Job Description P52048 Confidence 99.91% Date Thu Jan 5 12:05:00 GMT 2012 Rank 76 Aligned Residues 340 % Identity 18% Template c2vz8B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:fatty acid synthase; PDBTitle: crystal structure of mammalian fatty acid synthase Resolution 3.2 Å

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	I	T	D	N	E	L	L	V	S	V	I	S	D	S	V	C	L	S	T	W	K	A	A	L	L	G	S	E	H	K	R	V	P	D	D	L	E	N	H	P	V	I	T	G	H	E	C	A	G	V	I	V	E	V	G	K	N	L	T	G	K	Y	K	K	G	Q	R	F	V	L	Q	P	A	M	G	L	P	S
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	A	S	C	Q	D	R	L	C	S	V	Y	Y	T	S	L	N	F	R	D	V	M	L	A	T	G	K	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	S	I	P	G	K	W	L	T	R	D	C	M	L	G	M	E	F	S	G	R	D	A	S	G	R	R	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	S	T	T	T																			T	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G			S			S		S	S												T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1555	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.												.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Y	S	A	G	Y	S	Y	E	Y	F	G	G	N	A	T	Y	M	I	I	P	E	I	A	I	N	L	G	C	V	L	P	Y	H	G	S	Y	F	A	A	A	S	L	A	E	P	M	C	C	I	I	G	A	Y	H	A	N	Y	H	T	T	Q	Y	V	Y	E	H	R	M	G	V	K	P	G	G	N	I	A	L	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	M	V	P	A	E	G	L	A	T	S	V	L	L	L	Q	H	A	T	W	E	.	.	.	.	V	P	S	T	W	T	L	E	E	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	P	I	V	Y	T	T	A	Y	Y	S	L	V	V	R	G	R	M	Q	P	G	E	S	V	L	I	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.				S	S			S	B	S						G	G	G				.	.	.	.			T	T	S						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T													T	T	T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								1615	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.					.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.											.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	C	A	G	P	M	G	I	G	A	I	D	Y	A	I	N	G	G	I	Q	P	S	R	V	V	V	V	D	I	D	D	K	R	L	A	Q	V	Q	K	L	L	P	V	E	L	A	A	S	K	G	I	E	L	V	Y	V	N	T	K	G	M	S	D	P	V	Q	M	L	R	A	L	T	G	D	A	G	F	D	D	I
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	S	G	G	V	G	Q	A	A	I	A	I	A	L	S	R	G	.	.	.	C	R	V	F	T	T	V	G	S	A	E	K	R	A	Y	L	Q	A	R	F	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	L	D	E	T	C	F	A	N	S	R	D	T	S	F	E	Q	H	V	L	R	H	T	A	G	K	G	V	D	L	V
Template Known Secondary structure			S	S	S													T	T	.	.	.								S													T	T	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T				S	S	S	S									T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1675	.	.	.	.	1680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1690	.	.				.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.	.	.								.	.	.	.	.	1720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1740	.	.	.	.
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.														.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	V	Y	A	A	V	P	A	V	V	E	M	A	D	E	L	L	A	E	D	G	C	L	N	F	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	T	D	K	N	F	K	V	P	F	N	F	Y	N	V	H	Y	N	S	T	H	V	V	G	T	S	G	G	S	T	D	D	M	K	E	A	I	A	L
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.																																																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	S	.	L	A	E	E	K	L	Q	A	S	V	R	C	L	A	Q	H	G	R	F	L	E	I	G	K	F	D	L	S	N	N	H	A	L	G	M	A	V	F	L	K	N	V	T	F	H	G	I	L	L	D	S	L	F	E	E	G	G	A	T	W	Q	E	V	.	.	.	.	.	.	S	E	L	L	K	A	G
Template Known Secondary structure					.											T	T																	T	T					T	T	G	G	G	G	T								T					T	S									.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.																																																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1745	.	.		.	.	1750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1810							.	.	.	.	.	.	.
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.		.	.	.	.	.	.	.	.																				370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	T	G	Q	L	Q	P	S	F	M	V	T	H	I	G	G	L	D	A	V	P	E	T	V	L	N	L	P	D	I	P	G	.	G	K	K	L	I	Y	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	M	P	L	T	A	I	A	D	F	A	E	K	G	K	T	D	P
Query Conservation																																			.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.																								.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.
Template Sequence		I	Q	E	G	V	V	Q	P	.	.	L	K	C	T	V	F	P	R	T	K	V	E	A	A	F	R	Y	M	A	Q	G	K	H	I	G	K	V	V	I	Q	V	R	E	E	E	Q	G	P	A	P	R	G	L	P	P	I	A	L	T	G	L	S	K	T	F	C	P	P	H	K	S	Y	V	I	T	G	G	L	G	G
Template Known Secondary structure			T	T	T		S			.	.								S	S	T										T	T			S	S						S	S					S	S																				T	T							S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure										.	.
Template SS confidence
		1818	.	1820	.	.	.	.	.			.	.	.	.	1830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1890	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.											.	.	.	.	.	.	410	.	.			.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Query Sequence		L	F	K	E	L	A	R	L	V	E	E	T	H	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	N	E	Q	A	E	K	Y	L	.	.	L	A	Q	F	G	V	D	I
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	L	Q	L	A	Q	W	L	R	L	R	G	A	Q	K	L	V	L	T	S	R	S	G	I	R	T	G	Y	Q	A	R	Q	V	R	E	W	R	R	Q	G	V	Q	V
Template Known Secondary structure													T	T									S	S				S													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1896	.	.	.	1900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1930	.	.	.	.	.	.	.	.	.