Job Description P15288 Confidence 99.17% Date Thu Jan 5 11:34:45 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 272 % Identity 21% Template c3l6sA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:aspartyl aminopeptidase; PDBTitle: crystal structure of human aspartyl aminopeptidase (dnpep),2 in complex with aspartic acid hydroxamate Resolution 2.20 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	Q	P	L	W	D	I	F	A	K	I	C	S	I	P	H	P	S	Y	H	E	E	Q	L	A	E	Y	I	V	G	W	A	K	E	K	G	F	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	R	D	Q	V	G	N	I	L	I	R	K	P	A	T	A	G	M	E	N	R	K	P	V	V
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	A	V	Q	T	A	A	K	E	L	L	K	F	V	N	R	S	P	S	P	F	H	A	V	A	E	C	R	N	R	L	L	Q	A	G	F	S	E	L	K	E	T	E	K	W	N	I	K	P	E	S	K	Y	F	M	T	R	N	S	S	T	I	I	A	F	A	V	G	G	Q	Y	V	P	G	N	G	F	S	L
Template Known Secondary structure																		T		S	S															T	T						T	T	S						T	T								T	T	T									T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
		73	.	.	.	.	.	.																					80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Q	A	H	L	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	Q	K	N	N	D	T	V	H	D	F	T	K	D	P	I	Q	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	A	H	T	D	S	P	C	L	R	V	K	R	R	S	R	R	S	Q	V	G	F	Q	Q	V	G	V	E	T	Y	G	G	G	I	W	S	T	W	F	D	R	D	L	T	L	A	G	R	V	I	V	K	C	P	T	S	G	R	L	E	Q	Q	L	V	H	V	E	R	P	I	L	R	I	P	H	L	A	I	H
Template Known Secondary structure																						T	T										S	S			G	G	G	G	T	T														T	T	T												S			B	B						G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
																																																																										100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	G	E	W	V	K	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Q	R	N	I	N	E	N	F	G	P	N	T	E	M	H	L	V	P	I	L	A	T	A	I	Q	E	E	L	E	K	G	T	E	R	H	H	S	V	L	M	S	L	L	C	A	H	L	G	L	S	P	K	D	I	V	E	M	E	L	C	L	A	D	T	Q	P	A	V	L	G	G	A	Y	D	E	F	I	F	A
Template Known Secondary structure		G	S	T	T	T	T	T						T	T	T	T															T					S													T			G	G	G												S						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130								.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	M	A	S	A	L	A	V	L	A	D	E	.	.	.	.	.	.	.	N	V	V	H	G	P	L	E	V	L	L	T	M	T	E	E	A	G	M	D	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	L	Q	G	N	W
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.
Template Sequence		P	R	L	.	.	.	.	D	N	L	H	S	C	F	C	A	L	Q	A	L	I	D	S	C	A	G	P	G	S	L	A	T	E	P	H	V	R	M	V	T	L	Y	D	N	E	E	V	G	S	E	S	A	Q	G	A	Q	S	L	L	T	E	L	V	L	R	R	I	S	A	S	C	Q	H	P	T	A	F	E	E	A
Template Known Secondary structure		T	T		.	.	.	.																	T		S	T	T	T	T	T	T			S								S		G	G	G	T			S	T	T	S	T	T	S	T													S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.					.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	A	D	I	L	I	N	T	D	S	E	E	E	G	E	I	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	F	T	S	N	L	H	L	D	R	E	A	V	P	A	G	F	E	T	F	K	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	G	E	I	H	V	G	L	G	N	A	N	K	L	L	V	R	F	L	A	G	H	A
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	K	S	F	M	I	S	A	D	M	A	H	A	V	H	P	N	Y	L	D	K	H	E	E	N	H	R	P	L	F	H	K	G	P	V	I	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G														T	T	S	G	G	G	S		T	T					T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	L	D	L	R	L	I	D	F	N	G	G	T	L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	A	T	I	A	V	A	A	D	K	V	D	V	L	K	S	L	V	N	T	Y	Q	E	I	L	K	N	E	L	A	E	K	E	K	N	L	A	L	L	L	D	S	V	A	N	D	K	A	A	L	I	A	K	S	R	D	T
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	I	R	L	L	N	A	T	P	N	G	V	I	R	N	S	D	V	A	K	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	V	T	M	T	D	N	N	V	E	I	H	C	L	I	R	S	L	I	D	S	G	K	D	Y	V	V	S	M	L	D	S	L	G	K	L	A	G	A	K	T	E	A	K	G	A	Y	P	G	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	K	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																														386	.	.	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.					.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.
Query Sequence		Q	P	D	A	N	S	P	V	M	H	L	V	R	E	T	Y	Q	R	L	F	N	K	T	P	N	I	Q	I	.	.	.	.	I	H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	K	P	Y	P	E	M	D	M	V	S	I	G	P	T	I	T	G	P	H	S	P	D	E	Q	V	H	I	E	S	V	G	H	Y	W	T	L	L
Query Conservation																														.	.	.	.
Alig confidence																					.									.	.	.	.
Template Conservation																					.
Template Sequence		R	Y	A	S	N	A	V	S	E	A	L	I	R	E	V	A	N	K	V	.	K	V	P	L	Q	D	L	M	V	R	N	D	T	P	C	G	T	T	I	G	P	I	L	A	S	R	L	G	L	R	V	L	D	L	G	S	P	Q	L	A	M	H	S	I	R	E	M	A	C	T	T	G	V	L	Q	T	L	T	L	F
Template Known Secondary structure		T	S																		.	T										T	T	S															T												S	T	T	S	S	S					S
Template Predicted Secondary structure																					.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.		.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
		476	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	E	L	L	K	E	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	G	F	F	E	L	F
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.