Job Description P27302 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:43:48 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 630 % Identity 18% Template c3ahhA_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:xylulose 5-phosphate/fructose 6-phosphate phosphoketolase; PDBTitle: h142a mutant of phosphoketolase from bifidobacterium breve complexed2 with acetyl thiamine diphosphate Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60		.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query Sequence		M	S	S	R	K	E	L	A	N	A	I	R	A	L	S	M	D	A	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	K	S	G	H	P	G	A	P	M	G	M	A	D	I	A	E	V	L	W	R	D	F	L	K	H	N	P	Q	N	P	S	W	A	D	R	D	R	F	.	V	L
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.				.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	G	M	D	K	Y	W	R	V	T	N	Y	M	S	I	G	Q	I	Y	L	R	S	N	P	L	M	K	E	P	F	T	R	D	D	V	K	H	R	L	V	G	H	W	G	T	T	P	G	L	N	F	L	L	A	H	I	N	R	L	I	A	D	H	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	V	F	I	M
Template Known Secondary structure																						B	S	S		T	T			S	S			G	G	G	B		S	S			S			S	S																			T	B	.	.	.	.	.	.	.	.		B
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.									.	.	90	.	.	.
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.									80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.			.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Query Sequence		S	N	G	H	G	S	M	L	I	Y	S	L	L	H	L	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	L	P	M	E	E	L	K	N	F	R	Q	L	H	S	K	T	P	G	H	P	E	V	G	.	.	Y	T	A	G	V	E	T	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	A	N	A	V	G	M	A	I	A	E	K	T
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		G	P	G	H	G	G	P	A	G	T	S	Q	S	Y	V	D	G	T	Y	T	E	Y	Y	P	N	I	T	K	D	E	A	G	L	Q	K	F	F	R	Q	F	S	Y	P	G	G	I	P	S	A	F	A	P	E	T	P	G	S	I	H	E	G	G	E	L	G	Y	A	L	S	H	A	Y	G	A	V	M	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	G	G	G												S							T	T	S		S	S											B	T		T	T	S	B		S	S			T	T	S	T	T		S				S	S	T	T											T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.				.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.			.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.																																	.	.
Query SS confidence																															.	.	.																																	.	.
Query Sequence		L	A	A	Q	F	N	R	P	G	H	D	I	V	D	H	Y	T	Y	A	F	M	G	D	G	C	M	M	E	G	.	.	.	I	S	H	E	V	C	S	L	A	G	T	L	K	L	G	K	L	I	A	F	Y	D	D	N	G	I	S	I	D	G	H	V	.	.	E	G	W	F	T	D	D	T	A	M	R	F	E	A
Query Conservation																															.	.	.																																	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.																																	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	P	S	L	F	V	P	C	I	I	G	D	G	E	A	E	T	G	P	L	A	T	G	W	Q	S	N	K	L	V	N	P	R	T	D	G	I	V	L	P	I	L	H	L	N	G	Y	K	I	A	N	P	T	I	L	A	R	I	S	D	E	E	L	H	D	F	F	R	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		T	T									T	T	G	G	G	S							G	G	G	G	G	S	S		T	T	T	S											S	B	S	S	S	S	B						S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.				.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.							.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure											.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	G	W	H	V	I	R	D	I	.	.	.	D	G	H	D	A	A	S	I	K	R	A	V	E	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	V	T	D	K	P	S	L	L	M	C	K	T	I	I	G	F	G	S	P	N	K	.	.	.	.	.	.	A	G	T	H	D	S
Query Conservation											.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	G	Y	H	P	Y	E	F	V	A	G	F	D	N	E	D	H	M	S	I	H	R	R	F	A	E	L	F	E	T	I	F	D	E	I	C	D	I	K	A	A	A	Q	T	D	D	M	T	R	P	F	Y	P	M	L	I	F	R	T	P	K	G	W	T	C	P	K	F	I	D	G	K	K	T	E	G	S	W	R	A
Template Known Secondary structure		T	T									S	S	S																														T	T			S	S													T	T	T	T	S		S			T	T				T	T	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	G	A	P	L	G	D	A	E	I	A	L	T	R	E	Q	L	G	W	K	Y	A	P	F	E	I	P	S	E	I	Y	A	Q	W	D	A	K	E	A	G	Q	A	K	E	S	A	W	N	E	K	F	A	A	Y	A	K	A	Y	P	Q	E	A	A	E	F	T	R	R	M	K	G	E	M	P	S	D	F	D	A	K
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		H	Q	V	P	L	A	S	A	R	D	T	E	E	H	F	E	V	L	K	G	W	M	E	S	Y	K	P	E	E	L	F	N	.	.	.	.	.	A	D	G	S	I	K	D	D	V	T	A	F	M	P	K	G	E	L	R	I	G	A	N	P	N	A	N	G	G	V	I	R	E	D	L	K	L	P	E	L	D	Q	Y
Template Known Secondary structure		S	S		S		T	T	T	T	T	T	S													T		G	G	G	T	B		.	.	.	.	.	T	T	S		B						T	T	S			G	G	G	S	T	T	T		G	G	G	G	G	G	G	T									G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.						.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.		.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.															.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	K	E	F	I	A	K	L	Q	A	N	P	A	K	I	A	S	R	K	A	S	Q	N	A	I	E	A	F	G	P	L	L	P	.	E	F	L	G	G	S	A	D	L	A	P	S	N	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	W	S	G	S	K	A	I	N	E	D	A	A	G	N	Y	I
Query Conservation																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	T	G	V	K	E	Y	G	H	G	W	G	Q	V	E	A	P	R	A	L	G	A	Y	C	R	D	I	I	K	N	N	P	D	S	F	R	I	F	G	P	D	E	T	A	S	N	R	L	N	A	T	Y	E	V	T	D	K	Q	W	D	N	G	Y	L	S	G	L	V	D	E	H	M	A	V	T	G	Q	V	T
Template Known Secondary structure				T							T	T						T															S	T	T	T						S	S		T	T	T	T	T		G	G	G	G	G	T							S					T	T	T			S			S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.				440	.	.	.	.					.	.	.	.	.	450	.							.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.						.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.						.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	Y	G	V	R	E	F	G	M	T	A	I	A	N	G	I	S	L	H	G	G	F	L	P	Y	T	S	T	F	L	M	F	V	E	.	.	.	Y	A	R	N	A	.	.	.	.	V	R	M	A	A	L	M	.	.	.	.	.	.	K	Q	R	Q	V	M	V	Y	T	H	D	S	I	G	L	G	E	D	G	P	T
Query Conservation																																				.	.	.						.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																				.													.	.	.						.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.																				.
Template Sequence		E	.	Q	L	S	E	H	Q	C	E	G	F	L	E	A	Y	L	L	T	G	R	.	H	G	I	W	S	S	Y	E	S	F	V	H	V	I	D	S	M	L	N	Q	H	A	K	W	L	E	A	T	V	R	E	I	P	W	R	K	P	I	S	S	V	N	L	L	V	S	S	H	V	W	R	Q	D	H	N	G	F	S
Template Known Secondary structure			.		S															T	T		.								G	G	G	G	G	G	G																			T	T	S				B								S		G	G	G		T	T	S		G	G
Template Predicted Secondary structure			.																				.
Template SS confidence
		475		.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.		.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.						.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Query Sequence		H	Q	P	V	E	Q	V	A	S	L	.	.	.	.	.	R	V	T	P	N	M	S	T	W	R	P	C	D	Q	V	E	S	A	V	A	W	K	Y	G	V	E	R	Q	D	G	P	T	A	L	I	L	S	R	Q	N	L	A	Q	Q	E	R	T	E	E	Q	L	A	N	I	A	R	G	G	Y	V	L	K	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	Q	D	P	G	V	T	S	L	L	I	N	K	T	F	N	N	D	H	V	T	N	I	Y	F	A	T	D	A	N	M	L	L	A	I	S	E	K	C	F	K	S	T	N	K	I	N	A	I	F	A	G	K	Q	P	A	P	T	W	V	T	L	D	E	A	R	A	E	L	E	A	G	A	A	E	W	K	W	A	S
Template Known Secondary structure		G				T							T	T			T	T											S															B	S										S						S												S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		553	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
				545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.		.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.											590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure		.	.																				.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																				.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	D	C	A	G	Q	P	E	L	I	F	I	A	T	G	S	E	V	E	L	.	A	V	A	A	Y	E	K	L	T	A	E	G	V	K	A	R	V	V	S	M	P	S	T	D	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	Q	D	A	A	Y	R	E	S	V	L	P	K	A	V	T	A	R	V	A	V
Query Conservation		.	.																				.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																				.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		N	A	E	N	N	D	E	V	Q	V	V	L	A	S	A	G	D	V	P	T	Q	E	L	M	A	A	S	D	A	L	N	K	M	G	I	K	F	K	V	V	N	V	V	D	L	L	K	L	Q	S	R	E	N	N	D	E	A	L	T	D	E	E	F	T	E	L	F	T	A	D	K	P	V	L	F	A	Y	H	.	.
Template Known Secondary structure				S	S	T	T	T		S							S																	T	T										B	G	G	G	G	S		T	T	T		T	T	S												S	S	S							S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		633	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710
		612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.						.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	G	I	A	D	Y	W	Y	K	Y	V	.	.	.	.	.	G	L	N	G	A	I	V	G	M	T	T	F	G	E	S	A	P	A	E	L	L	F	E	E	F	G	F	T	V	D	N	V	V	A	K	A	K	E	L	L
Query Conservation														.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	S	Y	A	Q	D	V	R	G	L	I	Y	D	R	P	N	H	D	N	F	H	V	V	G	Y	K	E	Q	G	S	T	T	T	P	F	D	M	V	R	V	N	D	M	D	R	Y	A	L	Q	A	A	A	L	K	L	I
Template Known Secondary structure		.	.	S									T	T	T	S	T	T	G	G	G								S				S										T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				711	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.