Job Description P0AFG8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:26:11 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 636 % Identity 24% Template c2e6kB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: x-ray structure of thermus thermopilus hb8 tt0505 Resolution 2.09 Å

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.
Query Sequence		E	L	E	R	R	I	R	S	A	I	R	W	N	A	I	M	T	V	L	R	A	S	K	K	D	L	E	L	G	G	H	M	A	S	F	Q	S	S	A	T	I	Y	D	V	C	F	N	H	F	F	R	.	.	.	.	A	R	N	E	Q	D	G	G	D	L	V	Y	F	Q	G	H	I	S	P	G	V	Y	A	R	A
Query Conservation																																																					.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	E	T	L	S	V	N	A	I	R	F	L	A	I	D	A	V	E	K	A	R	.	.	.	.	.	.	S	G	H	P	G	X	P	X	G	X	A	P	L	A	Y	L	L	F	R	E	V	X	R	H	N	P	L	D	P	D	W	P	D	R	D	R	F	V	L	S	A	G	H	G	S	X	L	L	Y	A	V	L
Template Known Secondary structure																							T	.	.	.	.	.	.		S																		T	T					T	T		T	T		T	T	S						S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.							.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		153	.	.	.	.		.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.				.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																																																									.	.	.
Query SS confidence							.																																																									.	.	.
Query Sequence		F	L	E	G	R	.	L	T	Q	E	Q	L	D	N	F	R	Q	E	V	H	G	N	G	L	S	S	Y	P	H	P	K	L	M	P	E	F	W	Q	F	P	T	V	S	M	G	L	G	P	I	G	A	I	Y	Q	A	K	F	L	K	Y	L	E	.	.	.	H	R	G	L	K	D	T	S	K	Q	T	V	Y	A	F
Query Conservation							.																																																									.	.	.
Alig confidence							.													.	.																.																											.	.	.
Template Conservation																				.	.																.
Template Sequence		H	L	T	G	Y	D	L	P	L	E	E	L	K	S	F	R	Q	W	.	.	G	S	K	T	P	G	H	P	E	R	G	H	T	P	G	.	V	E	V	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	S	T	A	V	G	L	A	L	A	E	R	K	L	A	A	E	F	N	R	P	G	H	V	V	V	D	H	Y	T	Y	V	L
Template Known Secondary structure				T	T		S							T	T	T	T		T	.	.	T		S			S	S			T	T	T	S	T	T	.			S				S	T	T																						B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																				.	.																.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.			.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.		.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	D	G	E	M	D	E	P	E	S	K	G	A	I	T	I	A	T	R	E	K	L	D	N	L	V	F	V	I	N	C	N	L	Q	R	L	D	G	P	V	T	G	N	G	K	I	I	N	E	L	E	G	I	F	E	G	A	G	W	N	V	I	K	V	M	W	G	S	R	W	D	E	L	L	R	K	D	T	S
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	D	G	D	L	X	E	G	V	S	G	E	A	A	S	L	A	G	H	W	G	L	S	K	L	I	V	F	W	D	D	N	R	I	S	I	D	G	P	T	D	L	A	F	T	.	.	E	D	V	L	A	R	Y	R	A	Y	G	W	Q	T	L	R	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S														T		T	T												T	T			G	G	G	T			.	.	S									T	T							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.			.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	L	I	Q	L	M	N	E	T	V	D	G	D	Y	Q	T	F	K	S	K	D	G	A	Y	V	R	E	H	F	F	G	K	Y	P	E	T	A	A	L	V	A	D	W	T	D	E	Q	I	W	A	L	N	R	G	G	H	D	P	K	K	I	Y	A	A	F	K	K	A	Q	E	T	K	G	K	A	T	V	I	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	N	D	L	E	A	L	R	K	A	I	K	L	A	K	L	D	E	.	R	P	T	L	I	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T															S	S	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
																																																								221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.		240	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	H	T	I	K	G	Y	G	M	G	D	A	A	E	G	K	N	I	A	H	Q	V	K	K	M	N	M	D	G	V	R	H	I	R	D	R	F	N	V	P	V	S	D	A	D	I	E	K	L	P	Y	I	T	F	P	E	G	S	E	E	H	T	Y	L	H	A	Q	R	Q	K	L	H	G	Y	L	P	S	R	Q	P
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.
Template Conservation															.	.	.
Template Sequence		V	R	S	H	I	G	F	G	S	P	K	Q	D	.	.	.	S	A	K	A	H	G	E	P	L	G	P	E	A	V	E	A	T	R	R	N	L	G	W	P	Y	P	P	F	V	V	P	E	E	V	Y	R	H	X	D	X	R	E	K	G	R	A	W	Q	E	A	W	E	K	A	L	E	A	Y	A	R	A	Y	P	D
Template Known Secondary structure						T	T	T	T	S	T	T	T	T	.	.	.	S	G	G	G	T	S	S														T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.				.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.			.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.
Query SS confidence										.	.
Query Sequence		N	F	T	E	K	L	E	L	.	.	P	S	L	Q	D	F	G	A	L	L	E	E	Q	S	K	E	I	S	T	T	I	A	F	V	R	A	L	N	V	M	L	K	N	K	S	I	K	D	R	L	V	P	I	I	A	D	E	A	R	T	F	G	M	E	G	L	F	R	Q	I	G	I	Y	S	P	N	G	Q	Q	Y
Query Conservation										.	.
Alig confidence										.	.																															.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	H	Q	E	L	X	R	R	L	R	G	E	L	P	P	L	P	E	E	P	P	S	F	D	K	P	I	A	T	R	A	A	S	G	R	A	L	N	L	L	.	.	.	A	P	R	L	P	E	L	L	G	G	S	A	D	L	T	P	S	N	N	T	K	A	E	G	X	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T								S						S		B														.	.	.	G	G	G		T	T						S	S						T		S		T	T			B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.				.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	Q	D	R	E	Q	V	A	Y	Y	K	E	D	E	K	G	Q	I	L	Q	E	G	I	N	E	L	G	A	G	C	S	W	L	A	A	A	T	S	Y	S	T	N	N	L	P	M	I	P	F	Y	I	Y	Y	S	M	F	G	F	Q	R	I	G	D	L	C	W	A	A	G	D	Q	Q	A	R	G	F	L	I	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	R	A	N	P	L	G	R	Y	L	H	F	G	V	R	E	H	A	X	G	A	I	L	N	G	L	N	L	H	.	.	.	.	.	G	G	Y	R	A	Y	G	G	T	F	L	V	F	S	D	Y	X	R	P	A	I	R	L	A	A	.	.	L	X	G	V	P	T	V	F	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S		T	T								S																.	.	.	.	.	S	S									G	G	G	G	G	G	G									.	.			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
											390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.						420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.			.	.	.	.	.	450	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	S	G	R	T	T	L	N	G	E	G	L	Q	H	E	D	G	H	S	H	I	Q	S	L	T	I	P	N	C	I	S	Y	D	P	A	Y	A	Y	E	V	A	V	I	M	H	D	G	L	E	R	M	Y	G	E	K	Q	E	N	V	Y	Y	Y	I	T	T	L	N	E	N	Y	H	M	P	A	M	P	E	G	A
Query Conservation
Alig confidence																																																									.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.												.	.	.	.
Template Sequence		F	T	H	D	S	I	A	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	V	E	H	L	X	S	L	R	A	X	P	N	L	F	V	I	R	P	A	D	A	Y	E	T	F	Y	A	W	L	V	A	L	R	R	K	E	G	P	.	.	.	.	T	A	L	V	L	T	R	Q	A	V	P	.	.	.	.	L	L	S	P	E	K
Template Known Secondary structure						S	G	G	G		T	T		T	T	T	S		S	S							T	S	T	T							S	S																S	S		.	.	.	.							S	S		B		.	.	.	.				T	T	G
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.												.	.	.	.
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.					.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.					520	.	.	.	.	.
		707	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	G	I	R	K	G	I	Y	K	L	E	T	I	E	G	S	K	G	K	V	Q	L	L	G	S	G	S	I	L	R	H	V	R	E	A	A	E	I	L	A	K	D	Y	G	V	G	S	D	V	Y	S	V	T	S	F	T	E	L	A	R	D	G	Q	D	C	E	R	W	N	M	L	H	P	L	E	T	P	R	V
Query Conservation
Alig confidence																		.	.																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	G	L	L	R	G	G	Y	V	L	E	D	V	E	E	.	.	P	Q	G	V	L	V	A	T	G	S	E	V	H	L	A	L	R	A	Q	A	L	L	R	E	K	.	G	V	R	V	R	V	V	S	L	P	S	F	E	L	F	A	A	Q	P	E	A	Y	R	K	E	V	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G	G	S	S							S	S	.	.		S							T	T															T	.	T									S							T	S									S		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.		.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
		787	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Y	I	A	Q	V	M	N	D	A	P	A	V	A	S	T	D	Y	M	K	L	F	A	E	Q	V	R	T	Y	V	P	A	D	D	Y	R	V	L	G	T	D	G	F	G	R	S	D	S	R	E	N	L	R	H	H	F	E	V	D	A	S	Y	V	V	V	A	A	L	G	E	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	P	G	L	P	V	V	A	V	E	A	G	A	S	L	G	W	E	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	A	H	K	V	V	A	L	D	R	F	G	A	S	A	P	Y	P	E	V	Y	E	R	L	G	F	T	P	E	R	V	A	E	A	F	L	S	L	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	T	T	S							S	S			T	T	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.		S							S				S			T	T						T	T		S										T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.								.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.