Job Description P15288 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:45 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 342 % Identity 18% Template c3ramC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:hmra protein; PDBTitle: crystal structure of hmra Resolution 2.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.				.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.
Query Sequence		S	P	Q	P	L	W	D	I	F	A	K	I	C	S	I	P	H	P	S	Y	H	E	E	Q	L	A	E	Y	I	V	G	W	A	K	E	K	G	F	H	V	E	R	D	Q	V	G	.	.	.	N	I	L	I	R	K	P	A	T	A	G	M	E	N	R	K	P	V	V	L	Q	A	H	L	D	M	V	P	Q	K	N
Query Conservation																																																.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.										.	.	.																	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.																	.	.	.
Template Sequence		N	K	Y	S	Y	I	E	I	S	H	R	I	H	E	R	P	E	L	G	N	E	E	I	F	A	S	R	T	L	I	D	R	L	K	E	H	D	F	E	I	E	T	E	I	A	G	H	A	T	G	F	I	A	T	Y	D	S	G	.	.	.	L	D	G	P	A	I	G	F	L	A	E	Y	D	A	L	P	.	.	.
Template Known Secondary structure		T														S			B	T	T															T	T	T								T	T												S	.	.	.	S	S	S											B		T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.				.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.			150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		N	D	T	V	H	D	F	T	K	D	P	I	Q	P	Y	I	D	G	E	W	V	K	A	R	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	M	A	S	A	L	A	V	L	A	D	E	N	V	V	H	G	P	L	E	V	L	L	T	M	T	E	E	A	G	M	.	.	D	G	A	F	G	L	Q	G	N	W	L	Q	A
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.																																						.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	G	H	A	C	G	H	.	.	N	I	I	G	T	A	S	V	L	G	A	I	G	L	K	Q	V	I	D	Q	I	G	G	K	V	V	V	L	G	C	P	A	E	E	G	G	E	N	G	S	A	K	A	S	Y	V	K	A	G	V	I	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	S	S			.	.																							S										T	T			T	T											T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
																				88	.	90	.	.	.	.	.			.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	L	I	N	T	D	S	E	E	E	G	E	I	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	F	T	S	N	L	H	L	D	R	E	A	V	P	A	G	F	E	T	F	K	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	G	E	I	H	V	G	L	G	N	A	N	K	L	L	V	R	F	L	A	G	H	A	E	E	L
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.														.															.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.														.															.	.	.
Template Sequence		Q	I	D	I	A	L	X	I	H	P	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	Y	K	T	I	D	T	L	A	V	D	V	L	D	V	K	F	Y	G	.	K	S	A	H	A	S	E	N	A	D	E	A	L	.	N	A	L	D	A	X	I	S	Y	F	N	G	V	A	.	.	.
Template Known Secondary structure		G		S									S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B	B					B													.	B			B	T	T	T		G	G	G		B	.															.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.														.															.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	R	L	I	D	F	N	G	G	T	L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	A	T	I	A	V	A	A	D	K	V	D	V	L	K	S	L	V	N	T	Y	Q	E	I	L	K	N	E	L	A	E	K	E	K	N	L	A	L	L	L	D	S	V	A	N	D	K	A	A	L	I	A	K	S	R	D	T	F	I	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	R	Q	H	I	K	K	D	Q	R	V	H	G	V	I	L	D	G	G	K	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S	S		T	T												S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.					.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	N	A	T	P	N	G	V	I	R	N	S	D	V	A	K	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	V	T	M	T	D	N	N	V	E	I	H	C	L	I	R	S	L	I	D	S	G	K	D	Y	V	V	S	M	L	D	S	L	G	K	L	.	.	.	.	A	G	A	K	T	E	A	K	G	A	Y	P	G
Query Conservation																																																																	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	I	P	D	Y	T	H	A	R	F	Y	T	R	A	X	T	R	K	E	L	D	I	L	T	E	K	V	N	Q	I	A	R	G	A	A	I	Q	T	G	C	D	Y	E	F	G	P	I	Q	N	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	B			S											S	S																							T								S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																															230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		399		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.		.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.							460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure			.																																														.																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.																																														.																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	.	Q	P	D	A	N	S	P	V	M	H	L	V	R	E	T	Y	Q	R	L	F	N	K	T	P	N	I	Q	I	I	H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	K	P	Y	P	E	M	.	D	M	V	S	I	G	P	T	I	T	G	P	H	S	P	.	.	.	.	.	.	D	E	Q	V	H	I	E	S	V	G	H
Query Conservation			.																																														.																.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																																														.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	E	F	I	K	T	P	K	L	D	D	L	F	A	K	Y	A	E	E	V	G	E	A	V	I	D	D	D	F	G	Y	G	S	T	D	T	G	N	V	S	H	V	V	P	T	I	H	P	H	I	K	I	G	S	R	N	L	V	G	H	T	H	R	F	R	E	A	A	A	S	V	H	G	D	E	A	L	I	K
Template Known Secondary structure		B																				T	T			B			S					B			T					T	T	T	S		B								S		T	T			T	T	S								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	T	L	L	T	E	L	L	K	E	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	A	K	I	X	A	L	X	G	L	E	L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.