Job Description P0AFG8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:26:11 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 630 % Identity 22% Template c3komB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: crystal structure of apo transketolase from francisella tularensis Resolution 1.60 Å

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		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.
Query Sequence		L	E	R	R	I	R	S	A	I	R	W	N	A	I	M	T	V	L	R	A	S	K	K	D	L	E	L	G	G	H	M	A	S	F	Q	S	S	A	T	I	Y	D	V	C	F	N	H	F	F	R	.	.	.	.	A	R	N	E	Q	D	G	G	D	L	V	Y	F	Q	G	H	I	S	P	G	V	Y	A	R	A	F
Query Conservation																																																				.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	R	E	F	S	N	A	I	R	F	L	S	I	D	A	T	L	K	A	K	.	.	.	.	.	.	S	G	H	P	G	X	P	X	G	X	A	D	I	A	T	V	L	W	T	K	F	L	K	H	N	P	N	N	P	H	W	I	N	R	D	R	F	V	L	S	N	G	H	G	S	X	L	L	Y	S	L	L	H
Template Known Secondary structure																						T	.	.	.	.	.	.		S																			T					T	T		T	T		T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.							.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		154	.	.	.		.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.																																																														.	.	.
Query SS confidence						.																																																														.	.	.
Query Sequence		L	E	G	R	.	L	T	Q	E	Q	L	D	N	F	R	Q	E	V	H	G	N	G	L	S	S	Y	P	H	P	K	L	M	P	E	F	W	Q	F	P	T	V	S	M	G	L	G	P	I	G	A	I	Y	Q	A	K	F	L	K	Y	L	E	H	R	G	L	K	.	.	.	D	T	S	K	Q	T	V	Y	A	F	L
Query Conservation						.																																																														.	.	.
Alig confidence						.													.	.																.																																.	.	.
Template Conservation																			.	.																.
Template Sequence		L	T	G	Y	D	L	S	I	E	D	I	K	N	F	R	Q	L	.	.	H	S	K	T	P	G	H	P	E	Y	G	Y	T	P	G	.	V	E	T	T	T	G	P	L	G	Q	G	V	A	N	A	V	G	X	A	L	G	E	K	L	L	S	D	R	Y	N	T	P	D	L	K	V	I	D	H	H	T	Y	V	F	L
Template Known Secondary structure				T		S							T	T	T	T		T	.	.	T		S	S		S	S			T	T	T	S	T	T	.			S				S	T	T																						B	T	T	B		S
Template Predicted Secondary structure																			.	.																.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.			.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110		.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	G	E	M	D	E	P	E	S	K	G	A	I	T	I	A	T	R	E	K	L	D	N	L	V	F	V	I	N	C	N	L	Q	R	L	D	G	P	V	T	G	N	G	K	I	I	N	E	L	E	G	I	F	E	G	A	G	W	N	V	I	K	V	M	W	G	S	R	W	D	E	L	L	R	K	D	T	S	G
Query Conservation
Alig confidence					.																																					.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.																																					.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	G	.	L	X	E	G	V	S	H	E	A	C	S	L	A	G	T	L	G	L	N	K	L	V	A	F	W	D	D	N	N	T	K	G	W	F	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	P	E	R	F	R	A	Y	G	W	H	V	I	E	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.			S													T	T		T	T											T	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.									T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.																																					.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		156	.	.		.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.									.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	I	Q	L	M	N	E	T	V	D	G	D	Y	Q	T	F	K	S	K	D	G	A	Y	V	R	E	H	F	F	G	K	Y	P	E	T	A	A	L	V	A	D	W	T	D	E	Q	I	W	A	L	N	R	G	G	H	D	P	K	K	I	Y	A	A	F	K	K	A	Q	E	T	K	G	K	A	T	V	I	L	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	H	D	F	V	A	I	E	K	A	I	N	E	A	H	S	Q	Q	Q	K	P	T	L	I	C	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T														T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																							219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	T	I	K	G	Y	G	M	G	D	A	A	E	G	K	N	I	A	H	Q	V	K	K	M	N	M	D	G	V	R	H	I	R	D	R	F	N	V	P	V	S	D	A	D	I	E	K	L	P	Y	I	T	F	P	E	G	S	E	E	H	T	Y	L	H	A	Q	R	Q	K	L	H	G	Y	L	P	S	R	Q	P	N
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	T	V	I	G	F	G	S	P	E	K	A	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	P	L	S	D	Q	E	R	A	S	A	A	K	E	L	N	W	D	Y	Q	A	F	E	I	P	Q	D	V	Y	K	Y	W	D	A	R	E	K	G	Q	A	L	E	A	N	W	Q	G	Q	R	N	L	F	K	D	S	P	K	F	D
Template Known Secondary structure					T	T	T	T		T	T	T		.	.	.	.	.	.	.																	T	T					T	T																														G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.								.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		470	.	.	.	.	.									.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	T	E	K	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	S	L	Q	D	F	G	A	L	L	E	E	Q	S	K	E	I	S	T	T	I	A	F	V	R	A	L	N	V	M	L	K	N	K	S	I	K	D	R	L	V	P	I	I	A	D	E	A	R	T	F	G	M	E	G	L	F	R	Q	I	G	I	Y	S	P
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	F	E	R	V	L	S	K	E	L	P	V	G	L	E	S	A	I	N	D	Y	I	A	S	Q	L	S	N	P	V	K	V	A	T	R	K	A	S	Q	X	V	L	E	V	L	.	.	.	C	K	N	X	P	E	X	F	G	G	S	A	D	L	T	S	N	N	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T				T	T															S				B														.	.	.					T	T							S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.				.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	Q	Q	Y	T	P	Q	D	R	E	Q	V	A	Y	Y	K	E	D	E	K	G	Q	I	L	Q	E	G	I	N	E	L	G	A	G	C	S	W	L	A	A	A	T	S	Y	S	T	N	N	L	P	M	I	P	F	Y	I	Y	Y	S	M	F	G	F	Q	R	I	G	D	L	C	W	A	A	G	D	Q	Q	A	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	G	S	V	W	L	N	N	T	Q	E	G	A	N	Y	L	S	Y	G	V	R	E	F	G	X	A	A	I	X	N	G	L	S	L	Y	.	.	.	.	.	G	G	I	K	P	Y	G	G	T	F	L	V	F	S	D	Y	S	R	N	A	I	R	X	S	A	.	.	L	X	K	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.		T	T			B	T	T	T		S	T	T								S																.	.	.	.	.	S	S									G	G	G													.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
										390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.						.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450			.	.	.	.
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	L	I	G	G	T	S	G	R	T	T	L	N	G	E	G	L	Q	H	E	D	G	H	S	H	I	Q	S	L	T	I	P	N	C	I	S	Y	D	P	A	Y	A	Y	E	V	A	V	I	M	H	D	G	L	E	R	M	Y	G	E	K	Q	E	N	V	Y	Y	Y	I	T	T	L	N	E	N	Y	H	M	P	A
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.	.														.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.														.	.
Template Sequence		P	V	V	H	V	X	S	H	D	S	I	G	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	I	E	H	V	P	S	L	R	L	I	P	N	L	S	V	W	R	P	A	D	T	I	E	T	X	I	A	W	K	E	A	V	K	S	K	D	T	P	.	.	.	.	S	V	X	V	L	T	R	Q	N	L	X	P	V	.	.	V
Template Known Secondary structure											S	G	G	G		T	T		T	T	T			S	S							T	S	T	T								S															S	S			.	.	.	.							S	S		B				.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.					.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.			.
		702	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	P	E	G	A	E	E	G	I	R	K	G	I	Y	K	L	E	T	I	E	G	S	K	G	K	V	Q	L	L	G	S	G	S	I	L	R	H	V	R	E	A	A	E	I	L	A	K	D	Y	G	V	G	S	D	V	Y	S	V	T	S	F	T	E	L	A	R	D	G	Q	D	C	E	R	W	N	M	L	H	P	L
Query Conservation
Alig confidence																							.	.																										.																													.	.	.
Template Conservation																							.	.																										.																													.	.	.
Template Sequence		Q	T	Q	H	Q	V	A	N	I	A	R	G	G	Y	L	V	K	D	N	P	D	.	.	A	K	L	T	I	V	A	T	G	S	E	V	E	L	A	V	K	V	A	N	E	F	E	K	K	.	G	I	K	L	N	V	A	S	I	P	C	V	E	V	F	A	T	Q	A	H	E	Y	K	K	T	V	I	K	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T	T								T	T	.	.									T	T															T	.	T									S							T	S									T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.																										.																													.	.	.
Template SS confidence
		529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.			550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.		.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
		782	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	P	R	V	P	Y	I	A	Q	V	M	N	D	A	P	A	V	A	S	T	D	Y	M	K	L	F	A	E	Q	V	R	T	Y	V	P	A	D	D	Y	R	V	L	G	T	D	G	F	G	R	S	D	S	R	E	N	L	R	H	H	F	E	V	D	A	S	Y	V	V	V	A	A	L	G	E	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	I	P	A	V	F	V	E	.	.	.	X	A	Q	P	D	X	W	Y	K	Y	X	P	K	A	G	G	E	V	K	G	I	Y	S	F	G	E	S	A	P	A	E	D	L	F	K	R	F	G	F	T	V	E	N	I	S	N	I	V	A	K	Y	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S							.	.	.	S	S			G	G	G	G	G	G			T	T									S				S	S										T		S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
														603	.	.	.	.	.	.	610	.				.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.