Job Description P75793 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:14:12 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 531 % Identity 22% Template d1qhma_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like Resolution 2.80

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		59	60	.	.	.	.	.	.	.		.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		H	L	A	N	R	T	I	W	I	.	K	H	D	E	L	I	I	G	N	Q	A	S	E	V	R	A	A	P	I	F	P	E	Y	T	V	S	W	I	E	K	E	I	D	D	L	A	D	R	P	G	A	G	F	A	V	S	E	E	N	K	R	V	L	H	E	V	C	P	W	W	R	G	Q	T	V	Q	D	R	C	Y
Query Conservation											.
Alig confidence											.																																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation																																																.					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Sequence		I	T	S	H	D	A	G	Y	I	N	K	Q	L	E	K	I	V	G	L	Q	T	E	A	P	L	K	R	A	L	I	P	F	G	G	I	K	M	I	E	G	S	C	K	A	Y	N	.	R	E	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	M	I	K	K	I	F	T	E	Y	R	.	K	T	H	N	Q	G	V	F
Template Known Secondary structure		S	S	S	S					S		T	T	T		S	S				S	S	S	S	T	T						G	G	G												T	T	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	S	.
Template Predicted Secondary structure																																																.					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template SS confidence
		1081	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	1130										.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.		.	.	.	.	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	M	F	T	D	E	Q	K	G	L	L	A	T	G	I	I	K	A	E	G	N	M	T	S	G	D	A	H	L	A	V	N	F	P	L	L	L	E	K	G	L	D	G	L	R	E	E	V	A	E	R	R	S	R	I	N	L	T	V	L	E	D	L	H	G	E	Q	F	L	K	A	I	D	I	V	L	V	A	V	S
Query Conservation
Alig confidence																							.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	Y	T	P	D	I	L	R	C	R	K	S	G	V	L	T	G	L	P	D	.	A	Y	G	R	G	R	I	I	G	D	Y	R	R	V	A	L	Y	G	I	D	Y	L	M	K	D	K	L	A	Q	F	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	A	D	L	E	N	G	V	N	L	E	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T	S							.	S	S									T																					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							T	T	T			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.										.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	I	E	R	F	A	A	L	A	R	E	M	A	A	T	E	T	R	E	S	R	R	D	E	L	L	A	M	A	E	N	C	D	L	I	A	H	Q	P	P	Q	T	F	W	Q	A	L	Q	L	C	Y	F	I	Q	L	I	L	Q	I	E	S	N	G	H	S	V	S	F	G	R	M	D	Q	Y	L	Y	P	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.													.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	Q	T	I	R	L	R	E	E	I	A	E	Q	.	.	.	H	R	A	L	G	Q	M	K	E	M	A	A	K	Y	G	Y	D	I	S	G	P	A	T	N	A	Q	E	A	I	Q	W	T	Y	F	G	Y	L	A	A	V	K	S	Q	N	G	A	A	M	S	F	G	R	T	S	T	F	L	D	V	Y	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.													.	.	.														T	T				S	S				S																						T	T				B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.													.	.	.
Template SS confidence
						1215	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.				.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	R	D	V	E	L	N	Q	T	L	D	R	E	H	A	I	E	M	L	H	S	C	W	L	K	L	L	E	V	N	K	I	R	S	G	S	H	S	K	A	S	A	G	S	P	L	Y	Q	N	V	T	I	G	G	Q	N	L	V	D	G	Q	P	M	D	A	V	N	P	L	S	Y	A	I	L	E	S	C	G	R	L
Query Conservation
Alig confidence										.																																																	.	.	.
Template Conservation										.																																																	.	.	.
Template Sequence		E	R	D	L	K	A	G	K	.	I	T	E	Q	E	A	Q	E	M	V	D	H	L	V	M	K	L	R	M	V	R	F	L	R	T	P	E	Y	D	E	L	F	S	G	D	P	I	W	A	T	E	S	I	G	G	M	G	L	.	.	.	D	G	R	T	L	V	T	K	N	S	F	R	F	L	N	T	L	Y	T	M
Template Known Secondary structure						T	T	T	S	.	S																									G	G	G	S	T	T	T	T													B		T	.	.	.	T	S		B																S
Template Predicted Secondary structure										.																																																	.	.	.
Template SS confidence
		1288	.	1290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.				.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.
			378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	R	S	T	Q	P	N	L	S	V	R	Y	H	A	G	M	S	N	D	F	L	D	A	C	V	Q	V	I	R	C	G	F	G	M	P	A	F	N	N	D	E	I	V	I	P	E	F	I	K	L	G	I	E	P	Q	D	A	Y	D	Y	A	A	I	G	C	I	E	T	A	V	G	G	K	W	G	Y	R	C	T	G
Query Conservation		.
Alig confidence		.																													.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	P	S	P	E	P	N	M	T	I	L	W	S	E	K	L	P	L	N	F	K	K	F	A	A	K	V	S	I	.	D	T	S	S	L	Q	Y	E	N	D	D	L	M	R	P	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	D	D	Y	A	I	A	C	C	V	S	P	M	I	V	G	K	Q	M	Q	F	F	G	A
Template Known Secondary structure					S	S	S								T	T	S														.																		.	.	.	.	.	.	.	.	T		S						T	T	S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure																															.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1364	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.									1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.		.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		M	S	F	I	N	F	A	R	V	M	L	A	A	L	E	G	G	H	D	A	T	S	G	K	V	F	L	P	Q	E	K	A	L	S	A	G	.	N	F	N	N	F	D	E	V	M	D	A	W	D	T	Q	I	R	Y	Y	T	R	K	S	I	E	I	E	Y	V	V	D	T	M	L	E	E	N	V	H	D	I	L	C
Query Conservation																																						.
Alig confidence		.	.																														.	.				.
Template Conservation		.	.																														.	.
Template Sequence		.	.	R	A	N	L	A	K	T	M	L	Y	A	I	N	G	G	V	D	E	K	L	K	M	Q	V	G	P	K	S	E	.	.	P	I	K	G	D	V	L	N	Y	D	E	V	M	E	R	M	D	H	F	M	D	W	L	A	K	Q	Y	I	T	A	L	N	I	I	H	Y	M	H	D	K	Y	S	Y	E	A	S	L
Template Known Secondary structure		.	.													T	T	T			T	T	T	T				S					.	.				S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																														.	.
Template SS confidence
				1435	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.			.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510
		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	L	V	D	D	C	I	E	R	A	K	S	I	K	Q	G	G	A	K	Y	D	W	V	S	G	L	Q	V	G	I	A	N	L	G	N	S	L	A	A	V	K	K	L	V	F	E	Q	G	A	I	G	Q	Q	Q	L	A	A	A	L	A	D	D	F	D	G	L	T	H	E	Q	L	R	Q	R	L	I	N	G	A
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.										.	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.										.	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	L	H	D	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	R	T	M	A	C	G	I	A	G	L	S	V	A	A	D	S	L	S	A	I	K	Y	A	K	V	K	P	I	R	D	E	.	.	.	.	.	D	G	L	A	I	D	F	E	I	.	.	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y
Template Known Secondary structure			T	T	S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											S														S								T	.	.	.	.	.	T	S								.	.		S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.										.	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1511	.	.	.	.	.	.													.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550						.	.	.	.	.	.	.	.	.			1560	.									.	.
		616	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	K	Y	G	N	D	D	D	T	V	D	T	L	L	A	R	A	Y	Q	T	Y	I	D	E	L	K	Q	Y	H	N	P	R	Y	G	R	G	P	V	G	G	N	Y	Y	A	G	T	S	S	I	S	A	N	V	P	F	G	A
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Q	F	G	N	N	D	P	R	V	D	D	L	A	V	D	L	V	E	R	F	M	K	K	I	Q	K	L	H	T	Y	R	.	.	.	.	.	.	D	A	I	P	T	Q	S	V	L	T	I	T	S	N	V	V	Y	G	K
Template Known Secondary structure				S	S	S	S																				T	T	S			G	G	.	.	.	.	.	.	G							S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1564	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.							.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.