Job Description P75793 Confidence 99.39% Date Thu Jan 5 12:14:12 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 441 % Identity 18% Template c1hk8A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:anaerobic ribonucleotide-triphosphate reductase; PDBTitle: structural basis for allosteric substrate specificity2 regulation in class iii ribonucleotide reductases:3 nrdd in complex with dgtp Resolution 2.45 Å

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		116	.	.	.	120	.		.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.					.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure								.																																													.	.	.	.
Query SS confidence								.																																													.	.	.	.
Query Sequence		N	K	R	V	L	H	.	E	V	C	P	W	W	R	G	Q	T	V	Q	D	R	C	Y	G	M	F	T	D	E	Q	K	G	L	L	A	T	G	I	I	K	A	E	G	N	M	T	S	G	D	A	H	.	.	.	.	L	A	V	N	F	P	L	L	L	E	K	G	L	D	G	L	R	E	E	V	A	E	R	R	S
Query Conservation								.																																													.	.	.	.
Alig confidence								.							.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	R	D	L	M	A	G	I	V	S	K	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	N	M	V	P	S	F	I	M	K	A	H	E	S	G	I	I	H	V	H	D	I	D	Y	S	P	A	L	P	F	T	N	C	C	L	V	D	L	K	G	M	L	E	N	G	F	K	L	G	N	A	Q	I	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.					S											T	S				T	T	T	T	T	T	T	T	S																S					T	T				.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.									.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	N	L	T	V	L	E	D	L	H	G	E	Q	F	L	K	A	I	D	I	V	L	V	A	V	S	E	H	I	E	R	F	A	A	L	A	R	E	M	A	A	T	E	T	R	E	S	R	R	D	E	L	L	A	M	A	E	N	C	D	L	I	A	H	Q	P	P	Q	T	F	W	Q	A	L	Q	L	C	Y	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	P	K	S	I	G	V	A	T	A	I	M	A	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																			100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Q	L	I	L	Q	I	E	S	N	G	H	S	V	S	F	G	R	M	D	Q	Y	L	Y	P	Y	Y	R	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	L	N	Q	T	L	D	R	E	H	A	I	E	M	L	H	S	C	W	L	K	L	L	E	V	N	K	I	R	S	G	S	H
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	A	Q	V	A	S	H	Q	Y	G	.	G	T	T	F	A	N	V	D	K	V	L	S	P	Y	V	K	R	T	Y	A	K	H	I	E	D	A	E	K	W	Q	I	A	D	A	L	N	Y	A	Q	S	K	T	E	K	D	V	Y	D	A	F	Q	A	Y	E	Y	E	V	N	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	S	S	S	.					T	T																							T	T		S	S																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.		.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.						.	.	.	380	.		.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.								.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.						.														.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.						.														.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	K	A	S	A	G	S	P	L	Y	Q	N	V	T	I	G	G	Q	N	L	V	D	G	Q	P	M	D	A	V	N	P	L	S	Y	A	I	L	E	S	C	G	R	.	.	.	.	.	L	R	S	T	Q	.	P	N	L	S	V	R	Y	H	A	G	M	S	N	.	.	.	.	.	.	.	D	F	L	D	A	C	V
Query Conservation																																												.	.	.	.	.						.														.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.						.														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	F	S	S	N	G	Q	T	P	F	V	T	I	T	F	G	T	.	.	.	.	.	.	G	T	D	W	T	E	R	M	I	Q	K	A	I	L	K	N	R	I	K	G	L	G	R	D	G	I	T	P	I	F	P	K	L	V	M	F	V	E	E	G	V	N	L	Y	K	D	D	P	N	Y	D	I	K	Q	L	A	L
Template Known Secondary structure		.			T	T	S	S											.	.	.	.	.	.			S																		B	T	T	T	T	B			S		S								T	T	T	T	S	S	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.							.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.						.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.				.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.													.	.	.																		.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.													.	.	.																		.	.	.
Query Sequence		Q	V	I	R	C	G	F	G	M	P	A	F	N	N	D	E	I	V	I	P	E	F	I	K	L	G	I	E	P	Q	D	A	Y	D	Y	A	A	I	G	C	.	.	.	.	.	I	E	T	A	V	G	G	K	W	G	Y	R	.	.	.	C	T	G	M	S	F	I	N	F	A	R	V	M	L	A	A	L	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.													.	.	.																		.	.	.
Alig confidence							.																						.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.													.	.	.																		.	.	.
Template Conservation							.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	C	A	S	K	.	R	M	Y	P	D	I	I	S	A	K	N	N	K	A	I	T	G	S	S	V	P	.	.	.	.	.	.	.	V	S	P	M	G	C	R	S	F	L	S	V	W	K	D	S	T	G	N	E	I	L	D	G	R	N	N	L	G	V	V	T	L	N	L	P	R	I	A	L	D	S	Y	I	G	T
Template Known Secondary structure							.																	T		S	S		.	.	.	.	.	.	.				B	T	T	T	B						B		T	T	S		B			T	T		B															T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure							.																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		259	260	.	.	.		.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.								.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	G	H	D	A	T	S	G	K	V	F	L	P	Q	E	K	A	L	S	A	G	N	F	N	N	F	D	E	V	M	D	A	W	D	T	Q	I	R	Y	Y	T	R	K	S	I	E	I	E	Y	V	V	D	T	M	L	E	E	N	V	H	D	I	L	C	S	A	L	V	D	D	C	I	E	R	A	K	S	I	K
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	Q	K	F	V	E	L	F	N	E	R	M	D	L	C	F	E	A	L	M	C	R	I	S	S	L	K	G	V	K	A	T	V	A	P	I	L	Y	Q	E	G	A	F	G	V	R	L	K	P	D	D	D	I	I
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											T	T	T		B	G	G	G						T	S	S	T	T	S	S				T	T	S	B	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.																								.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		551	.		.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		Q	G	.	G	A	K	Y	D	W	V	S	G	L	Q	V	G	I	A	N	L	G	N	S	L	A	A	V	K	K	L	V	F	E	Q	G	A	I	G	Q	Q	Q	L	A	A	A	L	A	D	D	F	D	G	L	T	H	E	Q	L	R	Q	R	L	I	N	G	A	P	K	Y	G	N	D	D	D	T	V	D	T	L	L
Query Conservation				.
Alig confidence				.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	F	K	N	G	R	S	S	V	S	L	G	Y	I	G	I	H	E	L	N	I	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	D	.	.	.	.	.	.	I	G
Template Known Secondary structure					T	T	T	T	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																																														.	.	.							.	.
		630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.										.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	A	Y	Q	T	Y	I	D	E	L	K	Q	Y	H	N	P	R	Y	G	R	G	P	V	G	G	N	Y	Y	A	G	T	S	S	I	S	A	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	G	A	Q	T	M	A	T	P	D	G	R	K	A	H	T	P	L	A	E	G	A	S	P	A	S	G	T	D	H	L
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		R	E	I	L	T	K	M	N	A	H	L	K	Q	W	T	E	R	T	.	.	.	.	.	.	G	F	A	F	S	L	Y	S	T	P	A	E	N	L	C	Y	R	F	C	K	L	D	T	E	K	Y	G	S	V	K	D	V	T	D	K	G	.	.	.	.	.	W	Y	T	N	S	F	H	V	S	V	E	E	N	I	T
Template Known Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	S											T	T																	T	T	T	T	T	T	S	.	.	.	.	.					T	T				T	T	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.							.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470						.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
		701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	T	A	V	I	G	S	V	G	K	L	P	T	A	A	I	L	G	G	V	L	L	N	Q	K	L	N	P	A	T	L	E	N	E	S	D	K	Q	K	L	M	I	L	L	R
Query Conservation
Alig confidence		.												.															.
Template Conservation		.												.															.
Template Sequence		.	P	F	E	K	I	S	R	E	A	P	Y	.	H	F	I	A	T	G	G	H	I	S	Y	V	E	L	.	P	D	M	K	N	N	L	K	G	L	E	A	V	W	D	Y	A	A
Template Known Secondary structure		.												.		T	T		T	T	B								.				T	T
Template Predicted Secondary structure		.												.															.
Template SS confidence
			486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510		.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.