Job Description P27302 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:43:48 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 470 % Identity 12% Template c2jgdA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:2-oxoglutarate dehydrogenase e1 component; PDBTitle: e. coli 2-oxoglutarate dehydrogenase (e1o) Resolution 2.6 Å

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		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.			.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.				.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.							.																				.	.	.
Query SS confidence																																													.	.							.																				.	.	.
Query Sequence		T	T	T	G	P	L	G	Q	G	I	A	N	A	V	G	M	A	I	A	E	K	T	L	A	A	Q	F	N	R	P	G	H	D	I	V	D	H	Y	T	Y	A	F	M	.	.	G	D	G	C	M	M	.	E	G	I	S	H	E	V	C	S	L	A	G	T	L	K	L	G	K	L	.	.	.	I	A	F	Y	D	D
Query Conservation																																													.	.							.																				.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.												.	.							.																	.			.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template Sequence		F	N	P	S	H	L	E	I	V	S	P	V	V	I	G	S	V	R	A	R	L	D	R	L	D	.	.	.	.	.	.	.	E	P	S	S	N	K	V	L	P	I	T	I	H	G	D	A	A	V	T	G	Q	G	V	V	Q	E	T	L	N	M	S	K	A	R	G	Y	.	E	V	G	G	T	V	R	I	V	I	N
Template Known Secondary structure					S	S	T	T															T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	S			G	G	G																T									T	T	S	T	T	T	.			S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.				.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.
Query Sequence		N	G	I	S	I	D	G	H	V	E	G	W	F	T	D	D	T	A	M	R	F	E	A	Y	G	W	H	V	I	R	D	I	D	G	H	D	A	A	S	I	K	R	A	V	E	E	A	R	A	V	T	.	.	.	D	K	P	S	L	L	M	C	K	T	I	I	G	F	G	S	P	N	K	A	G	T	H	D	S	H
Query Conservation																																																					.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																					.	.	.																	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																																								.
Template Sequence		N	Q	Y	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	I	G	K	M	V	Q	A	P	I	F	H	.	V	N	A	D	D	P	E	A	V	A	F	V	T	R	L	A	L	D	F	R	N	T	F	K	R	D	V	F	I	D	L	V	C	Y	R	R	H	Q	P	.	L	M	Y	Q	K	I	K	K	H
Template Known Secondary structure					G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	G	T	T	T						.			T	T																																				.	T	T						T	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																																								.
Template SS confidence
		390	.	.	.														.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.		.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.		.	.	.	.	450	.	.	.	.
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	P	L	G	D	A	E	I	A	L	T	R	E	Q	L	G	W	K	Y	A	P	F	E	I	P	S	E	I	Y	A	Q	W	D	A	K	E	A	G	Q	A	K	E	S	A	W	N	E	K	F	A	A	Y	A	K	A	Y	P	Q	E	A	A	E	F	T	R	R	M	K	G	E	M	P	S	D	F	D	A	K	A
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	T	P	R	K	I	Y	A	D	K	L	E	Q	E	K	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	E	D	A	T	E	M	V	N	L	Y	R	D	A	L	D	A	G	D	C	V	V	A	E	W	R	P	M	N	M	H	S	F	T	W	S	P	Y	L	N	H	E	W	D	E	E
Template Known Secondary structure														T	T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	S				T	T						G	G	G		T	T	G	G	G	S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
		342	.	.	.	.	.	.	.																																		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Query Sequence		K	E	F	I	A	K	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	P	A	K	I	A	S	R	K	A	S	Q	N	A	I	E	A	F	G	P	L	L	P	E	F	L	G	G	S	A	D	L	A	P	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	P	N	K	V	E	M	K	R	L	Q	E	L	A	K	R	I	S	T	V	P	E	A	V	E	M	Q	S	R	V	A	K	I	Y	G	D	R	Q	A	M	A	A	G	E	K	L	F	D	W	G	G	A	E	N	L	A	Y	A	T	L	V	D	E	G	I	P	V	R	L	S	G	E	D	S	G	R	G	T	F	F
Template Known Secondary structure																		T	T				T	T	S																		T	T	S	S		B															T	T	T								T	T	T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
											385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400		.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.			.	.		.	.	.	.	.				.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																.	.			.						.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																.	.			.						.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	L	T	L	W	S	G	S	K	A	I	N	E	D	A	.	A	G	N	Y	I	H	Y	G	V	R	E	F	G	M	T	A	I	A	N	G	I	S	L	H	G	G	F	L	P	Y	T	.	.	S	T	.	F	L	M	F	V	.	.	.	E	Y	A	R	N	A	V	R	M	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																.	.			.						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																									.							.	.			.						.	.	.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		H	R	H	A	V	I	H	N	Q	S	N	G	S	T	Y	T	P	L	Q	H	I	H	N	G	Q	G	A	F	R	V	W	D	S	V	L	S	E	E	A	V	L	A	F	E	Y	G	Y	A	T	A	.	E	P	R	T	L	T	I	W	E	A	Q	F	G	D	F	A	N	G	A	Q	V	V	I	D	Q	F	I	S	S
Template Known Secondary structure						S				S	S	S	S					G	G	G		S		T	T											S																.		T	T	S							.		G	G	G	G	G	G	G							T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.		.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.
				449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.			.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510		.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																			.	.																													.
Query SS confidence		.	.																																			.	.																													.
Query Sequence		.	.	A	L	M	K	Q	R	Q	V	M	V	Y	T	H	D	S	I	G	L	G	E	D	G	P	T	H	Q	P	V	E	Q	V	A	S	L	.	.	R	V	T	P	N	M	S	T	W	R	P	C	D	Q	V	E	S	A	V	A	W	K	Y	G	V	E	R	Q	.	D	G	P	T	A	L	I	L	S	R	Q	N	L
Query Conservation		.	.																																			.	.																													.
Alig confidence		.	.																					.														.	.																													.
Template Conservation																								.
Template Sequence		G	E	Q	K	W	G	R	M	C	G	L	V	M	L	L	P	H	G	Y	E	G	Q	.	G	P	E	H	S	S	A	R	L	E	R	Y	L	Q	L	C	A	E	Q	N	M	Q	V	C	V	P	S	T	P	A	Q	V	Y	H	M	L	R	R	Q	A	L	R	G	M	R	R	P	L	V	V	M	S	P	K	S	L	L
Template Known Secondary structure																					S	S	S	.		T	T	S	S										T			T	T									S														S	S											S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		704	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.		.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.
		524	.	.	.	.	.								530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Q	Q	E	R	T	.	.	.	.	.	.	.	E	E	Q	L	A	N	I	A	R	G	G	Y	V	L	K	D	C	A	G	Q	P	E	L	I	F	I	A	T	G	S	E	V	E	L	A	V	A	A	Y	E	K	L	T	A	E	G	V	K	A	R	V	V	S	M	P	S	T	D	A	F	D	K	Q	D	A	A	Y
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																.
Template Conservation																																	.	.	.																.
Template Sequence		R	H	P	L	A	V	S	S	L	E	E	L	A	N	G	T	F	L	P	A	I	G	E	I	D	E	L	D	P	K	G	.	.	.	V	K	R	V	V	M	C	S	G	K	V	Y	Y	D	L	.	L	E	Q	R	R	K	N	N	Q	H	D	V	A	I	V	R	I	E	Q	L	Y	P	F	P	H	K	A	M	Q	E
Template Known Secondary structure		G		T	T			B												S						S				G	G	G	.	.	.									T	T						.							T	T			S											S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.																.
Template SS confidence
		783	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.				.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.		.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.
		597	.	.	600				.	.	.	.	.	.		.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.							.
Query SS confidence						.	.	.							.
Query Sequence		R	E	S	V	.	.	.	L	P	K	A	V	T	.	A	R	V	A	V	E	A	G	I	A	D	Y	W	Y	K	Y	V	G	L
Query Conservation						.	.	.							.
Alig confidence						.	.	.							.
Template Conservation
Template Sequence		V	L	Q	Q	F	A	H	V	K	D	F	V	W	C	Q	E	E	P	L	N	Q	G	A	W	Y	C	S	Q	H	H	F	R	E
Template Known Secondary structure				G	G	G	T	T												T	T	S	T	T										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		859	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.