Job Description P15288 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:45 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 387 % Identity 19% Template c3khzA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative dipeptidase sacol1801; PDBTitle: crystal structure of r350a mutant of staphylococcus aureus2 metallopeptidase (sapep/dape) in the apo-form Resolution 2.50 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.													30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	S	P	Q	P	L	W	D	I	F	A	K	I	C	S	I	P	H	P	S	Y	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	A	E	Y	I	V	G	W	A	K	E	K	G	F	H	V	E	R	D	Q	V	G	N	I	L	I	R	K	P	A	T	A	G	M	E	N	R	K	P	V	V	L
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.											.	.	.
Template Conservation																																																											.	.											.	.	.
Template Sequence		Q	Q	Y	E	D	Q	I	I	N	D	L	K	G	L	L	A	I	E	S	V	R	D	D	A	K	A	S	E	D	A	P	V	G	P	G	P	R	K	A	L	D	Y	M	Y	E	I	A	H	R	D	G	F	T	T	H	D	V	.	.	D	H	I	A	G	R	I	E	A	G	.	.	.	K	G	N	D	V	L	G	I
Template Known Secondary structure			T	T													T	S			B			T	T	S			S	S	S	T	T																		T	T							.	.	T	T	T								.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.											.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.			.	.	.	.	.	.	70	.	.	.				.	.	.	.	.	.	80	.
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.
Query SS confidence																																																													.
Query Sequence		Q	A	H	L	D	M	V	P	Q	K	N	N	D	T	V	H	D	F	T	K	D	P	I	Q	P	Y	I	D	G	E	W	V	K	A	R	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	M	A	S	A	L	A	V	L	A	D	E	N	V	.	V	H	G	P	L	E	V	L	L	T	M	T	E	E	A	G	M	D	G	A
Query Conservation																																																													.
Alig confidence														.	.	.	.	.																																											.
Template Conservation														.	.	.	.	.
Template Sequence		L	C	H	V	D	V	V	P	A	G	D	G	.	.	.	.	.	W	D	S	N	P	F	E	P	V	V	T	E	D	A	I	I	A	R	G	T	L	D	D	K	G	P	T	I	A	A	Y	Y	A	I	K	I	L	E	D	M	N	V	D	W	K	K	R	I	H	M	I	I	G	T	D	E	E	S	D	W	K	C	T
Template Known Secondary structure							B					T	T	.	.	.	.	.		S	S		T	T	S					S	S				S	T	T	S	T	T	T																	T	T				S	S										T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.						.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	G	L	Q	G	N	W	L	Q	A	D	I	L	I	N	T	D	S	E	E	E	G	E	I	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	F	T	S	N	L	H	L	D	R	E	A	V	P	A	G	F	E	T	F	K	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	G	E	I	H	V	G	L	G	N	A	N	K	L	L	V
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	Y	F	K	T	E	E	M	P	T	L	G	F	A	P	D	A	E	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	I	H	G	E	K	G	I	T	T	F	D	L	V	Q	N	K	L	T	E	D	Q	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S						S				S					T	T		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				B																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.				.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.
Query Sequence		R	F	L	A	G	H	A	E	E	L	D	L	R	L	I	D	F	N	G	G	T	L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	A	T	I	A	V	A	A	D	K	V	D	V	L	K	S	L	V	N	T	Y	Q	E	I	L	K	N	E	L	A	E	K	E	K	.	.	.	N	L	A	L	L	L	D	S	V	A	N	D	K
Query Conservation																																																																		.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	Y	E	L	I	T	F	K	S	G	E	R	Y	N	M	V	P	D	H	A	E	A	R	V	L	V	K	E	N	M	T	D	V	I	Q	D	F	E	Y	F	L	E	Q	N	H	L	Q	G	D	S	T	V	D	S	G	I	L	V	L	T	V	E	G	K	A	V	H	G	M	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.		S											S	S	S	B												S	S		S														T	T									T	T									B			B	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query Sequence		A	A	L	I	A	K	S	R	D	T	F	I	R	L	L	N	A	T	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	I	R	N	S	D	V	A	K	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	V	.	T	M	T	D	N	N	V	E	I	H	C	L	I	R	S	L
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		P	S	I	G	V	N	A	G	L	Y	L	L	K	F	L	A	S	L	N	L	D	N	N	A	Q	A	F	V	A	F	S	N	R	Y	L	F	N	S	D	F	G	E	K	M	G	M	K	F	H	T	D	V	M	G	D	V	T	T	N	I	G	V	I	T	Y	D	N	E	N	A	G	L	F	G	I	N	L	A	Y	P
Template Known Secondary structure			T	T	S	B											T	T	S		B															T	T	T		T	T	S	G	G	G	T						T	T	T														T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	S	G	K	D	Y	V	V	S	M	L	D	S	L	G	K	L	A	G	A	K	T	E	A	K	G	A	Y	P	G	W	Q	P	D	A	N	S	P	V	M	H	L	V	R	E	T	Y	Q	R	L	F	N	K	T	P	N	I	Q	I	I	H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	K	P	Y	P	E	M	D	M	V
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	F	E	F	E	K	A	M	D	R	F	A	N	E	I	Q	Q	Y	G	F	E	V	K	L	G	K	V	Q	P	P	H	Y	V	D	K	N	D	P	F	V	Q	K	L	V	T	A	Y	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T														T	G	G	G	T												B			G	G	G														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	I	G	P	T	I	T	G	P	H	S	P	D	E	Q	V	H	I	E	S	V	G	H	Y	W	T	L	L	T	E	L	L	K	E	I	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	Q	T	H	Q	K	N	E	Y	I	T	K	K	Q	L	F	N	A	T	S	I	Y	L	E	A	I	Y	S	L	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.