Job Description P0AFG8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:26:11 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 646 % Identity 21% Template c3hylB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: crystal structure of transketolase from bacillus anthracis Resolution 2.16 Å

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		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.					.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.
Query Sequence		L	E	R	R	I	R	S	A	I	R	W	N	A	I	M	T	V	L	R	A	S	K	K	D	L	E	L	G	G	H	M	A	S	F	Q	S	S	A	T	I	Y	D	V	C	F	N	H	F	F	.	.	.	.	R	A	R	N	E	Q	D	G	G	D	L	V	Y	F	Q	G	H	I	S	P	G	V	Y	A	R	A	F
Query Conservation																																																			.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	Q	L	S	I	N	T	I	R	T	L	S	I	D	A	I	E	K	A	N	.	.	.	.	.	.	S	G	H	P	G	X	P	X	G	A	A	P	X	A	Y	T	L	W	T	Q	F	X	K	H	N	P	N	N	P	T	W	F	N	R	D	R	F	V	L	S	A	G	H	G	S	X	L	L	Y	S	L	L	H
Template Known Secondary structure																						T	.	.	.	.	.	.		S																			T					T	T		T	T		T	T	S						S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.							.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		154	.	.	.		.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.																																																														.	.	.
Query SS confidence						.																																																														.	.	.
Query Sequence		L	E	G	R	.	L	T	Q	E	Q	L	D	N	F	R	Q	E	V	H	G	N	G	L	S	S	Y	P	H	P	K	L	M	P	E	F	W	Q	F	P	T	V	S	M	G	L	G	P	I	G	A	I	Y	Q	A	K	F	L	K	Y	L	E	H	R	G	L	K	.	.	.	D	T	S	K	Q	T	V	Y	A	F	L
Query Conservation						.																																																														.	.	.
Alig confidence						.													.	.																.																																.	.	.
Template Conservation																			.	.																.
Template Sequence		L	S	G	Y	D	V	T	X	D	D	L	K	N	F	R	Q	W	.	.	G	S	K	T	P	G	H	P	E	Y	G	H	T	A	G	.	V	D	A	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	A	T	A	V	G	X	A	X	A	E	R	H	L	A	A	K	Y	N	R	D	A	Y	N	I	V	D	H	Y	T	Y	A	I	C
Template Known Secondary structure			T	T	S	S							T	T	T	T		T	.	.	T		S			S	S			T	T	T	S	T	T	.			S				S	T	T																							S	S				S
Template Predicted Secondary structure																			.	.																.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.			.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110		.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	G	E	M	D	E	P	E	S	K	G	A	I	T	I	A	T	R	E	K	L	D	N	L	V	F	V	I	N	C	N	L	Q	R	L	D	G	P	V	T	G	N	G	K	I	I	N	E	L	E	G	I	F	E	G	A	G	W	N	V	I	K	V	M	W	G	S	R	W	D	E	L	L	R	K	D	T	S	G
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	G	D	L	X	E	G	V	S	A	E	A	S	S	L	A	A	H	L	Q	L	G	R	L	V	V	L	Y	D	S	N	D	I	S	L	D	G	D	L	N	R	S	F	S	.	.	E	S	V	E	D	R	Y	K	A	Y	G	W	Q	V	I	R	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S													T	T		T	T									S	B		S	S	S	B	G	G	G	T			.	.											T							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200			.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	I	Q	L	M	N	E	T	V	D	G	D	Y	Q	T	F	K	S	K	D	G	A	Y	V	R	E	H	F	F	G	K	Y	P	E	T	A	A	L	V	A	D	W	T	D	E	Q	I	W	A	L	N	R	G	G	H	D	P	K	K	I	Y	A	A	F	K	K	A	Q	E	T	K	G	K	A	T	V	I	L	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	N	D	I	E	A	I	A	K	A	I	E	E	A	K	A	D	E	K	R	P	T	L	I	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T																T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																							219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.						.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		H	T	I	K	G	Y	G	M	G	D	A	A	E	G	K	N	I	A	H	Q	V	K	K	M	N	M	D	G	V	R	H	I	R	D	R	F	N	V	.	P	V	S	D	A	D	I	E	K	L	P	Y	I	T	F	P	E	G	S	E	E	.	.	.	.	.	H	T	Y	L	H	A	Q	R	Q	K	L	H	G	Y	L
Query Conservation																																								.																						.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.																									.																						.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.
Template Sequence		R	T	T	I	G	F	G	S	P	N	K	S	.	.	G	K	S	A	S	H	G	S	P	L	G	V	E	E	T	K	L	T	K	E	A	Y	A	W	T	A	E	Q	D	F	H	V	A	E	E	V	Y	E	N	F	R	K	T	V	Q	D	V	G	E	T	A	Q	A	E	W	N	T	X	L	G	E	Y	A	Q	A	Y
Template Known Secondary structure					T	T	T	T		T	T	T	T	.	.	T	S	G	G	G	T	S	S														T	T					S	S	S														T																						S
Template Predicted Secondary structure														.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.			.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.			.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure																					.	.
Query SS confidence																					.	.
Query Sequence		P	S	R	Q	P	N	F	T	E	K	L	E	L	P	S	L	Q	D	F	.	.	G	A	L	L	E	E	Q	S	K	E	I	S	T	T	I	A	F	V	R	A	L	N	V	M	L	K	N	K	S	I	K	D	R	L	V	P	I	I	A	D	E	A	R	T	F	G	M	E	G	L	F	R	Q	I	G	I	Y	S	P
Query Conservation																					.	.
Alig confidence																					.	.																									.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	L	A	N	E	L	Q	A	A	X	N	G	L	L	P	E	G	W	E	Q	N	L	P	T	Y	E	L	G	S	K	A	A	T	R	N	S	S	G	A	V	I	N	A	I	.	.	.	A	E	S	V	P	S	F	F	G	G	S	A	D	L	A	G	S	N	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T				T	T	G	G	G	G						T	T																	.	.	.					T	T						S	S						T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.				.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	Q	Q	Y	T	P	Q	D	R	E	Q	V	A	Y	Y	K	E	D	E	K	G	Q	I	L	Q	E	G	I	N	E	L	G	A	G	C	S	W	L	A	A	A	T	S	Y	S	T	N	N	L	P	M	I	P	F	Y	I	Y	Y	S	M	F	G	F	Q	R	I	G	D	L	C	W	A	A	G	D	Q	Q	A	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	Y	X	N	N	E	K	D	F	T	R	D	D	Y	S	G	K	N	I	W	Y	G	V	R	E	F	A	X	G	A	A	X	N	G	I	A	L	H	.	.	.	.	.	G	G	L	K	T	Y	G	G	T	F	F	V	F	S	D	Y	L	R	P	A	I	R	L	A	A	.	.	L	X	Q	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.			T	T	S		B		B	T	T	B	T	T								S																.	.	.	.	.	S	S									G	G	G													.	.			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
									389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.						.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450			.	.	.	.
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	L	I	G	G	T	S	G	R	T	T	L	N	G	E	G	L	Q	H	E	D	G	H	S	H	I	Q	S	L	T	I	P	N	C	I	S	Y	D	P	A	Y	A	Y	E	V	A	V	I	M	H	D	G	L	E	R	M	Y	G	E	K	Q	E	N	V	Y	Y	Y	I	T	T	L	N	E	N	Y	H	M	P	A
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.	.													.
Template Conservation																																																														.	.	.	.													.
Template Sequence		P	V	T	Y	V	F	T	H	D	S	I	A	V	G	E	D	G	P	T	H	E	P	I	E	Q	L	A	A	L	R	A	X	P	N	V	S	V	I	R	P	A	D	G	N	E	S	V	A	A	W	R	L	A	L	E	S	T	N	K	P	.	.	.	.	T	A	L	V	L	T	R	Q	D	L	P	T	.	L	E	G
Template Known Secondary structure											S	G	G	G	G	G	G		G	G	G	S		S	S							T	S	T	T							S	S															S	S	S		.	.	.	.							S	S					.		G	G
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.													.
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.					.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.		.	.	.
		702	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	P	E	G	A	E	E	G	I	R	K	G	I	Y	K	L	E	T	I	E	G	S	K	G	K	V	Q	L	L	G	S	G	S	I	L	R	H	V	R	E	A	A	E	I	L	A	K	D	Y	G	V	G	S	D	V	Y	S	V	T	S	F	T	E	L	A	R	D	G	Q	D	C	E	R	W	N	M	L	H	P	L
Query Conservation
Alig confidence																																																		.																													.	.	.
Template Conservation																																																		.																													.	.	.
Template Sequence		A	K	D	D	T	Y	E	K	V	A	K	G	A	Y	V	V	S	A	S	K	K	E	T	A	D	V	I	L	L	A	T	G	S	E	V	S	L	A	V	E	A	Q	K	A	L	A	V	D	.	G	V	D	A	S	V	V	S	X	P	S	X	D	R	F	E	A	Q	T	A	E	Y	K	E	S	V	L	P	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	S	T	T							T	S								S	S	S	S		S							G	G	G														T	.	T									S								S									S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.																													.	.	.
Template SS confidence
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.		.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
		782	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	P	R	V	P	Y	I	A	Q	V	M	N	D	A	P	A	V	A	S	T	D	Y	M	K	L	F	A	E	Q	V	R	T	Y	V	P	A	D	D	Y	R	V	L	G	T	D	G	F	G	R	S	D	S	R	E	N	L	R	H	H	F	E	V	D	A	S	Y	V	V	V	A	A	L	G	E	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	V	T	K	R	F	A	I	E	X	G	A	T	F	G	W	H	R	Y	V	.	.	.	.	G	L	E	G	D	V	L	G	I	D	T	F	G	A	S	A	P	G	E	K	I	X	E	E	Y	G	F	T	V	E	N	V	V	R	K	V	K	E	X	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									S	S			T	T	T					.	.	.	.	T	T	T								S				S	S									T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template SS confidence
													606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.					.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.