Job Description P15288 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:45 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 391 % Identity 17% Template c1lfwA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:pepv; PDBTitle: crystal structure of pepv Resolution 1.80 Å

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		1	.		.	.	.	.	.				.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30													.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	S	.	E	L	S	Q	L	.	.	.	S	P	Q	P	L	W	D	I	F	A	K	I	C	S	I	P	H	P	S	Y	H	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	A	E	Y	I	V	G	W	A	K	E	K	G	F	H	V	E	R	D	Q	V	G	N	I	L	I	R	K	P	A	T	A	G
Query Conservation				.						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		M	D	L	N	F	K	E	L	A	E	A	K	K	D	A	I	L	K	D	L	E	E	L	I	A	I	D	S	S	E	D	L	E	N	A	T	E	E	Y	P	V	G	K	G	P	V	D	A	M	T	K	F	L	S	F	A	K	R	D	G	F	D	T	E	N	F	A	N	Y	A	G	R	V	N	F	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T	T													T	S			B			G	G	G			S	S	S	T	T																		T	T							T	T	T							.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.		.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure																																							.																																.
Query SS confidence																																							.																																.
Query Sequence		M	E	N	R	K	P	V	V	L	Q	A	H	L	D	M	V	P	Q	K	N	N	D	T	V	H	D	F	T	K	D	P	I	Q	P	Y	I	D	.	G	E	W	V	K	A	R	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	M	A	S	A	L	A	V	L	A	D	E	N	V	.	V	H	G	P	L	E	V	L	L	T
Query Conservation																																							.																																.
Alig confidence																							.	.	.	.	.												.																																.
Template Conservation																							.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	G	D	K	R	L	G	I	I	G	H	M	D	V	V	P	A	G	E	G	.	.	.	.	.	W	T	R	D	P	F	K	M	E	I	D	E	E	G	R	I	Y	G	R	G	S	A	D	D	K	G	P	S	L	T	A	Y	Y	G	M	L	L	L	K	E	A	G	F	K	P	K	K	K	I	D	F	V	L	G
Template Known Secondary structure					S	S										B					S		.	.	.	.	.		S	S		T	T	S					T	T					S	T	T	S	S	S	S																		T				S	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.						.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	T	E	E	A	G	M	D	G	A	F	G	L	Q	G	N	W	L	Q	A	D	I	L	I	N	T	D	S	E	E	E	G	E	I	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.
Template Sequence		T	N	E	E	T	N	W	V	G	I	D	Y	Y	L	K	H	E	P	T	P	D	I	V	F	S	P	D	A	E	Y	P	.	.	I	I	N	G	E	Q	G	I	F	T	L	E	F	S	F	K	N	D	D	T	K	G	D	Y	V	L	D	K	F	K	A	G	I	A	T	N	V	T	P	Q	V	T	R	A	T	I	S
Template Known Secondary structure		S		T	T	T	T											S				S					S	S			S	S	.	.																							S	B									S	B	T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.			.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
																188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	L	H	L	D	R	E	A	V	P	A	G	F	E	T	F	K	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	G	E	I	H	V	G	L	G	N	A	N	K	L	L	V	R	F	L	A	G	H	A	E	E	L	D	L	R	L	I	D	F	N	G	G	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.													.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.													.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	P	D	L	E	A	V	K	L	A	Y	E	S	F	L	A	D	K	E	L	D	G	S	F	E	I	N	D	E	S	A	D	I	V	L	I	G	.	Q	G	A	H	A	S	A	P	Q	V	G	K	.	.	N	S	A	T	F	L	A	L	F	L	D	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S																	T									T	T									.	B			B	T	T		G	G	G	S	B	.	.											T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.													.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.			.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	A	T	I	A	V	A	A	D	K	V	D	V	L	K	S	L	V	N	T	Y	Q	E	I	L	K	N	E	L	A	E	K	E	K	N	L	A	L	L	L	D	S	V	A	N	D	K	A	A	L	I	A	K	S	R	D	T	F	I	R	L	L	N	A	T	P	N	G	V	I	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	A	G	R	D	K	N	F	L	H	F	L	A	E	V	E	H	E	D	F	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B														T	T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																												291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350							.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	S	D	V	A	K	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	.	.	.	.	.	.	V	T	M	T	D	N	N	V	E	I	H	C	L	I	R	S	L	I	D	S	G	K	D	Y	V	V	S	M	L	D	S	L	G	K	L	A	G	A	K	T	E	A	K	G	A	Y	P	G	W	Q	P	D	A	N	S	P	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		G	K	K	L	G	I	F	H	H	D	D	L	M	G	D	L	A	S	S	P	S	M	F	D	Y	E	H	A	G	K	A	S	L	L	N	N	V	R	Y	P	Q	G	T	D	P	D	T	M	I	K	Q	V	L	D	K	F	S	G	.	I	L	D	V	T	Y	N	G	F	E	E	P	H	Y	V	P	G	S	D	P	M
Template Known Secondary structure		S	T	T	T	T						T	T	T														T	T	S												T	T															T	T	.	T						S			B							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.
Query SS confidence																																															.
Query Sequence		M	H	L	V	R	E	T	Y	Q	R	L	F	N	K	T	P	N	I	Q	I	I	H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	K	P	Y	P	E	M	D	M	V	S	I	G	P	T	.	I	T	G	P	H	S	P	D	E	Q	V	H	I	E	S	V	G	H	Y	W	T	L	L	T	E	L	L	K	E	I	P
Query Conservation																																															.
Alig confidence																																		.	.	.											.
Template Conservation																																		.	.	.
Template Sequence		V	Q	T	L	L	K	V	Y	E	K	Q	T	G	K	P	G	H	E	V	V	I	G	G	G	T	Y	G	R	L	F	E	R	.	.	.	G	V	A	F	G	A	Q	P	E	N	G	P	M	V	M	H	A	A	N	E	F	M	M	L	D	D	L	I	L	S	I	A	I	Y	A	E	A	I	Y	E	L	T
Template Known Secondary structure																							S	S			G	G	G	G	S	T	T	.	.	.									T	T					T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.				.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.