Job Description P75793 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:14:12 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 780 % Identity 28% Template c2y8nC_ PDB info PDB header:lyase Chain: C: PDB Molecule:4-hydroxyphenylacetate decarboxylase large subunit; PDBTitle: crystal structure of glycyl radical enzyme Resolution 1.75 Å

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	R	I	K	A	H	K	N	A	L	V	H	I	V	K	P	P	V	C	T	E	R	A	Q	H	Y	T	E	M	Y	Q	Q	H	L	D	K	P	I	P	V	R	R	A	L	A	L	A	H	H	L	A	N	R	T	I	W	I	K	H	D	E	L	I	I	G	N	Q	A	S	E	V	R	A	A	P	I	F	P	E
Query Conservation
Alig confidence															.
Template Conservation															.
Template Sequence		K	E	S	T	Q	K	L	M	D	I	Y	Y	T	.	L	K	V	T	A	D	M	E	A	A	Y	W	Y	N	R	T	W	W	E	N	D	G	E	V	I	E	V	R	R	A	K	A	V	A	A	S	L	S	H	M	T	P	T	I	L	P	Y	E	K	L	V	M	N	K	T	K	N	V	R	G	A	F	P	F	P	W
Template Known Secondary structure													T	T	.							S													T	T	T	S																T	S						T	T		S	S				S	S	S	S	T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.		.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	V	S	W	I	E	K	E	I	D	D	L	A	D	R	P	G	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	V	S	E	E	N	K	R	V	L	H	E	V	C	P	W	W	R	G	Q	T	V	Q	D	R	C	Y	G
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	C	A	S	F	F	N	A	Q	A	E	A	L	M	N	E	V	D	A	P	A	E	N	E	A	D	S	V	S	V	V	G	A	G	G	G	N	V	T	E	S	Y	G	N	V	I	S	I	A	K	K	F	G	M	R	K	E	E	I	P	V	L	V	K	T	S	K	P	W	E	G	I	S	V	E	E	L	S	N	K
Template Known Secondary structure		T														T	T	S											T						S	T	T				S		B	T	T					T	T	T					G	G	G									G	G	G	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
		139	140					.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.					.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																																											.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																																																											.	.	.	.
Query Sequence		M	F	.	.	.	.	T	D	E	Q	K	G	L	L	A	T	G	I	I	K	A	E	G	N	M	T	S	G	D	A	H	L	A	V	N	F	P	L	L	L	E	K	G	L	D	G	L	R	E	E	V	A	E	R	R	S	R	I	N	L	T	V	L	E	.	.	.	.	D	L	H	G	E	Q	F	L	K	A	I	D
Query Conservation				.	.	.	.																																																											.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																																																											.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	K	M	T	P	G	Y	D	Q	F	K	N	I	M	E	S	V	I	C	M	F	D	S	F	A	I	P	Q	G	R	E	V	I	N	Y	Y	M	P	L	Q	Y	G	F	D	G	I	I	K	L	C	D	E	K	I	A	E	V	M	G	E	A	G	D	D	G	D	F	G	M	S	R	G	Y	Y	Y	A	A	M	K
Template Known Secondary structure				T	T	S	T	T										T	T	S	B				G	G	G	S	S																															T	T			T	T		T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	V	L	V	A	V	S	E	H	I	E	R	F	A	A	L	A	R	E	M	A	A	T	E	T	R	E	S	R	R	D	E	L	L	A	M	A	E	N	C	D	L	I	A	H	Q	P	P	Q	T	F	W	Q	A	L	Q	L	C	Y	F	I	Q	L	I	L	Q	I	E	S	N	G	H	S	V	S	F	G	R	M	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	I	T	K	G	L	S	A	W	C	E	N	Y	S	K	R	A	K	Y	L	A	S	I	E	T	D	S	E	I	K	A	N	Y	E	K	I	E	E	V	M	G	N	I	A	H	K	K	P	A	N	F	W	E	A	I	Q	M	T	L	C	C	H	F	G	V	V	N	E	D	P	Q	S	G	L	S	I	G	R	L	G
Template Known Secondary structure																																													T	T	S				S																	T	T	S								B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Y	L	Y	P	Y	Y	R	R	D	V	E	L	N	Q	T	L	D	R	E	H	A	I	E	M	L	H	S	C	W	L	K	L	L	E	V	N	K	I	R	S	G	S	H	S	K	A	S	A	G	S	P	L	Y	Q	N	V	T	I	G	G	Q	N	L	V	D	G	Q	P	M	D	A	V	N	P	L	S	Y	A	I
Query Conservation
Alig confidence																	.																																																	.	.	.
Template Conservation																	.																																																	.	.	.
Template Sequence		Q	V	L	Q	P	F	Y	E	K	D	V	E	D	G	I	.	M	T	D	E	E	V	I	E	L	L	E	L	Y	R	I	K	I	T	C	I	E	C	F	A	S	A	G	V	S	G	G	V	L	S	G	N	T	F	N	N	L	S	L	G	G	Q	N	Y	.	.	.	D	G	L	S	A	V	T	P	L	E	Y	L	I
Template Known Secondary structure				S										T	T	S	.																			T											T	T	T	S	T	T											B		T	.	.	.	T	S	S	B
Template Predicted Secondary structure																	.																																																	.	.	.
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.		.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.				.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.					.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.
Query Sequence		L	E	S	C	G	R	L	R	S	T	Q	P	N	L	S	V	R	Y	H	A	G	M	S	N	D	F	L	D	A	C	V	Q	V	I	R	C	G	F	G	M	P	A	F	N	N	D	E	I	V	I	P	E	F	I	K	.	.	.	.	L	G	I	E	P	Q	D	A	Y	D	Y	A	A	I	G	C	I	E	T	A	V
Query Conservation																																																									.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	A	G	M	R	N	Q	T	P	Q	P	T	L	S	V	L	Y	D	E	K	T	P	E	D	F	L	M	K	A	A	S	C	T	K	L	G	L	G	Y	P	A	W	M	N	N	Q	T	G	M	N	F	M	M	R	N	Y	G	P	E	G	M	D	L	H	D	A	R	A	W	C	L	G	G	C	L	E	S	A	P
Template Known Secondary structure								S			S		S								T	T	S													T	T	T	S			S																	G	G	G	T								T					T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		447	.	.	450																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	K	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	R	C	T	G	M	S	F	I	N	F	A	R	V	M	L	A	A	L	E	G	G	H	D	A	T	S	G	K	V	F	L	P	Q	E	K	A	L	S	A	G	N	F	N	N	F	D	E	V	M	D	A	W	D	T	Q	I	R	Y
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.
Template Sequence		G	C	F	L	P	L	E	Y	N	G	K	V	T	M	I	P	G	G	A	S	P	T	C	G	T	G	V	H	F	I	G	M	P	K	V	L	E	L	V	L	T	N	G	L	D	K	R	T	G	K	Q	V	Y	P	P	H	N	.	.	.	.	K	K	L	D	S	Y	E	T	M	V	N	Q	W	K	E	Y	M	E	L
Template Known Secondary structure										T	T										S	S		S	S																	T	T	T			T	T	T	T				S					.	.	.	.					S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.					.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		Y	T	R	K	S	I	E	I	E	Y	V	V	D	T	M	L	E	E	N	V	H	D	I	L	C	S	A	L	V	D	D	C	I	E	R	A	K	S	I	K	Q	G	G	A	K	Y	D	W	V	.	S	G	L	Q	V	G	I	A	N	L	G	N	S	L	A	A	V	K	K	L	V	F	E	Q	G	A	I	G	Q	Q
Query Conservation																																																			.
Alig confidence																																																			.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	D	V	V	N	R	C	N	N	I	Q	M	D	I	W	R	K	Y	N	M	P	A	V	N	S	L	L	K	P	D	C	F	K	K	G	K	H	I	G	T	M	G	A	R	Y	N	S	C	I	N	F	E	S	C	G	T	I	T	F	V	N	S	L	S	S	I	K	K	N	V	F	D	D	S	K	F	T	I	E
Template Known Secondary structure																					S			S						S	T	T					T			G	G	G	T		S	S			T	T																						T	T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	A	A	A	L	A	D	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	L	T	H	E	Q	L	R	Q	R	L	I	N	G	A	P	K	Y	G	N	D	D	D	T	V	D	T	L	L	A	R	A	Y	Q	T	Y	I	D	E	L	K	Q	Y	H	N	P	R
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.											.
Template Conservation																																				.	.											.
Template Sequence		E	M	T	D	A	M	L	N	N	F	G	F	K	T	A	Y	E	T	E	V	F	S	P	D	F	R	E	S	T	D	K	S	T	K	.	.	Y	E	K	I	F	A	A	C	V	N	.	A	P	K	Y	G	N	A	D	K	Y	A	D	E	I	F	K	A	Y	H	Y	Y	I	Y	D	M	T	H	K	F	R	S	Y	Y
Template Known Secondary structure									T	G	G	G	B										S	T	T				B		T	T				.	.											.	S			T	T	S																					T	T		B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.											.
Template SS confidence
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.			.	700	.	.	.	.	.	.	.	.		.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.
		648	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690		.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		Y	G	R	G	P	V	G	G	N	Y	Y	A	G	T	S	S	I	S	A	N	V	P	F	G	A	Q	T	M	A	T	P	D	G	R	K	A	H	T	P	L	A	E	G	.	A	S	P	A	S	G	T	D	H	L	G	P	T	A	V	I	G	S	V	G	K	L	P	T	A	A	I	L	G	G	V	L	L	N	Q	K
Query Conservation																																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																						.																															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																																																					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	K	P	L	Y	L	C	Q	I	S	V	S	T	H	G	P	Q	G	F	V	T	L	A	T	A	D	G	R	L	A	G	T	T	Y	S	D	G	S	V	S	A	A	A	G	T	D	K	N	G	I	Y	A	I	F	E	S	A	T	V	Y	D	H	S	M	H	Q	N	A	.	Q	M	N	L	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S		B								T	T	T								S				T	T	S			T	T					S	T	T	T	S			T	T				S										T	S	S		G	G	G	S	S			.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																																					.
Template SS confidence
								742	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.		810	.	.	.	.
		727	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	P	A	T	L	E	N	E	S	D	K	Q	K	L	M	I	L	L	R	T	F	F	E	V	H	K	G	W	H	I	Q	Y	N	I	V	S	R	E	T	L	L	D	A	K	K	H	P	D	Q	Y	R	D	L	V	V	R	V	A	G	Y	S	A	F	F	T	A	L	S	P	D	A	Q	D	D	I	I	A	R	T
Query Conservation
Alig confidence																											.
Template Conservation																											.
Template Sequence		L	H	P	T	A	V	K	G	I	N	G	T	R	K	L	L	D	L	V	R	A	Y	M	R	K	.	G	G	F	H	V	Q	F	N	V	V	D	S	K	T	L	R	D	A	Q	L	T	P	E	K	Y	R	E	L	M	V	R	V	A	G	F	T	Q	Y	W	C	E	I	G	K	P	I	Q	D	E	V	I	Y	R	T
Template Known Secondary structure				G	G	G	G																				.	T									S												G	G	G		T	T						S	S					G	G	G	S											S
Template Predicted Secondary structure																											.
Template SS confidence
		815	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.		840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.
		807	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	M
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	Y	D
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		894	.	.