Job Description P15288 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:45 GMT 2012 Rank 39 Aligned Residues 329 % Identity 18% Template c2cf4A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:protein ph0519; PDBTitle: pyrococcus horikoshii tet1 peptidase can assemble into a2 tetrahedron or a large octahedral shell Resolution 3.08 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	W	D	I	F	A	K	I	C	S	I	P	H	P	S	Y	H	E	E	Q	L	A	E	Y	I	V	G	W	A	K	E	K	G	F	H	V	E	R	D	Q	V	G	N	I	L	I	R	K	P	A	T	A	G	M	E	N	R	K	P	V	V	L	Q	A	H	L	D	M	V	P	Q	K	N	N	D	T	V	H	D	F
Query Conservation
Alig confidence																																			.																		.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation																																			.																		.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Sequence		X	I	E	K	L	K	K	F	T	Q	I	P	G	I	S	G	Y	E	E	R	I	R	E	E	I	I	R	E	I	K	D	F	A	.	D	Y	K	V	D	A	I	G	N	L	I	V	E	L	G	E	G	.	.	.	.	.	E	E	R	I	L	F	X	A	H	X	D	E	I	G	L	L	I	T	G	.	.	.	.	I
Template Known Secondary structure												S				T	T												T	T	T	T	S	S	.						S	S	S							S		S	.	.	.	.	.	S																			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.																		.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.		.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.						.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.					.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	K	D	P	I	Q	P	Y	I	D	G	E	W	V	K	A	R	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	M	A	S	A	L	A	V	L	A	D	E	N	V	V	H	G	P	L	E	V	L	L	T	M	T	E	E	A	G	M	D	G	A	F	G	L	Q	G	N	W	L	Q	A	D	I	L	I	N	T	D	S	E
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.									.	.	.													.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.									.	.	.													.	.
Template Sequence		T	D	E	G	K	L	.	.	.	.	.	.	R	F	R	K	V	G	G	I	.	.	.	D	D	R	L	L	Y	G	R	H	V	N	V	.	.	V	T	E	K	G	I	L	D	G	V	I	G	A	T	P	P	H	L	S	L	E	R	D	K	S	V	I	P	W	Y	D	L	V	I	D	I	G	A	E	S	K	E	E
Template Known Secondary structure			T	T	S			.	.	.	.	.	.						S			.	.	.		G	G	G	T	T	T						.	.			S	S													S	S		S	S				S				T	T	S			B	B				S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.									.	.	.													.	.
Template SS confidence
		73	.	.	.	.	.							.	80	.	.	.	.	.	.				.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.			.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	G	E	I	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	F	T	S	N	L	H	L	D	R	E	A	V	P	A	G	F	E	T	F	K	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	G	E	I	H	V	G	L	G	N	A	N	K	L	L	V	R	F	L	A	G	H	A	E	E	L	D	L	R	L	I	D	F	N	G
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.												.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.												.	.
Template Sequence		A	L	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	P	L	D	F	A	V	F	K	K	H	F	S	V	L	N	.	G	K	Y	V	S	T	R	G	L	D	D	.	.	R	F	G	V	V	A	L	I	E	A	I	K	D	L	V	D	H	E	L	E	G	K	V	I	F	A	F
Template Known Secondary structure				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T													S	.	S	S					T	T				.	.													S	S	G	G	G			S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.												.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.																			.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.		.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.			.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	A	T	I	A	V	A	A	D	K	V	D	V	L	K	S	L	V	N	T	Y	Q	E	I	L	K	N	E	L	A	E	K	E	K	N	L	A	L	L	L	D	S	V	A	N	D	K	A	A	L	I	A	K	S	R	D	T	F	I	R	L	L	N	A	T	P	N	G	V
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	V	Q	E	E	V	G	L	K	G	A	K	F	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S		T	T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	R	N	S	D	V	A	K	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	V	T	M	T	D	N	N	V	E	I	H	C	L	I	R	S	L	I	D	S	G	K	D	Y	V	V	S	M	L	D	S	L	G	K	L	A	G	A	K	T	E	A	K	G	A	Y	P	G	W	Q	P	D	A	N	S	P	V	M	H	L	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	H	Y	Y	P	Q	Y	A	F	A	I	D	S	F	A	C	C	S	P	L	T	G	D	V	.	.	.	.	.	.	.	K	L	G	K	G	P	V	I	R	A	V	D	N	S	A	I	Y	.	.	.	.	S	R	D	L	A	R	K	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T				S	S										S	S	S	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.		T	T	S									S	S		B		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template SS confidence
																					215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.								240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.					.	.	.	260	.	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	T	Y	Q	R	L	F	N	K	T	P	N	I	Q	I	I	H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	K	P	Y	P	E	M	D	M	V	S	I	G	P	T	I	T	G	P	H	S	P	D	E	Q	V	H	I	E	S	V	G	H	Y	W	T	L	L	T	E	L	L	K	E	I
Query Conservation
Alig confidence									.																					.	.	.
Template Conservation									.																					.	.	.
Template Sequence		W	S	I	A	E	K	N	.	G	I	E	I	Q	I	G	V	T	G	G	G	T	D	A	S	A	F	Q	D	.	.	.	R	S	K	T	L	A	L	S	V	P	I	K	Y	L	H	S	E	V	E	T	L	H	L	N	D	L	E	K	L	V	K	L	I	E	A	L	A	F	E	L
Template Known Secondary structure							T	T	.	T									S	S			G	G	G	G	T	T	T	.	.	.	S	S											S	T	T	T	T	T													T	T	S	S	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure									.																					.	.	.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.				.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.