m7iA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: crystal structure of transketolase in complex with thiamine2 diphosphate, ribose-5-phosphate(pyranose form) and3 magnesium ion Resolution 1.75 Å

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		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.				.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.
Query Sequence		N	L	E	L	E	R	R	I	R	S	A	I	R	W	N	A	I	M	T	V	L	R	A	S	K	K	D	L	E	L	G	G	H	M	A	S	F	Q	S	S	A	T	I	Y	D	V	C	F	N	H	F	F	R	A	R	N	E	Q	D	G	.	.	.	G	D	L	V	Y	F	Q	G	H	I	S	P	G	V	Y	A	R
Query Conservation																																																														.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	I	Q	I	L	Q	E	Q	A	N	T	L	R	F	L	S	A	D	X	V	Q	K	A	N	.	.	.	.	.	.	S	G	H	P	G	A	P	L	G	L	A	D	I	L	S	V	L	S	Y	H	L	K	H	N	P	K	N	P	T	W	L	N	R	D	R	L	V	F	S	G	G	H	A	S	A	L	L	Y	S	F
Template Known Secondary structure																									T	.	.	.	.	.	.		S																							T	T		T	T		T	T	S						S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.							.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
		152	.	.	.	.	.		.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure								.
Query SS confidence								.
Query Sequence		A	F	L	E	G	R	.	L	T	Q	E	Q	L	D	N	F	R	Q	E	V	H	G	N	G	L	S	S	Y	P	H	P	K	L	M	P	E	F	W	Q	F	P	T	V	S	M	G	L	G	P	I	G	A	I	Y	Q	A	K	F	L	K	Y	L	E	H	R	G	L	K	D	T	S	K	Q	T	V	Y	A	F	L	G
Query Conservation								.
Alig confidence								.													.	.													.	.
Template Conservation																					.	.													.	.
Template Sequence		L	H	L	S	G	Y	D	L	S	L	E	D	L	K	N	F	R	Q	L	.	.	H	S	K	T	P	G	H	P	E	I	S	T	.	.	L	G	V	E	I	A	T	G	P	L	G	Q	G	V	A	N	A	V	G	F	A	X	A	A	K	K	A	Q	N	L	L	G	S	D	L	I	D	H	K	I	Y	C	L	C	G
Template Known Secondary structure						T		S								T	T	T		T	.	.	T		S	S		S	S			T	T	S	.	.	T	T			S				S	T	T																						T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.													.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.			.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.			.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	E	M	D	E	P	E	S	K	G	A	I	T	I	A	T	R	E	K	L	D	N	L	V	F	V	I	N	C	N	L	Q	R	L	D	G	P	V	T	G	N	G	K	I	I	N	E	L	E	G	I	F	E	G	A	G	W	N	V	I	K	V	M	W	G	S	R	W	D	E	L	L	R	K	D	T	S	G	K
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	D	L	Q	E	G	I	S	Y	E	A	C	S	L	A	G	L	H	K	L	D	N	F	I	L	I	Y	D	S	N	N	I	S	I	E	G	D	V	G	L	A	F	N	.	.	E	N	V	K	X	R	F	E	A	Q	G	F	E	V	L	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S													T	T		T	T									S			T	T			G	G	G	T			.	.										T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																														.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.			.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	Q	L	M	N	E	T	V	D	G	D	Y	Q	T	F	K	S	K	D	G	A	Y	V	R	E	H	F	F	G	K	Y	P	E	T	A	A	L	V	A	D	W	T	D	E	Q	I	W	A	L	N	R	G	G	H	D	P	K	K	I	Y	A	A	F	K	K	A	Q	E	T	K	G	K	A	T	V	I	L	A	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	H	D	Y	E	E	I	N	K	A	L	E	Q	A	K	K	S	T	.	K	P	C	L	I	I	A	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T														T		S	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
																																																						213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.		.	.	.	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.
Query SS confidence																																							.
Query Sequence		T	I	K	G	Y	G	M	G	D	A	A	E	G	K	N	I	A	H	Q	V	K	K	M	N	M	D	G	V	R	H	I	R	D	R	F	N	V	.	P	V	S	D	A	D	I	E	K	L	P	Y	I	T	F	P	E	G	S	E	E	H	T	Y	L	H	A	Q	R	Q	K	L	H	G	Y	L	P	S	R	Q	P	N
Query Conservation																																							.
Alig confidence													.	.																									.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		T	T	I	A	K	G	A	G	E	L	E	.	.	G	S	H	K	S	H	G	A	P	L	G	E	E	V	I	K	K	A	K	E	Q	A	G	F	D	P	N	I	S	F	H	I	P	Q	A	S	K	I	R	F	E	S	A	V	E	L	G	D	L	E	E	A	K	W	K	D	K	L	E	K	S	A	K	K	E	L	L
Template Known Secondary structure				T	T	T	T		G	G	G	T	.	.	T		G	G	G	S	S	S															T			T	T			S																																T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250			.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	E	K	L	E	L	P	S	L	Q	D	F	G	A	L	L	E	E	Q	S	K	E	I	S	T	T	I	A	F	V	R	A	L	N	V	M	L	K	N	K	S	I	K	D	R	L	V	P	I	I	A	D	E	A	R	T	F	G	M	E	G	L	F	R	Q	I	G	I	Y	S	P	N	G	Q	Q	Y	T	P	Q
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	R	L	L	N	P	D	F	N	K	I	A	Y	P	.	.	.	D	F	K	G	K	D	L	A	T	R	D	S	N	G	E	I	L	N	V	L	.	.	.	A	K	N	L	E	G	F	L	G	G	S	A	D	L	G	P	S	N	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S				T	T					.	.	.			T	T			B														.	.	.					T	T						S	S						T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.				.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.				.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	E	Q	V	A	Y	Y	K	E	D	E	K	G	Q	I	L	Q	E	G	I	N	E	L	G	A	G	C	S	W	L	A	A	A	T	S	Y	S	T	N	N	L	P	M	I	P	F	Y	I	Y	Y	S	M	F	G	F	Q	R	I	G	D	L	C	W	A	A	G	D	Q	Q	A	R	G	F	L	I	G	G	T	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																																		.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation		.	.	.																																		.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		.	.	.	E	L	H	S	X	G	D	F	V	E	G	K	N	I	H	F	G	I	R	E	H	A	X	A	A	I	N	N	A	F	A	R	Y	.	.	.	.	.	G	I	F	L	P	F	S	A	T	F	F	I	F	S	E	Y	L	K	P	A	A	R	I	A	A	.	.	L	X	K	I	K	H	F	F	I	F	T	H
Template Known Secondary structure		.	.	.			T	T	S		B	T	T	T	S	S						S																.	.	.	.	.	S	S									G	G	G	G	G	G	T									.	.			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																		.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
					372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.						.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.			430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	R	T	T	L	N	G	E	G	L	Q	H	E	D	G	H	S	H	I	Q	S	L	T	I	P	N	C	I	S	Y	D	P	A	Y	A	Y	E	V	A	V	I	M	H	D	G	L	E	R	M	Y	G	E	K	Q	E	N	V	Y	Y	Y	I	T	T	L	N	E	N	Y	H	M	P	A	M	P	E	G	A	E	E	G
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Sequence		D	S	I	G	V	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	I	E	Q	L	S	T	F	R	A	X	P	N	F	L	T	F	R	P	A	D	G	V	E	N	V	K	A	W	Q	I	A	L	N	.	.	.	.	.	A	D	I	P	S	A	F	V	L	S	R	Q	K	L	K	.	.	.	.	A	L	N	E	P	V	F	G	D
Template Known Secondary structure			S	G	G	G		T	T		G	G	G	S		S	S								S	S	S							S	S														.	.	.	.	.	S	S	S								S	S		B		.	.	.	.						S	B
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.						.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.					.	.	.	.	.	.	510	.	.
		710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	R	K	G	I	Y	K	L	E	T	I	E	G	S	K	G	K	V	Q	L	L	G	S	G	S	I	L	R	H	V	R	E	A	A	E	I	L	A	K	D	Y	G	V	G	S	D	V	Y	S	V	T	S	F	T	E	L	A	R	D	G	Q	D	C	E	R	W	N	M	L	H	P	L	E	T	P	R	V	P	Y	I
Query Conservation
Alig confidence															.	.																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	N	G	A	Y	L	L	K	E	S	K	E	.	.	A	K	F	T	L	L	A	S	G	S	E	V	W	L	C	L	E	S	A	N	E	L	E	K	Q	.	G	F	A	C	N	V	V	S	X	P	C	F	E	L	F	E	K	Q	D	K	A	Y	Q	E	R	L	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	S	S							T	T	.	.		S							G	G	G														T	.	T									S	B						T	S									S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.			.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550		.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
		790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Q	V	M	N	D	A	P	A	V	A	S	T	D	Y	M	K	L	F	A	E	Q	V	R	T	Y	V	P	A	D	D	Y	R	V	L	G	T	D	G	F	G	R	S	D	S	R	E	N	L	R	H	H	F	E	V	D	A	S	Y	V	V	V	A	A	L	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	E	V	I	G	V	E	A	A	H	S	N	E	L	Y	K	F	.	.	.	.	.	.	.	C	H	K	V	Y	G	I	E	S	F	G	E	S	G	K	D	K	D	V	F	E	R	F	G	F	S	V	S	K	L	V	N	F	I	L	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S							S	S			G	G	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.		S							S				S	S									T	T		S									T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.								.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.