Job Description P15288 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:45 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 326 % Identity 14% Template c3kl9F_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: F: PDB Molecule:glutamyl aminopeptidase; PDBTitle: crystal structure of pepa from streptococcus pneumoniae Resolution 2.70 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	W	D	I	F	A	K	I	C	S	I	P	H	P	S	Y	H	E	E	Q	L	A	E	Y	I	V	G	W	A	K	E	K	G	F	H	V	E	R	D	Q	V	G	N	I	L	I	R	K	P	A	T	A	G	M	E	N	R	K	P	V	V	L	Q	A	H	L	D	M	V	P	Q	K	N	N	D	T	V	H	D	F
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.																											.
Template Conservation																																																					.	.																											.
Template Sequence		L	F	S	K	I	K	E	V	T	E	L	A	A	V	S	G	H	E	A	P	V	R	A	Y	L	R	E	K	L	T	P	H	V	D	E	V	V	T	D	G	L	G	G	I	F	G	I	K	H	S	E	.	.	A	V	D	A	P	R	V	L	V	A	S	H	M	D	E	V	G	F	M	V	S	E	I	K	P	D	.
Template Known Secondary structure											T	S			B	T	T														G	G	G		S						T	T	S										.	.	S	T	T												B										T	T	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.																											.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.			.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	K	D	P	I	Q	P	Y	I	D	G	E	W	V	K	A	R	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	M	A	S	A	L	A	V	L	A	D	E	N	V	V	H	G	P	L	E	V	L	L	T	M	T	E	E	A	G	M	D	G	A	F	G	L	Q	G	N	W	L	Q	A	D	I	L	I	N	T	D	S	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	F	R	V	V	E	I	G	G	W	N	P	M	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	S	Q	R	F	K	L	L	T	R	D	G	H	E	I	P	V	I	S	G	P	A	I	A	D	I	V	F	D	G	G	F	A	D	K	A	E	A	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S								S				G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S								T	T	S											G	G	G	S							S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	G	E	I	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	F	T	S	N	L	H	L	D	R	E	A	V	P	A	G	F	E	T	F	K	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	G	E	I	H	V	G	L	G	N	A	N	K	L	L	V	R	F	L	A	G	H	A	E	E	L	D	L	R	L	I	D	F	N	G
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.														.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.														.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	P	G	D	T	I	V	P	D	S	S	A	I	L	T	A	.	N	E	K	N	I	I	S	K	A	W	D	N	R	.	Y	G	V	L	M	V	S	E	L	A	E	A	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T													T	.	T	S	S					S						.													T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.														.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		151	.	.																				.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170		.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.		.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	A	T	I	A	V	A	A	D	K	V	D	V	L	K	S	L	V	N	T	Y	Q	E	I	L	K	N	E	L	A	E	K	E	K	N	L	A	L	L	L	D	S	V	A	N	D	K	A	A	L	I	A	K	S	R	D	T	F	I	R	L	L	N	A	T	P	N	G	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	Q	K	L	G	N	E	L	Y	L	G	S	N	V	Q	E	E	V	G	L	R	G	A	H	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S				S	S								S			T	T	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	R	N	S	D	V	A	K	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	V	T	M	T	D	N	N	V	E	I	H	C	L	I	R	S	L	I	D	S	G	K	D	Y	V	V	S	M	L	D	S	L	G	K	L	A	G	A	K	T	E	A	K	G	A	Y	P	G	W	Q	P	D	A	N	S	P	V	M	H	L	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	D	P	E	V	F	L	A	V	D	C	S	P	A	G	D	V	Y	G	G	Q	G	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	G	T	L	I	R	F	Y	D	P	G	H	L	L	.	.	.	.	L	P	G	M	K	D	F	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S												G	G	G	T		S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S									T	T				.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
																						226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250									.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.					.	.	.	.	270	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	T	Y	Q	R	L	F	N	K	T	P	N	I	Q	I	I	H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	K	P	Y	P	E	M	D	M	V	S	I	G	P	T	I	T	G	P	H	S	P	D	E	Q	V	H	I	E	S	V	G	H	Y	W	T	L	L	T	E	L	L	K	E	I	P
Query Conservation
Alig confidence									.
Template Conservation									.
Template Sequence		L	T	T	A	E	E	A	.	G	I	K	Y	Q	Y	Y	C	G	K	G	G	T	D	A	G	A	A	H	L	K	N	G	G	V	P	S	T	T	I	G	V	C	A	R	Y	I	H	S	H	Q	T	L	Y	A	M	D	D	F	L	E	A	Q	A	F	L	Q	A	L	V	K	K	L	D
Template Known Secondary structure								T	.	T									S	S			T					T	T	S	T	T												B	T		S	S	S																								S
Template Predicted Secondary structure									.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.