Job Description P0AFG8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:26:11 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 730 % Identity 16% Template c3ahhA_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:xylulose 5-phosphate/fructose 6-phosphate phosphoketolase; PDBTitle: h142a mutant of phosphoketolase from bifidobacterium breve complexed2 with acetyl thiamine diphosphate Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80			.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.												.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
Predicted Secondary structure																		.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	E	E	Q	P	E	Y	P	G	N	L	E	L	E	R	.	.	R	I	R	S	A	I	R	W	N	A	I	M	T	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	S	K	K	D	L	E	L	G	G	H	M	A	S	F	Q	S	S	A	T	I	Y	D	V	C	F	N	H	F	F	R	A	R	N	E
Query Conservation																		.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		P	W	Q	K	L	D	R	P	V	S	E	E	A	I	E	G	M	D	K	Y	W	R	V	T	N	Y	M	S	I	G	Q	I	Y	L	R	S	N	P	L	M	K	E	P	F	T	R	D	D	V	K	H	R	L	V	G	H	W	G	T	T	P	G	L	N	F	L	L	A	H	I	N	R	L	I	A	D	H	Q	.	.
Template Known Secondary structure		T	T					S																											B	S	S		T	T			S	S			G	G	G	B		S	S			S			S	S																			T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		132	.	.	.	.	.	.	.	140			.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.										160	.	.	.	.	.	.		.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Query SS confidence											.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Query Sequence		Q	D	G	G	D	L	V	Y	F	.	.	Q	G	H	I	S	P	G	V	Y	A	R	A	F	L	E	G	R	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	Q	L	D	N	F	.	R	Q	E	V	H	G	N	G	L	S	S	Y	P	H	P	K	L	M	P	E	F	W	Q	F	P	T	V	S	M	G	L	G	P
Query Conservation											.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Alig confidence		.	.	.							.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.								.																	.				.
Template Conservation		.	.	.																																																													.				.
Template Sequence		.	.	.	Q	N	T	V	F	I	M	G	P	G	H	G	G	P	A	G	T	S	Q	S	Y	V	D	G	T	Y	T	E	Y	Y	P	N	I	T	K	D	E	A	G	L	Q	K	F	F	R	Q	F	S	Y	P	G	G	I	P	S	A	F	A	P	E	.	T	P	G	.	S	I	H	E	G	G	E	L	G	Y	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	B		B					S	S	G	G	G												S							T	T	S		S	S											B	T		T	T	S	B		S	S			T	T	.	S	T	T	.		S				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																													.				.
Template SS confidence
					87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.				.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.
Query Sequence		I	G	A	I	Y	Q	A	K	F	L	K	Y	L	E	H	R	G	L	K	D	T	S	K	Q	T	V	Y	A	F	L	G	D	G	E	M	D	E	P	.	.	.	E	S	K	G	A	I	T	I	A	T	R	E	K	L	D	N	L	V	F	V	I	N	C	N	L	Q	R	L	D	G	P	V	T	G	N	G	K	I	I
Query Conservation																																								.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	H	A	Y	G	A	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	P	S	L	F	V	P	C	I	I	G	D	G	E	A	E	T	G	P	L	A	T	G	W	Q	S	N	K	L	V	N	P	R	T	D	G	I	V	L	P	I	L	H	L	N	G	Y	K	I	A	N	P	T	I	L	A	R	I	S	D
Template Known Secondary structure									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		T	T									T	T	G	G	G	S							G	G	G	G	G	S	S		T	T	T	S											S	B	S	S	S	S	B						S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.												170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	E	L	E	G	I	F	E	G	A	G	W	N	V	I	K	V	M	W	G	S	R	W	D	E	L	L	R	K	D	T	S	G	K	L	I	Q	L	M	N	E	T	V	D	G	D	Y	Q	T	F	K	S	K	D	G	A	Y	V	R	E	H	F	F	G	K	Y	P	E	T	A	A	L	V	A	D	W	T	D	E	Q
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	L	H	D	F	F	R	G	M	G	Y	H	P	Y	E	F	V	A	G	F	D	N	E	D	H	M	S	.	.	.	.	.	.	I	H	R	R	F	A	E	L	F	E	T	I	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T									S	S	S							.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.							.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.					.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.
Query Sequence		I	W	A	L	N	R	G	G	H	D	P	K	K	I	Y	A	A	F	K	K	A	Q	E	T	K	G	K	A	T	V	I	L	A	H	T	I	K	G	Y	G	M	G	D	A	A	E	.	.	.	.	G	K	N	I	A	H	Q	V	K	K	M	N	M	D	G	V	R	H	I	R	D	R	F	N	V	P	V	S	D	A
Query Conservation																																																.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	C	D	I	K	A	A	A	Q	T	D	D	M	T	R	P	F	Y	P	M	L	I	F	R	T	P	K	G	W	T	C	P	K	F	I	D	G	K	K	T	E	G	S	W	R	A	H	Q	V	P	L	A	S	A	R	D	T	E	E	H	F	E	V	L	K	G	W	M	E	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T			S	S													T	T	T	T	S		S			T	T				T	T	S	G	G	G	S	S		S		T	T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.		.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.					.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.																							.	.	.	.
Query SS confidence																																		.																							.	.	.	.
Query Sequence		D	I	E	K	L	P	Y	I	T	F	P	E	G	S	E	E	H	T	Y	L	H	A	Q	R	Q	K	L	H	G	Y	L	P	.	S	R	Q	P	N	F	T	E	K	L	E	L	P	S	L	Q	D	F	G	A	L	L	.	.	.	.	E	E	Q	S	K	E	I	S	T	T	I	A	F	V	R	A	L	N	V	M	L
Query Conservation																																		.																							.	.	.	.
Alig confidence																																		.																							.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	P	E	E	L	F	N	A	D	G	S	I	K	D	D	V	T	A	F	M	P	K	G	E	L	R	I	G	A	N	P	N	A	N	G	G	V	I	R	E	D	L	K	L	P	E	L	D	Q	Y	E	V	T	G	V	K	E	Y	G	H	G	W	G	Q	V	E	A	P	R	A	L	G	A	Y	C	R	D	I	I
Template Known Secondary structure		T		G	G	G	T	B		T	T	S		B						T	T	S			G	G	G	S	T	T	T		G	G	G	G	G	G	G	T									G	G	G	G			T							T	T						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	K	S	I	K	D	R	L	V	P	I	I	A	D	E	A	R	T	F	G	M	E	G	L	F	R	Q	I	G	I	Y	S	P	N	G	Q	Q	Y	T	P	Q	D	R	E	Q	V	A	Y	Y	K	E	D	E	K	G	Q	I	L	Q	E	G	I	N	E	L	G	A	G	C	S	W	L	A	A	A	T	S	Y	S
Query Conservation
Alig confidence						.	.																																							.	.	.	.	.	.												.																	.	.
Template Conservation						.	.																																							.	.	.	.	.	.												.																	.	.
Template Sequence		K	N	N	P	.	.	D	S	F	R	I	F	G	P	D	E	T	A	S	N	R	L	N	A	T	Y	E	V	T	D	K	Q	W	D	N	G	Y	L	S	G	L	V	D	E	.	.	.	.	.	.	H	M	A	V	T	G	Q	V	T	E	Q	.	L	S	E	H	Q	C	E	G	F	L	E	A	Y	L	L	T	.	.
Template Known Secondary structure				S	T	.	.	T	T						S	S		T	T	T	T	T		G	G	G	G	G	T							S					T	T	T			.	.	.	.	.	.	S			S	S		S					.	S															T	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.																																							.	.	.	.	.	.												.																	.	.
Template SS confidence
		424	.	.	.			.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.							.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.		.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
		588	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.									.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650						.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	N	N	L	P	M	I	P	F	Y	I	Y	Y	S	M	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	F	Q	R	I	G	D	L	C	W	A	A	G	D	Q	Q	A	R	G	F	L	I	G	G	T	S	G	R	T	T	L	N	G	E	G	L	Q	H	E	D	G	H	S	H	I	Q	S	.	.	.	.	.	L	T	I	P
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Alig confidence		.															.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	G	R	H	G	I	W	S	S	Y	E	S	F	V	H	V	I	D	S	M	L	N	Q	H	A	K	W	L	E	A	T	V	R	E	I	P	W	R	K	P	I	S	S	V	N	L	L	V	S	S	H	V	W	R	Q	D	H	N	G	F	S	H	Q	D	P	G	V	T	S	L	L	I	N	K	T	F	N	N	D	H
Template Known Secondary structure		.	T									G	G	G	G	G	G	G																			T	T	S				B								S		G	G	G		T	T	S		G	G	G				T							T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
		655	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.					.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.
Query Sequence		N	C	I	S	Y	D	P	A	Y	A	Y	E	V	A	V	I	M	H	D	G	L	E	R	M	Y	G	E	K	Q	E	N	V	Y	Y	Y	I	T	T	L	N	E	N	Y	H	M	P	A	M	P	E	G	A	E	E	G	I	R	K	G	I	Y	K	L	.	.	.	.	E	T	I	E	G	S	K	G	K	V	Q	L	L
Query Conservation																																																																	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.														.	.																		.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.														.	.
Template Sequence		V	T	N	I	Y	F	A	T	D	A	N	M	L	L	A	I	S	E	K	C	F	K	S	T	N	K	I	.	.	.	.	N	A	I	F	A	G	K	Q	P	A	P	T	W	.	.	V	T	L	D	E	A	R	A	E	L	E	A	G	A	A	E	W	K	W	A	S	N	A	E	N	N	D	E	V	Q	V	V	L	A
Template Known Secondary structure										S															B	S			.	.	.	.								S						.	.	S												S					T	T	T				S	S	T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.					.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.			.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
		731	.	.	.	.	.	.	.		.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.		800	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																																																														.
Query SS confidence										.																																																														.
Query Sequence		G	S	G	S	I	L	R	H	.	V	R	E	A	A	E	I	L	A	K	D	Y	G	V	G	S	D	V	Y	S	V	T	S	F	T	E	L	A	R	D	G	Q	D	C	E	R	W	N	M	L	H	P	L	E	T	P	R	V	P	Y	I	A	Q	V	M	N	D	A	P	A	V	.	A	S	T	D	Y	M	K	L	F
Query Conservation										.																																																														.
Alig confidence										.												.																					.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																						.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	G	D	V	P	T	Q	E	L	M	A	A	S	D	A	L	N	K	M	.	G	I	K	F	K	V	V	N	V	V	D	L	L	K	L	Q	S	R	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	E	A	L	T	D	E	E	F	T	E	L	F	T	A	D	K	P	V	L	F	A	Y	H	S	Y	A	Q	D	V
Template Known Secondary structure				S																	T	.	T										B	G	G	G	G	S		T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S												S	S	S							S	S
Template Predicted Secondary structure																						.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		646	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.		.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.									.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.
		809	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.									.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	Q	V	R	T	Y	V	P	A	D	D	Y	R	V	L	G	T	D	G	F	G	R	S	D	S	R	E	N	L	R	H	H	F	E	V	D	A	S	Y	V	V	V	A	A	L	G	E	L	A	K	R	G	E	I	D	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	A	D	A	I	A	K	F	N	I	D	A	D
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	G	L	I	Y	D	R	P	N	H	D	N	F	H	V	V	G	Y	K	E	Q	G	S	T	T	T	P	F	D	M	V	R	V	N	D	M	D	R	Y	A	L	Q	A	A	A	L	K	L	I	D	A	D	K	Y	A	D	K	I	D	E	L	N	A	F	R	K	K	A	F	Q	F	A	V	D	N	G	Y	D	I	P
Template Known Secondary structure					T	T	T	S	T	T	G	G	G								S				S										T	T		S														T	T	T	T																						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		717	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.
		881	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	V	N	P	R	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	F	T	D	W	V
Template Known Secondary structure					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		797	.	.	800	.	.