Job Description P0AFG8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:26:11 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 640 % Identity 22% Template c1itzC_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:transketolase; PDBTitle: maize transketolase in complex with tpp Resolution 2.30 Å

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		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.
Query Sequence		E	L	E	R	R	I	R	S	A	I	R	W	N	A	I	M	T	V	L	R	A	S	K	K	D	L	E	L	G	G	H	M	A	S	F	Q	S	S	A	T	I	Y	D	V	C	F	N	H	F	F	R	.	.	.	.	A	R	N	E	Q	D	G	G	D	L	V	Y	F	Q	G	H	I	S	P	G	V	Y	A	R	A
Query Conservation																																																					.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	L	E	K	S	V	N	T	I	R	F	L	A	I	D	A	V	E	K	A	N	.	.	.	.	.	.	S	G	H	P	G	L	P	M	G	C	A	P	M	G	H	V	L	Y	D	E	V	M	R	Y	N	P	K	N	P	Y	W	F	N	R	D	R	F	V	L	S	A	G	H	G	C	M	L	Q	Y	A	L	L
Template Known Secondary structure																							T	.	.	.	.	.	.		S																			T					T	T		T	T		T	T							S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.							.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		153	.	.	.	.			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.				.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.																																																									.	.	.
Query SS confidence							.	.																																																									.	.	.
Query Sequence		F	L	E	G	R	.	.	L	T	Q	E	Q	L	D	N	F	R	Q	E	V	H	G	N	G	L	S	S	Y	P	H	P	K	L	M	P	E	F	W	Q	F	P	T	V	S	M	G	L	G	P	I	G	A	I	Y	Q	A	K	F	L	K	Y	L	E	.	.	.	H	R	G	L	K	D	T	S	K	Q	T	V	Y	A
Query Conservation							.	.																																																									.	.	.
Alig confidence							.	.													.	.																.																											.	.	.
Template Conservation																					.	.																.
Template Sequence		H	L	A	G	Y	D	S	V	K	E	E	D	L	K	Q	F	R	Q	W	.	.	G	S	R	T	P	G	H	P	E	N	F	E	T	P	G	.	V	E	V	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	A	N	A	V	G	L	A	L	A	E	K	H	L	A	A	R	F	N	K	P	D	S	E	I	V	D	H	Y	T	Y	V
Template Known Secondary structure					T		T	T							T	T	T	T	S	T	.	.	T		S	S		S	S			T	T	T		T	T	.			S				S	T	T																						B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																					.	.																.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.			.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.		.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	L	G	D	G	E	M	D	E	P	E	S	K	G	A	I	T	I	A	T	R	E	K	L	D	N	L	V	F	V	I	N	C	N	L	Q	R	L	D	G	P	V	T	G	N	G	K	I	I	N	E	L	E	G	I	F	E	G	A	G	W	N	V	I	K	V	M	W	G	S	R	W	D	E	L	L	R	K	D	T
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	G	D	G	C	Q	M	E	G	I	A	N	E	A	C	S	L	A	G	H	W	G	L	G	K	L	I	A	F	Y	D	D	N	H	I	S	I	D	G	D	T	E	I	A	F	T	.	.	E	D	V	S	T	R	F	E	A	L	G	W	H	T	I	W	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S														T		T	T									S			T	T			G	G	G	T			.	.	S									T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.			.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.			.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.
Query SS confidence																																																													.	.
Query Sequence		S	G	K	L	I	Q	L	M	N	E	T	V	D	G	D	Y	Q	T	F	K	S	K	D	G	A	Y	V	R	E	H	F	F	G	K	Y	P	E	T	A	A	L	V	A	D	W	T	D	E	Q	I	W	A	L	N	R	G	G	H	D	.	.	P	K	K	I	Y	A	A	F	K	K	A	Q	E	T	K	G	K	A	T
Query Conservation																																																													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	G	N	T	G	Y	D	D	I	R	A	A	I	K	E	A	K	A	V	T	D	K	P	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T	T																	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																									229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.					.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.
Query Sequence		V	I	L	A	H	T	I	K	G	Y	G	M	G	D	A	A	E	G	K	N	I	A	H	Q	V	K	K	M	N	M	D	G	V	R	H	I	R	D	R	F	N	V	P	V	S	D	A	D	I	E	K	L	P	Y	I	T	F	.	.	.	.	P	E	G	S	E	E	H	T	Y	L	H	A	Q	R	Q	K	L	H	G
Query Conservation																																																											.	.	.	.
Alig confidence																		.	.																																								.	.	.	.
Template Conservation																		.	.
Template Sequence		L	I	K	V	T	T	T	I	G	F	G	S	P	N	K	A	.	.	N	S	Y	S	V	H	G	S	A	L	G	A	K	E	V	E	A	T	R	Q	N	L	G	W	P	Y	D	T	F	F	V	P	E	D	V	K	S	H	W	S	R	H	T	P	E	G	A	A	L	E	A	D	W	N	A	K	F	A	E	Y	E	K
Template Known Secondary structure									T	T	T	T		T	T	T	T	.	.	T	S	G	G	G	T	S	S															T					T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.
Template SS confidence
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.			270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490				.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		Y	L	P	S	R	Q	P	N	F	T	E	K	L	E	L	P	S	L	Q	D	F	G	A	L	L	E	E	Q	S	.	.	.	K	E	I	S	T	T	I	A	F	V	R	A	L	N	V	M	L	K	N	K	S	I	K	D	R	L	V	P	I	I	A	D	E	A	R	T	F	G	M	E	G	L	F	R	Q	I	G	I
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence																															.	.	.																	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Y	A	D	D	A	A	T	L	K	S	I	I	T	G	E	L	P	T	G	W	V	D	A	L	P	K	Y	T	P	E	S	P	G	D	A	T	R	N	L	S	Q	Q	C	L	N	A	L	.	.	.	A	N	V	V	P	G	L	I	G	G	S	A	D	L	A	S	S	N	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S																	T	T	G	G	G	G	S					T	T	S			B														.	.	.					T	T						S	S						T		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.				380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	P	N	G	Q	Q	Y	T	P	Q	D	R	E	Q	V	A	Y	Y	K	E	D	E	K	G	Q	I	L	Q	E	G	I	N	E	L	G	A	G	C	S	W	L	A	A	A	T	S	Y	S	T	N	N	L	P	M	I	P	F	Y	I	Y	Y	S	M	F	G	F	Q	R	I	G	D	L	C	W	A	A	G	D	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.																												.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.																												.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	K	M	F	G	D	F	Q	K	D	T	A	E	E	R	N	V	R	F	G	V	R	E	H	G	M	G	A	I	C	N	G	I	A	L	.	.	.	.	H	S	P	G	F	V	P	Y	C	A	T	F	F	V	F	T	D	Y	M	R	G	A	M	R	I	S	A	.	.	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T			B			T	T		T	T			B					S															.	.	.	.			T	T									G	G	G													.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.																												.	.
Template SS confidence
												400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.					.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.			.
		619	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	R	G	F	L	I	G	G	T	S	G	R	T	T	L	N	G	E	G	L	Q	H	E	D	G	H	S	H	I	Q	S	L	T	I	P	N	C	I	S	Y	D	P	A	Y	A	Y	E	V	A	V	I	M	H	D	G	L	E	R	M	Y	G	E	K	Q	E	N	V	Y	Y	Y	I	T	T	L	N	E	N	Y	H
Query Conservation
Alig confidence																																																																	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		S	E	A	G	V	I	Y	V	M	T	H	D	S	I	G	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	I	E	H	L	V	S	F	R	A	M	P	N	I	L	M	L	R	P	A	D	G	N	E	T	A	G	A	Y	K	V	A	V	L	N	R	K	R	P	.	.	.	.	S	I	L	A	L	S	R	Q	K	L	P	.	.
Template Known Secondary structure			T											S	G	G	G		T	T		T	T	T			S	S							T	S	T	T								S															T	T	S		.	.	.	.							S	S		B		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.					.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
		699	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		M	P	A	M	P	E	G	A	E	E	G	I	R	K	G	I	Y	K	L	E	T	I	.	E	G	S	K	G	K	V	Q	L	L	G	S	G	S	I	L	R	H	V	R	E	A	A	E	I	L	A	K	D	Y	G	V	G	S	D	V	Y	S	V	T	S	F	T	E	L	A	R	D	G	Q	D	C	E	R	W	N	M
Query Conservation																								.
Alig confidence		.	.																					.																														.
Template Conservation		.	.																																																			.
Template Sequence		.	.	H	L	P	G	T	S	I	E	G	V	E	K	G	G	Y	T	I	S	D	N	S	T	G	N	K	P	D	L	I	V	M	G	T	G	S	E	L	E	I	A	A	K	A	A	D	E	L	R	K	E	.	G	K	T	V	R	V	V	S	F	V	S	W	E	L	F	D	E	Q	S	D	E	Y	K	E	S	V	L
Template Known Secondary structure		.	.			T	T								T	S	S								S	T	T			S							G	G	G														T	.	T									S								S									S
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																			.
Template SS confidence
				538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.		.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
		778	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	H	P	L	E	T	P	R	V	P	Y	I	A	Q	V	M	N	D	A	P	A	V	A	S	T	D	Y	M	K	L	F	A	E	Q	V	R	T	Y	V	P	A	D	D	Y	R	V	L	G	T	D	G	F	G	R	S	D	S	R	E	N	L	R	H	H	F	E	V	D	A	S	Y	V	V	V	A	A
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Sequence		P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	V	T	A	R	I	S	I	E	A	G	S	T	L	G	W	Q	K	Y	V	.	.	.	.	G	A	Q	G	K	A	I	G	I	D	K	F	G	A	S	A	P	A	G	T	I	Y	K	E	Y	G	I	T	V	E	S	I	I	A	A	A
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									S	S			T	T	T					.	.	.	.		S	S								S				S	S									T	T		S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template SS confidence
		615															.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.					.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.