Job Description P0AFG8 Confidence 99.67% Date Thu Jan 5 11:26:11 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 454 % Identity 15% Template c2yicC_ PDB info PDB header:lyase Chain: C: PDB Molecule:2-oxoglutarate decarboxylase; PDBTitle: crystal structure of the suca domain of mycobacterium smegmatis2 alpha-ketoglutarate decarboxylase (triclinic form) Resolution 1.96 Å

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		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.				.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.																				.	.	.
Query SS confidence																																						.																				.	.	.
Query Sequence		I	G	A	I	Y	Q	A	K	F	L	K	Y	L	E	H	R	G	L	K	D	T	S	K	Q	T	V	Y	A	F	L	G	D	G	E	M	D	.	E	P	E	S	K	G	A	I	T	I	A	T	R	E	K	L	D	N	L	.	.	.	V	F	V	I	N	C	N	L	Q	R	L	D	G	P	V	T	G	N	G	K	I
Query Conservation																																						.																				.	.	.
Alig confidence																																						.																		.		.	.	.
Template Conservation																																																								.
Template Sequence		P	V	L	E	G	L	V	R	A	K	Q	D	L	L	D	T	G	E	E	G	R	F	S	V	V	P	L	M	L	H	G	D	A	A	F	A	G	Q	G	V	V	A	E	T	L	N	L	A	L	L	R	G	Y	R	.	T	G	G	T	I	H	I	V	V	N	N	Q	I	G	F	T	T	A	P	T	D	S	R	S	S
Template Known Secondary structure															T	T		S	T	T																											T	T	T	T		T	T	T		.		S										S		B	T	T	B							S	S
Template Predicted Secondary structure																																																								.
Template SS confidence
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.		.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	E	L	E	G	I	F	E	G	A	G	W	N	V	I	K	V	M	W	G	S	R	W	D	E	L	L	R	K	D	T	S	G	K	L	I	Q	L	M	N	E	T	V	D	G	D	Y	Q	T	F	K	S	K	D	G	A	Y	V	R	E	H	F	F	G	K	Y	P	E	T	A	A	L	V	A	D	W	T	D	E
Query Conservation
Alig confidence		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	E	Y	C	T	D	V	A	K	M	I	G	A	P	I	F	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	S	S	T	T	G	G	G	G	G	G	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			693	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.				.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.			.	430
Predicted Secondary structure																												.	.	.																																																.	.
Query SS confidence																												.	.	.																																																.	.
Query Sequence		Q	I	W	A	L	N	R	G	G	H	D	P	K	K	I	Y	A	A	F	K	K	A	Q	E	T	K	.	.	.	G	K	A	T	V	I	L	A	H	T	I	K	G	Y	G	M	G	D	A	A	E	G	K	N	I	A	H	Q	V	K	K	M	N	M	D	G	V	R	H	I	R	D	R	F	N	V	P	.	.	V	S
Query Conservation																												.	.	.																																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.																.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	N	G	D	D	P	E	A	C	A	W	V	A	R	L	A	V	D	F	R	Q	A	F	K	K	D	V	V	I	D	M	L	C	Y	R	R	R	G	.	.	.	.	.	.	.	H	N	E	G	D	D	P	S	M	T	Q	P	Y	M	Y	D	V	I	D	T	K	R	G	S	R	K	A	Y	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.		T	T																																	S		.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T			G	G	G	T									T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.								.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	D	I	E	K	L	P	Y	I	T	F	P	E	G	S	E	E	H	T	Y	L	H	A	Q	R	Q	K	L	H	G	Y	L	P	S	R	Q	P	N	F	T	E	K	L	E	L	P	S	L	Q	D	F	G	A	L	L	E	E	Q	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	L	I	G	R	G	D	I	S	M	K	E	A	E	D	A	L	R	D	Y	Q	G	Q	L	E	R	V	F	N	E	V	R	E	L	E	K	H	E	L	A	T	A	V	D	K	A	M	L	Q	R	I	G	D	A	H	L	A	L	P	E	G	F	T	V	H	P	R	V	R	P	V	L	E	K	R	R	E	M	A
Template Known Secondary structure							T	T	S	S																																															T	T				T	T					T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		776	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.
					492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	E	I	S	T	T	I	A	F	V	R	A	L	N	V	M	L	K	N	K	S	I	K	D	R	L	V	P	I	I	A	D	E	A	R	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	E	G	L	F	R	Q	I	G	I	Y	S	P	N	G	Q	Q	Y	T	P	Q	D
Query Conservation		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																			.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.																																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	G	R	I	D	W	A	F	A	E	L	L	A	L	G	S	L	I	A	E	.	.	.	G	K	L	V	R	L	S	G	Q	D	T	Q	R	G	T	F	T	Q	R	H	A	V	I	V	D	R	K	T	G	E	E	F	T	P	L	Q	L	L	A	T	N	P	D	G	T	P	T	G	G	K	F	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						B																T	.	.	.	T								T	T	T	T	T		T	T	S				S	S				T	T	T						G	G	G	G	G	G	B		T	T	S		B		S				.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.																																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		872	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.				.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.													.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	Q	V	A	Y	Y	K	E	D	E	K	G	Q	I	L	Q	E	G	I	N	E	L	G	A	G	C	S	W	L	A	A	A	T	S	Y	S	T	N	N	L	P	M	I	P	F	Y	I	Y	Y	S	M	F	G	F	Q	R	I	G	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	W	A	A	G	D	Q
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	Y	N	S	A	L	S	E	F	A	A	V	G	F	E	Y	G	Y	S	V	G	.	.	.	.	.	.	N	P	D	A	M	V	L	W	E	A	Q	F	G	D	F	V	N	G	A	Q	S	I	I	D	E	F	I	S	S	G	E	A	K	W	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S		S														.	.	.	.	.	.		T	T	S							S	S	G	G	G	G	G	G	G							T	T	T	T						.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template SS confidence
															944	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.							.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.					1000
		619	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.			.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.		680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.																																					.
Query SS confidence																											.	.																																					.
Query Sequence		Q	A	R	G	F	L	I	G	G	T	S	G	R	T	T	L	N	G	E	G	L	Q	H	E	D	.	.	G	H	S	H	I	Q	S	L	T	I	P	N	C	I	S	Y	D	P	A	Y	A	Y	E	V	A	V	I	M	H	D	G	L	E	R	M	Y	.	G	E	K	Q	E	N	V	Y	Y	Y	I	T	T	L	N	E
Query Conservation																											.	.																																					.
Alig confidence													.	.	.												.	.																																					.			.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	L	S	D	V	V	L	L	L	P	H	.	.	.	G	H	E	G	Q	G	P	D	H	T	S	G	R	I	E	R	F	L	Q	L	W	A	E	G	S	M	T	I	A	M	P	S	T	P	A	N	Y	F	H	L	L	R	R	H	G	K	D	G	I	Q	R	P	.	.	.	.	.	L	I	V	F	T	P	K	S	M
Template Known Secondary structure													.	.	.			S	S	S		T	T	S	S													T	T	S								S														S	S					.	.	.	.	.							S	G	G
Template Predicted Secondary structure													.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1001	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.				.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.						.	.	.	.	.	.	1070	.	.
		696	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.								720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Y	H	M	P	A	M	P	E	G	A	E	E	G	I	R	K	G	I	Y	K	L	E	T	.	.	.	.	.	.	.	I	E	G	S	K	G	K	V	Q	L	L	G	S	G	S	I	L	R	H	V	R	E	A	A	E	I	L	A	K	D	Y	G	V	G	S	D	V	Y	S	V	T	S	F	T	E	L	A	R	D
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.															.							.									.
Template Conservation																																															.							.									.
Template Sequence		L	R	N	K	A	A	V	S	D	I	R	D	F	T	E	S	K	F	R	S	V	L	E	E	P	M	Y	T	D	G	E	G	D	R	N	K	V	T	R	L	L	L	T	S	G	.	K	I	Y	Y	E	L	.	A	A	R	K	A	K	E	N	.	R	E	D	V	A	I	V	R	I	E	Q	L	A	P	L	P	R	R
Template Known Secondary structure		G	G		T	T	S		B							S					S									T	S	S			G	G	G									S	.	T						.								T	.		T	T											S
Template Predicted Secondary structure																																															.							.									.
Template SS confidence
		1073	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	1120	.	.	.		.	.	.	.	.	.	1130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		769	770	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Q	D	C	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	L	A	E	T
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1150	.	.	.	.