Job Description P42632 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:02:00 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 697 % Identity 26% Template d1r9da_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like Resolution 1.80

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		51	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.											.	.	.	.	.		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.				.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.															.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.															.	.	.
Query Sequence		A	T	P	A	T	T	E	L	W	E	K	V	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	R	I	E	.	N	A	T	H	A	P	V	D	F	D	T	N	I	A	.	.	.	T	T	I	T	A	H	D	A	G	Y	I	N	Q	P	L	E	K	I	V	G	L	Q	T	D	A	P	L	K	R	A	L	H	P
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.															.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.															.	.	.												.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		Q	T	E	R	I	N	I	L	K	A	Q	I	L	N	A	K	P	C	V	E	S	E	R	A	I	L	I	T	E	S	F	K	Q	T	E	G	Q	P	A	I	L	R	R	A	L	A	L	K	H	I	L	E	N	I	P	I	T	I	.	R	D	Q	E	L	I	V	G	S	L	T	K	E	P	R	S	S	Q	V	F	P
Template Known Secondary structure																			B	B														T		T	T	S																	S					.		T	T		S	S				S	S	S	S	T	T	B	B				T
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.										.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																										.
Query SS confidence																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																										.
Query Sequence		F	G	G	I	N	M	I	K	S	S	F	H	A	Y	G	.	R	E	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	F	E	Y	L	F	T	D	L	R	.	K	T	H	N	Q	G	V	F	D	V	Y	S	P	D	M	L	R	C	R	K	S	G	V	L	T	.	G	L	P	D	G	Y	G	R	G	R	I	I	G
Query Conservation																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																										.
Alig confidence																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																										.
Template Conservation
Template Sequence		E	F	S	N	K	W	L	Q	D	E	L	D	R	L	N	K	R	T	G	D	A	F	Q	I	S	E	E	S	K	E	K	L	K	D	V	F	E	Y	W	N	G	K	T	T	S	E	L	A	T	S	Y	M	T	E	E	T	R	E	A	V	N	C	D	V	F	T	V	G	N	Y	Y	Y	N	G	V	G	H	V	S	V
Template Known Secondary structure		T	T									T	T	T	G	G	G		S	S	S			B																T	T	T		S									S									T	S	S	S									S					B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.								210	.	.	.	.	.	.												.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.				.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Query Sequence		D	Y	R	R	V	A	L	Y	G	I	S	Y	L	V	R	E	R	E	L	Q	F	A	D	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	S	R	L	E	K	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	E	A	T	I	R	L	R	E	E	L	A	E	H	R	.	.	.	H	A	L	L	Q	I	Q	E	M	A	A
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	G	K	V	L	R	V	G	F	N	G	I	I	N	E	A	K	E	Q	L	E	K	N	R	S	I	D	P	D	F	I	K	K	E	K	F	L	N	S	V	I	I	S	C	E	A	A	I	T	Y	V	N	R	Y	A	K	K	A	K	E	I	A	D	N	T	S	D	A	K	R	K	A	E	L	N	E	I	A	K
Template Known Secondary structure																									T			S		T																																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Y	G	F	D	I	S	R	P	A	Q	N	A	Q	E	A	V	Q	W	L	Y	F	A	Y	L	A	A	V	K	S	Q	N	G	G	A	M	S	L	G	R	T	A	S	F	L	D	I	Y	I	E	R	D	F	K	A	G	V	L	N	E	Q	Q	A	Q	E	L	I	D	H	F	I	M	K	I	R	M	V	R	F	L
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.
Template Sequence		I	C	S	K	V	S	G	E	G	A	K	S	F	Y	E	A	C	Q	L	F	W	F	I	H	A	I	I	N	I	E	S	N	G	H	S	I	S	P	A	R	F	D	Q	Y	M	Y	P	Y	Y	E	N	D	.	.	.	K	N	I	T	D	K	F	A	Q	E	L	I	D	C	I	W	I	K	L	N	D	I	N	K	V
Template Known Secondary structure							T	T	S				S																						S		B			B	S													.	.	.	S	S																	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.				300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.		.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.
Query SS confidence																																																																												.
Query Sequence		R	T	P	E	F	D	S	L	F	S	G	D	P	I	W	A	T	E	V	I	G	G	M	G	L	D	G	R	T	L	V	T	K	N	S	F	R	Y	L	H	T	L	H	T	M	G	P	A	P	E	P	N	L	T	I	L	W	S	E	E	L	P	I	A	F	K	K	Y	A	A	Q	V	S	I	.	V	T	S	S	L
Query Conservation																																																																												.
Alig confidence																																															.																													.
Template Conservation																																															.
Template Sequence		R	D	E	I	S	T	K	H	F	G	G	Y	P	M	Y	Q	N	L	I	V	G	G	Q	N	S	E	G	K	D	A	T	N	K	V	S	Y	M	A	L	E	A	A	V	H	V	.	K	L	P	Q	P	S	L	S	V	R	I	W	N	K	T	P	D	E	F	L	L	R	A	A	E	L	T	R	E	G	L	G	L	P
Template Known Secondary structure				T	T					S		S	S											B		T	T	S		B																	.			S		S								T	T															T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																															.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.									.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.		.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query Sequence		Q	Y	E	N	D	D	L	M	R	T	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	D	D	Y	A	I	A	C	C	V	S	P	M	V	I	G	K	Q	M	Q	F	F	G	.	A	R	A	N	L	A	K	T	L	L	Y	A	I	N	G	G	V	D	E	K	L	K	I	Q	V	G	P	K	T	A	P	L	M	D	D
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.																									.																				.	.														.
Template Conservation																																																																		.	.														.
Template Sequence		A	Y	Y	N	D	E	V	I	I	P	A	L	V	S	R	G	L	T	L	E	D	A	R	D	Y	G	I	I	G	C	V	E	P	Q	K	P	G	K	T	E	G	W	H	D	S	A	F	F	N	L	A	R	I	V	E	L	T	I	N	S	G	F	D	K	.	.	N	K	Q	I	G	P	K	T	Q	N	F	E	E	.
Template Known Secondary structure																T	T								T					T	T	T					T	T	S					T	T	S														T	T	T	B		S	.	.	S	S	B		S						G	G	G	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.														.
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.			.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.													.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	D	Y	D	K	V	M	D	S	L	D	H	F	M	D	W	L	A	V	Q	Y	I	S	A	L	N	I	I	H	Y	M	H	D	K	Y	S	Y	E	A	S	L	M	A	L	H	D	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Y	R	T	M	A	C	G	I	A	G	L	S	V	A	T	D	S	L
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	K	S	F	D	E	F	M	K	A	Y	K	A	Q	M	E	Y	F	V	K	H	M	C	C	A	D	N	C	I	D	I	A	H	A	E	R	A	P	L	P	F	L	S	S	M	V	D	N	C	I	G	K	G	K	S	L	Q	D	G	G	A	E	Y	N	F	S	G	P	Q	G	V	G	V	A	N	I	G	D	S	L
Template Known Secondary structure				S																																										T	S	T	T					T			T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.						.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.								.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	I	K	Y	A	R	V	K	P	I	.	.	.	.	.	R	D	E	N	G	L	A	V	D	F	E	I	D	G	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	P	Q	Y	G	N	N	D	E	R	V	D	S	I	A	C	D	L	V	E	R	F	M	K	K	I	K	A	L	P	T	Y	R	N	A	V	P	T	Q	S	I	L
Query Conservation													.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	V	K	K	I	V	F	D	E	N	K	I	T	P	S	E	L	K	K	T	L	N	N	D	F	K	N	S	E	E	I	Q	A	L	L	K	N	A	P	K	F	G	N	D	I	D	E	V	D	N	L	A	R	E	G	A	L	V	Y	C	R	E	V	N	K	Y	T	N	P	R	G	G	N	F	Q	P	G	L	Y
Template Known Secondary structure								T	T	T	S		S	S											T	T	T	T	T										T	S			T	T	S																					T	T		B		T	T	S						B	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
		610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	T	S	N	V	V	Y	G	Q	K	T	G	N	T	P	D	G	R	R	A	G	T	P	F	A	P	G	A	N	P	M	H	G	R	D	R	K	G	A	V	A	S	L	T	S	V	A	K	L	P	F	T	Y	A	K	D	G	I	S	Y	T	F	S	I	V	P	A	A	L	G	K	E	D	P	V	R	K	T	N
Query Conservation
Alig confidence																																																																								.	.
Template Conservation																																																																								.	.
Template Sequence		P	S	S	I	N	V	Y	F	G	S	L	T	G	A	T	P	D	G	R	K	S	G	Q	P	L	A	D	G	V	S	P	S	R	G	C	D	V	S	G	P	T	A	A	C	N	S	V	S	K	L	D	H	F	I	A	S	N	G	T	L	F	N	Q	K	F	H	P	S	A	L	.	.	K	G	D	N	G	L	M	N
Template Known Secondary structure			T	T								T					T	T	S			T	T						T	T	S			T	T	T			S										T	T	S		T	T	T		T	T		B								G	G	G	G	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Template SS confidence
		641	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710			.	.	.	.	.	.	.	.
		690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	G	L	L	D	G	Y	F	H	H	E	A	D	V	E	G	G	Q	H	L	N	V	N	V	M	N	R	E	M	L	L	D	A	I	E	H	P	E	K	Y	P	N	L	T	I	R	V	S	G	Y	A	V	R	F	N	A	L	T	R	E	Q	Q	Q	D	V	I	S	R	T	F	T	Q
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	S	L	I	R	S	Y	F	D	.	.	.	.	.	Q	K	G	F	H	V	Q	F	N	V	I	D	K	K	I	L	L	A	A	Q	K	N	P	E	K	Y	Q	D	L	I	V	R	V	A	G	Y	S	A	Q	F	I	S	L	D	K	S	I	Q	N	D	I	I	A	R	T	E	H	V
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	T	T																					G	G	G	G	T	T						S	S	S				G	G	G	S											S			B
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		719	720	.	.	.	.	.	.	.	.						.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.